Orientador: Alexandre Magno Sebbenn / Co-orientador: Miguel Luiz Menezes Freitas / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Banca: João Antonio da Costa Andrade / Banca: Ana Aparecida Bandini Rossi / Banca: Rinaldo Cesar de Paula / Resumo: Genipa americana L., popularmente conhecida como jenipapo, é uma espécie arbórea neotropical cuja sobrevivência encontra-se ameaçada devido aos processos de destruição, fragmentação e degradação de seus ambientes naturais. Visando contribuir para a conservação in situ e ex situ dessa espécie, o objetivo deste trabalho foi investigar a diversidade genética, a estrutura genética espacial intrapopulacional (EGE), o sistema de reprodução e o fluxo gênico contemporâneo de G. americana em um pequeno remanescente florestal (7,2 ha) localizado na Mata da Figueira, na Estação Ecológica de Mogi-Guaçu, Mogi-Guaçú (SP). Na população estudada foram encontradas 188 árvores adultas e sementes foram colhidas e amostradas hierarquicamente entre e dentro de frutos diretamente da copa de 15 árvores matrizes em dois eventos reprodutivos consecutivos. Trinta e dois locos microssatélites foram desenvolvidos e validados em 40 indivíduos de G. americana. Destes, dezessete foram polimórficos, revelando de três a sete alelos por loco. Utilizando os genótipos das árvores-matrizes e progênies, foi investigada a herança mendeliana, ligação genética e o desequilíbrio genotípico de seis locos isolados de G. americana, não sendo detectado desequilíbrio genotípico. No entanto, foram detectados desvios significativos da segregação mendeliana em 20,4% e 36,7% e ligação genética entre os locos em 53% e 68% dos testes realizados nos eventos reprodutivos de 2010 e 2011, respectivamente. A riqueza alélica média dos adultos foi de 8,8, para os juvenis de 7,0 e para as sementes de 2010 e 2011, de 7,2 e 8,4, respectivamente. A heterozigosidade média esperada para os adultos foi de 0,581, para os juvenis de 0,568 e para as sementes de 2010 e 2011, de 0,576 e 0,735, respectivamente. A heterozigosidade média observada para os adultos foi de 0,499, juvenis de 0,356 e sementes de 2010 e 2011, 0,476 e 0,542, respectivamente. O índice ... / Abstract: Genipa americana L., popularly known as jenipapo is a neotropical tree species whose survival is threatened due to the processes of destruction, fragmentation and degradation of their natural habitats. To contribute to the conservation in situ and ex situ this species, the objective of this study was to investigate the genetic diversity, intrapopulation spatial genetic structure (SGS), the mating system and contemporary gene flow of G. americana in a small remnant forest (7.2 ha) located in the Mata da Figueira, in Mogi Guaçu Ecological Station, Mogi Guaçú (SP). In the population studied we found 188 adult trees and seeds were collected and sampled hierarchically within and among fruits directly from the tree canopy of 15 seed-trees on two consecutive reproductive events. Thirty-two microsatellite loci were developed and validated in 40 individuals of G. americana. Of these, seventeen were polymorphic, revealing of three to seven alleles per locus. Using the genotypes os seed-trees and progenies, was investigated Mendelian inheritance, genetic linkage and genotypic disequilibrium of six loci isolated of G. americana, not detecting genotypic disequilibrium. However, significant deviations from Mendelian segregation were found in 20.4% and 36.7 and genetic linkage between the loci in 53% and 68% of the tests performed in the reproductive events of 2010 and 2011, respectively. The average allelic richness of adults was of 8.8, for juvenile of 7.0 and seeds of 2010 and 2011, 7.2 and 8.4, respectively. The average expected heterozygosity for adults was of 0.581, for juvenile of 0.568 and seeds of 2010 and 2011, 0.576 and 0.735, respectively. The average observed heterozygosity for adults was of 0.499, for juvenile of 0.356 and seeds of 2010 and 2011, 0.476 and 0.542, respectively. The average fixation index was significantly different from zero for all samples, suggesting the occurrence of inbreeding. The multilocus crossing rate ( t m ) in ... / Doutor

Orientador: Mario Luiz Teixeira De Moraes Moraes / Coorientador: Ana Veruska Cruz da Silva / Banca: Alexandre Magno Sebbenn / Banca: Celso Luis Marino / Banca: Bruno Cesar Rossini / Banca: Evandro Vagner Tambarussi / Resumo: Estudos sobre ecologia e genética de populações são fundamentais para entender os efeitos da fragmentação sobre espécies florestais. Um estudo baseado em genética quantitativa e marcadores microssatélites foi realizado para investigar a diversidade genética, estrutura genética espacial, sistema de reprodução e a dispersão de pólen em uma população natural e em um teste de progênies de Genipa americana L. para fins de conservação e melhoramento genético. As coletas foram realizadas em duas populações: a primeira localizada no nordeste do Brasil, em uma área de transição entre a Mata Atlântica e a Caatinga (POP-SE) e a segunda no sudeste, em um Banco Ativo de Germoplasma estabelecido em área de transição entre a Mata Atlântica representada pela Florestal Estacional Semidecidual e o Cerrado (POP-SP). Foram coletados tecidos foliares de 30 árvores matrizes e 20 plantas/progênie em cada uma das populações. As análises do sistema de reprodução foram realizadas com base no modelo misto de reprodução e modelo de cruzamentos correlacionados. Como esperado em espécies dióicas, todas as progênies foram originadas de cruzamento (tm = 1). A taxa de cruzamento entre parentes (tm - ts) e a correlação de paternidade (rp) foram variáveis entre famílias (tm - ts= 0,03-0,19; rp= 0,04-0,40). O índice de fixação (F) foi significativamente menor em adultos que em progênies, indicando seleção contra indivíduos endogâmicos. A correlação de paternidade dentro de frutos (0,40) foi maior que entre ... / Abstract: Studies about ecology and population genetics are essential to understand the effects of fragmentation on forest species. A study based on quantitative genetics and microsatellite markers was conducted to investigate the genetic diversity, spatial genetic structure, mating system and pollen dispersal in a natural population and onan progenies test of Genipa americana L. aiming conservation and breeding. Samples were collected in two populations: the first located in the northeast of Brazil, in a transition area between the Atlantic Forest and Caatinga (POP-SE) and the second in the southeast, in an Active Germplasm Bank established in area transition between the Atlantic represented by Forest Semideciduous and the Cerrado (POPSP). Leaf tissues were collected from 30 seed-trees and 20 plants/progeny in each of the populations. The analysis of the mating system were performed based on the mixed mating model and correlated crosses model. As expected in dioecious species, all offspring were originated from outcrossing ( m t = 1). The mating among relatives rate ( m s t t ) and paternity correlation ( p r ) were variable among families ( m s t t = 0.03-0.19; p r = 0.04-0.40), especially in NP. Fixation index ( F ) was generally significant lower in the adults than offspring, indicating selection against inbreed individuals. The paternity correlation within fruits (0.40) was higher than among fruits (0.26), indicating that lower effective number of pollen donors ( ep N ) within fruit (2.5) than among fruits (3.8). Due to the highest p r in NP, the effective size within families ( e N ) was lower in NP (2.69) than PT (3.27). The Spearman ranking correlation showed that the increase in ep N increase the genetic diversity and e N within families. The pollen dispersal pattern was strongly leptokurtic, suggesting long pollen dispersal distance (mean= 179 m). ... / Doutor

Made available in DSpace on 2015-05-14T16:53:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-12-12Bitstream added on 2015-05-14T16:58:59Z : No. of bitstreams: 1 000826564.pdf: 1316430 bytes, checksum: 3e3722dfa54f8e9617ce84d42c56ae16 (MD5) / Genipa americana L., popularmente conhecida como jenipapo, é uma espécie arbórea neotropical cuja sobrevivência encontra-se ameaçada devido aos processos de destruição, fragmentação e degradação de seus ambientes naturais. Visando contribuir para a conservação in situ e ex situ dessa espécie, o objetivo deste trabalho foi investigar a diversidade genética, a estrutura genética espacial intrapopulacional (EGE), o sistema de reprodução e o fluxo gênico contemporâneo de G. americana em um pequeno remanescente florestal (7,2 ha) localizado na Mata da Figueira, na Estação Ecológica de Mogi-Guaçu, Mogi-Guaçú (SP). Na população estudada foram encontradas 188 árvores adultas e sementes foram colhidas e amostradas hierarquicamente entre e dentro de frutos diretamente da copa de 15 árvores matrizes em dois eventos reprodutivos consecutivos. Trinta e dois locos microssatélites foram desenvolvidos e validados em 40 indivíduos de G. americana. Destes, dezessete foram polimórficos, revelando de três a sete alelos por loco. Utilizando os genótipos das árvores-matrizes e progênies, foi investigada a herança mendeliana, ligação genética e o desequilíbrio genotípico de seis locos isolados de G. americana, não sendo detectado desequilíbrio genotípico. No entanto, foram detectados desvios significativos da segregação mendeliana em 20,4% e 36,7% e ligação genética entre os locos em 53% e 68% dos testes realizados nos eventos reprodutivos de 2010 e 2011, respectivamente. A riqueza alélica média dos adultos foi de 8,8, para os juvenis de 7,0 e para as sementes de 2010 e 2011, de 7,2 e 8,4, respectivamente. A heterozigosidade média esperada para os adultos foi de 0,581, para os juvenis de 0,568 e para as sementes de 2010 e 2011, de 0,576 e 0,735, respectivamente. A heterozigosidade média observada para os adultos foi de 0,499, juvenis de 0,356 e sementes de 2010 e 2011, 0,476 e 0,542, respectivamente. O índice ... / Genipa americana L., popularly known as jenipapo is a neotropical tree species whose survival is threatened due to the processes of destruction, fragmentation and degradation of their natural habitats. To contribute to the conservation in situ and ex situ this species, the objective of this study was to investigate the genetic diversity, intrapopulation spatial genetic structure (SGS), the mating system and contemporary gene flow of G. americana in a small remnant forest (7.2 ha) located in the Mata da Figueira, in Mogi Guaçu Ecological Station, Mogi Guaçú (SP). In the population studied we found 188 adult trees and seeds were collected and sampled hierarchically within and among fruits directly from the tree canopy of 15 seed-trees on two consecutive reproductive events. Thirty-two microsatellite loci were developed and validated in 40 individuals of G. americana. Of these, seventeen were polymorphic, revealing of three to seven alleles per locus. Using the genotypes os seed-trees and progenies, was investigated Mendelian inheritance, genetic linkage and genotypic disequilibrium of six loci isolated of G. americana, not detecting genotypic disequilibrium. However, significant deviations from Mendelian segregation were found in 20.4% and 36.7 and genetic linkage between the loci in 53% and 68% of the tests performed in the reproductive events of 2010 and 2011, respectively. The average allelic richness of adults was of 8.8, for juvenile of 7.0 and seeds of 2010 and 2011, 7.2 and 8.4, respectively. The average expected heterozygosity for adults was of 0.581, for juvenile of 0.568 and seeds of 2010 and 2011, 0.576 and 0.735, respectively. The average observed heterozygosity for adults was of 0.499, for juvenile of 0.356 and seeds of 2010 and 2011, 0.476 and 0.542, respectively. The average fixation index was significantly different from zero for all samples, suggesting the occurrence of inbreeding. The multilocus crossing rate ( t m ) in ...