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Caractérisations biochimiques et biologiques des collagènes de méduses / Biochemical and biological characterizations of jellyfish collagens

Addad, Sourour 06 January 2010 (has links)
Ce travail a été entrepris dans le but de caractériser biochimiquement et biologiquement les collagènes de méduse. l’objectif de notre travail a été d’évaluer ce matériel en vue de sa valorisation pour l’élaboration de biomatériaux à usage médical. dans un premier temps, nous avons optimisé les techniques d’extractions des collagènes de quatre espèces de méduses : rhizostoma pulmo, cotylorhiza tuberculata, pelagia noctiluca et aurelia aurita. l’étude de la stabilité thermique par dichroïsme circulaire des collagènes nous a montré que la température de dénaturation des collagènes de rhizostoma pulmo était de 28,9°c. nous avons choisi de réaliser la réticulation des collagènes de méduse par la méthode des carbodiimides (edc/nhs). cette méthode nous a permis d’augmenter la température de dénaturation jusqu’à 33°c (versus 28,9°c). l’étude de l’interaction entre les cellules d’origine humaine (mg63 et fibroblastes) et les collagènes de méduses, nous a permis de démontrer qu’elles étaient capables d’adhérer aux collagènes de méduses natifs ou dénaturés. des immunomarquages de la vinculine des cellules mg63 et des fibroblastes sur collagènes de méduse natifs ou dénaturés nous ont permis de caractériser les adhésions mises en places par ces deux types cellulaires. l’analyse des milieux de culture des cellules mg63 et des fibroblastes par zymographie sur collagènes de méduse natifs ou dénaturés nous a permis de mettre en évidence que des mmps d’origine humaine, seraient capables de dégrader les collagènes de méduses. nous pouvons dans ce cas estimer que le collagène de méduse serait un bon substrat pour l’élaboration de biomatériaux résorbables / This work was undertaken to characterize biochemically and biologically jellyfish collagen. the aim of our study was to evaluate the material for the development of biomaterials for medical use. initially, we optimized the technical extraction of collagen from four species of jellyfishes: rhizostoma pulmo, cotylorhiza tuberculata, pelagia noctiluca and aurelia aurita. the study of thermal stability by circular dichroism of collagen has shown that the denaturation temperature of rhizostoma pulmo collagens was 28.9 ° c. we chose to achieve crosslinking of collagen of jellyfish by the method of carbodiimides (edc/nhs). this method allowed us to increase the denaturation temperature to 33 ° c (vs. 28.9 ° c). the study of the interaction between human cells (mg63 and fibroblasts) and jellyfish collagen, demonstrated that they were able to adhere native or denatured jellyfish collagen. the immunostains of vinculin of mg63 cells and fibroblasts seeded on native or denatured jellyfish collagen, allowed us to characterize the focal adhesions of these two cell types. analysis of culture media of mg63 cells and fibroblasts by collagen zymography on native or denatured jellyfish collagen gels, allowed us to demonstrate that mmps of human origin, are able to degrade jellyfish collagen. we estimate in this case that the jellyfish collagen is a good substrate for the development of resorbable biomaterials
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Modélisation numérique de la circulation côtière : application au transport des méduses dans les Pertuis Charentais / Numerical modeling of coastal circulation : application to the jellyfish transport in the Pertuis Charentais

Chalumeau, Julien 28 January 2014 (has links)
Les Pertuis Charentais sont un site d’écosystèmes interconnectés où les courants marins jouent un rôle déterminant. Un modèle de marée à haute résolution a été développé au cours de cette thèse pour comprendre et cartographier les traits principaux de la circulation hydrodynamique dans les Pertuis. Deux axes sont ainsi mis en avant dans cette étude. D’abord, un nouveau modèle de marées dans les Pertuis Charentais a été construit et validé à partir de différentes sources : données marégraphiques, données de courantomètres ADCP et images satellitaires. Une nouvelle approche de calibration de modèle de marée a été développée, basée sur la comparaison de la position de la ligne d’eau, frontière entre l’eau et la terre, avec celle prédite par le modèle. Puis dans un second temps, le transport et les agrégations en « bloom » de populations de méduses Rhizostoma, dont les proliférations et les échouages sont à l’origine de problèmes socio-économiques, ont été simulés numériquement. Des observations in situ ont permis de paramétrer le comportement de nage des méduses dans le modèle. Deux types de comportements des méduses, actif et passif ont été simulés. Les courants de marées en présence des forçages-type météorologiques ont été pris en compte. Les résultats indiquent que le comportement individuel de nage des méduses pourrait être une réponse adaptative aux facteurs abiotiques qui menacent la continuité de leur espèce mais que les courants marins restent la cause première de la formation des blooms. / The Pertuis Charentais are an interconnected ecosystems site where ocean currents play a key role. A high resolution tidal model was developed in this thesis in order to understand the main features of the hydrodynamic flows inside the Pertuis. Two topics were put forward in this study. First, a new tide model for the Pertuis Charentais was build up and validated by using different datasets: tide gauge records, measurements of currents by ADCP and satellite images. A new approach to model calibration was developed by comparing the observed position of the waterline, the boundary between land and water, with that predicted by the model. Secondly, the transport and bloom-like aggregation of the Rhizostoma jellyfish populations were simulated numerically. The jellyfish proliferation and stranding are a source of socio-economic problems. Two types of jellyfish behavior, active and passive were simulated. The tidal currents and typical meteorological forcing were taken into account. The results show that the individual behavior of swimming jellyfish is an adaptive response to abiotic factors for jellyfish survival.

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