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Lipid rafts of platelet membrane as therapeutic target : role of "Omics" / Radeaux lipidiques des membranes de plaquettes comme cible thérapeutique : rôle des "Omics"Rabani, Vahideh 05 May 2017 (has links)
Les plaquettes sont des cellules sanguines anucléées impliquées dans les phénomènes d'hémostase et de thrombose. La majorité des fonctions plaquettaires dépend de leur membrane cellulaire, qui contient de nombreux microdomaines lipidiques ordonnés appelés radeaux lipidiques. Ces microdomaines jouent un rôle central dans toutes les phases de l'hémostase médiées par les plaquettes. Les radeaux lipidiques sont essentiels pour le fonctionnement des récepteurs responsables de l'activation des plaquettes et de la transduction du signal. Le rôle des plaquettes dans la thrombose artérielle est crucial et explique l'intérêt continu de la recherche dans la thérapie antiplaquettaire. Dans ce contexte, nous avons cherché à étudier les radeaux lipidiques comme lieu d'assemblage principal des récepteurs membranaires. Nous avons également cherché à identifier des protéines impliquées dans la fonction des plaquettes, en vue de proposer de nouvelles cibles thérapeutiques. Nous avons utilisé des analyses lipidomiques et protéomiques ainsi que des analyses d'immunoblotting pour identifier les radeaux lipidiques de la membrane des plaquettes et étudier leur organisation dans les plaquettes non stimulées, stimulées et traitées par des antiagrégants plaquettaires. Des détergents, l'ultracentrifugation et les gradients de sucrase ont été utilisés principalement pour le fractionnement de la membrane et l'isolement des radeaux lipidiques. Les principaux résultats de notre travail sont: 1) Élaboration d'une méthodologie pour l'étude des radeaux lipidiques des plaquettes ; 2) Présentation d'un profil global de la composition lipidique et protéique des radeaux lipidiques ; 3) Démonstration de l'impact de l'activation plaquettaire et des antiagrégants plaquettaires sur la réorganisation des radeaux lipidiques ; Et 4) Proposition de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles par protéomique et identification de réseau interactif de protéines autour notamment du facteur XIII (FXIII) et de la phosphoprotéine stimulée par vasodilatateur (V ASP). Nos résultats montrent que les radeaux lipidiques peuvent potentiellement être considérés comme nouvelles cibles thérapeutiques pour la découverte de nouveaux antiagrégants plaquettaires. Les études "Omics" sont importantes pour élargir nos connaissances dans ce domaine / Latelets are blood ce lis at the crossroads of both haemostasis and thrombosis. The majority of platelet functions depend on their membrane, which contains numerous, ordered lipid microdomains named lipid rafts. These microdomains play a pivotai role in all phases of plateletmediated haemostasis. Lipid rafts are a prerequisite for the functioning of receptors in charge of platelet activation and signal transduction. The role of platelets in thrombotic diseases is crucial, and underpins the continue research interest in antiplatelet therapy. ln this context, we aimed to study the lipid rafts of platelet membranes as the principal assembly place of known receptors, and likely also other, unknown elements that participate in the thrombotic function of platelets, with a view to proposing new therapeutic targets. We used lipidomics and proteomics as well as immunoblot analysis to identify lipid rafts and investigate the organization of lipid rafts in resting, stimulated and antiplatelet-treated platelets. Detergents, ultracentrifugation and sucrose gradients were used mainly for membrane fractionatio and isolation of lipid rafts. The main findings of our work are: 1) Development of a framework or guidelines for platelet lipid raft investigation; 2) Presentation of a global profile of the lipid and protein composition of plate let lipid rafts; 3) Demonstration of the impact of activators and inhibitors on the reorganization of platelet lipid rafts; and 4) Suggestion for potential new therapeutic targets by proteomics analysis through interactive network analyzing of coagulation factor XIII (FXIII) and Vasodilator-Stimulated Phosphoprotein (VASP). Our results show that lipid rafts have potential as new therapeutic targets in pharmacological research in antiplatelets. "Omics" studies are important to expand our knowledge in this field
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Functional study of oil assembly pathway in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) fruits / Etude de l’assemblage des acides gras en huile chez le palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.)Yuan, Yijun 21 December 2016 (has links)
Le palmier à huile est la première culture oléagineuse, avec environ 40% de la production mondiale, et son fruit accumule deux huiles de composition très différente dans le mésocarpe et l’amande. Chez les plantes, les acides gras sont assemblés en huile dans le réticulum endoplasmique, ceci par la voie dite de Kennedy à laquelle s’ajoutent des mécanismes d’édition impliquant le métabolisme de la phosphatidylcholine. Nous avons utilisé les outils de la lipidomique pour analyser la variabilité au sein de différentes populations de palmier ainsi que pour caractériser l’accumulation d’huile durant le développement du mésocarpe et de l’amande. Puis, nous avons entrepris de tester, dans le système du double hybride de levure, les interactions entre toutes les enzymes de la voie de Kennedy et celles responsables des mécanismes d’édition, et mis en évidence 241 interactions, dont 132 sont fortes, 73 moyennes et 36 faibles. Ces résultats suggèrent que ces enzymes pourraient s’assembler en complexes supra-moléculaires susceptibles de former des métabolons. Certaines isoformes d’une même enzyme ont des profils d’interaction distincts, ce qui ouvre des perspectives pour de futures recherches. De plus, nous avons caractérisé, par expression fonctionnelle dans un mutant de levure dépourvu de TAG, une acyltransférase présumée (EgWSD1-like) ainsi que les trois formes majeures de diacylglycérol acyltransférases du mésocarpe. EgWSD1-like ne restaure que l’activité de synthèse d’esters de cire dans le mutant, tandis que les trois DGAT complémentent toutes la déficience en TAG du mutant, avec d’apparentes spécificités distinctes vis-à-vis des acides gras. / Oil palm is the highest oil-yielding crop-plant, accounting for approximately 40% of the total world vegetable oil production. The fruit accumulates oil, made of triacylglycerol (TAG) molecules, in both mesocarp and kernel with totally different fatty acid profiles. Fatty acids are assembled into oil through Kennedy pathway in the endoplasmic reticulum, which is complicated by editing processes involving phosphatidylcholine metabolism. To investigate oil assembly in oil palm, we use lipidomics as a tool to analyze different populations of palm to search for TAG structural diversity, and to further characterize changes in lipid content and composition in mesocarp and kernel during fruit ripening. We used yeast two-hybrid system (split ubiquitin) to test protein-protein interactions for almost all the enzymes (32) involved in oil assembly pathway, and we demonstrated 241 interactions, including 132 strong interactions, 73 medium interactions and 36 weak interactions. Our results suggest that all enzymes might assemble into one or several complexes that may form metabolons. In addition, different isoforms of enzymes showed distinct interaction profiles, providing hints for future studies. Moreover, we also characterized the in vivo function of a putative acyltransferase (designated EgWSD1-like) possibly involved in oil assembly and the three major diacylglycerol acyltransferase (DGAT) isoforms of palm mesocarp in the mutant yeast H1246, which is devoid of neutral lipid synthesis. EgWSD1-like only shows wax ester synthase activity in yeast, while three EgDGATs all can restore TAG biosynthesis in yeast with different substrate specificities.
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