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Phospho-regulation of the spindle assembly checkpointSen, Onur January 2016 (has links)
Mitosis is a highly regulated process by which a cell duplicates and distributes its chromosomal DNA into two identical daughter cells equally. Equal distribution of the chromosomes is crucial for accurate propagation of genetic information. This is essential for maintaining viability and preventing genomic instability that can potentially lead to cancer. In order to avoid unequal distribution of chromosomes, cells employ a surveillance mechanism called the spindle assembly checkpoint (SAC). The SAC is an inhibitory signalling network, which delays segregation of chromosomes, until they have stably attached to spindle microtubules through their multi-protein platforms, known as kinetochores. The main target of the SAC is the anaphase promoter complex/ cyclosome (APC/C), an E3 ubiquitin ligase. Specifically APC/C and its activator Cdc20 are inhibited by the main effector of the SAC, called the mitotic checkpoint complex (MCC). The MCC consists of Cdc20, Mad2, Mad3 and Bub3 (except S. pombe) proteins, which are recruited to the unattached kinetochores to promote MCC assembly. Once the chromosomes stably attach to the spindle, the SAC is turned off, MCC disassembles, and APC/CCdc20 is released from the inhibition. Activated APC/CCdc20 then targets its two main substrates, securin and cyclin B, for proteasomal degradation, and thereby triggers anaphase onset and mitotic exit. SAC signalling involves many protein components, whose activities are essentially regulated by direct protein-protein interactions and/ or post-translational modifications. One of these major modifications is phosphorylation, which is mediated by the SAC kinases such as Aurora B, Mps1 and Bub1. A number of studies have characterised SAC related substrates of Aurora B and Mps1 kinases in several model organisms. On the other hand, Bub1 kinase activity has been thought to play a key role in chromosome bi-orientation and more of an auxiliary role in SAC activation. The aim of this study is to investigate the importance of Bub1 kinase activity for SAC response in fission yeast Schizosaccharomyces pombe (S. pombe). SAC activation assays, using various degrees of spindle perturbation, have demonstrated that Bub1 kinase activity plays an important role in SAC maintenance. In order to examine the pathways downstream of Bub1, we set out to indicate Bub1 substrates which may be involved in SAC signalling. According to studies in various species, Cdc20 appears to be a prominent candidate, whose phosphorylation by Cdk1 and Bub1 kinases has been reported to regulate its mitotic activity. To investigate whether Cdc20 is phosphorylated by Bub1 in vitro, we purified recombinant S. pombe proteins from insect cells. Subsequent kinase assays identified Cdc20 as an in vitro substrate of Bub1, and the phosphorylated sites in Cdc20 were mapped by mass spectrometry. To address if this phospho-modification is involved in SAC regulation, phosphorylation mutants of Cdc20 were analysed in terms of their abilities to activate and silence SAC in vivo. Results show that phosphorylation of Cdc20 C-terminus promotes SAC maintenance in response to spindle damage. Furthermore, the mutations mimicking Bub1-mediated phosphorylation of Cdc20 Cterminus restore the SAC defects in the absence of Bub1 kinase activity. In addition, we purified S. pombe mitotic checkpoint complex (MCC) from insect cells, and analysed the interactions between its components (Cdc20, Mad2 and Mad3) by cross-linking mass spectrometry. Crystal structure of S.pombe MCC has been determined recently, which lacks Mad3 C-terminus and flexible C-terminal tail of Cdc20. Using an MCC with full length Mad3, we identified novel interactions between the C-terminal tails Mad3 and Cdc20, which are in close proximity to the identified Cdc20 phosphorylation sites. Briefly, in this study we confirm the previously known roles of Bub1 kinase activity (chromosome bi-orientation). Moreover, we propose a new pathway (in addition to the well-established H2A pathway) mediated by Cdc20, that may be important to maintain the SAC response.
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A concurrent engineering approach to design for assembly with manufactuirng cost constraintIkonopisov, Anthony January 1998 (has links)
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Mécanismes de l'extension continentale au Mésozoïque en Asie de l'Est / Mechanisms of Mesozoic continental extension in East AsiaCharles, Nicolas 01 December 2010 (has links)
La lithosphère continentale peut s’étirer selon trois modes (rift large, rift étroit et Core Complex). En Asie de l’Est, une extension continentale a eu lieu de la fin du Mésozoïque au Cénozoïque et ne semble correspondre à aucun des trois modes actuellement définis. Cette période est caractérisée par un amincissement lithosphérique exceptionnel (>100 km), la présence de MCC, de bassins sédimentaires et une importante activité magmatique. Basé sur une approche multi-échelles, ce travail vise à mieux comprendre les mécanismes à l’origine de cette déformation lithosphérique (jamais abordés) ainsi que du moteur de l’extension (encore vivement discuté). Pluridisciplinaire, cette étude apporte de nouvelles contraintes à partir de l’analyse de la déformation finie (ductile ou fragile), du magnétisme des roches (ASM, paléomagnétisme), de la géochronologie (U/Pb sur zircon et 40Ar/39Ar sur monograins) et de la gravimétrie. Différents objets reconnus, révélant des quantités d’extension différentes (MCC vs. pluton cisaillé), montrent que la croûte continentale se déforme de manière très localisée, par la mise en place de larges dômes extensifs séparant des domaines de « radeaux » ou « boudins » présentant une déformation faible à nulle. Par comparaison des données crustales et mantelliques (tomographie sismique, géochimie) disponibles, cette étude met en évidence que l’amincissement lithosphérique reconnu pour le Mésozoïque est principalement lié à un important flux thermique du manteau, l’extension n’ayant qu’un rôle limité dans cet amincissement (<20%). En outre, eu égard au gradient géothermique exceptionnellement élevé de la région, à la fin du Mésozoïque, il semble très probable que des MCC puissent s’être développés sans épaississement préalable de la croûte. L’analyse comparée des directions d’étirement dans la croûte et dans le manteau met en évidence le rôle majeur de la subduction des panneaux plongeants le long de la marge est-asiatique. Un modèle géodynamique a été proposé montrant le rôle du retrait successif des panneaux plongeants couplé à un phénomène d’érosion thermique de la lithosphère. / Continental lithosphere can be stretched according to three modes (wide rift, narrow rift, Core Complex). In East Asia, a continental extension occurred during the Late Mesozoic to Cenozoic times and seems to do not correspond to any of three modes currently defined. This period is characterised by an exceptional lithospheric thinning (> 100 km) with the presence of MCC, sedimentary basins and a huge magmatic activity. Based on a multi-scale approach, this work aims to better understand the mechanisms of this lithospheric deformation (never addressed) and the engine of the extension (yet highly debated). This study provides new multidisciplinary constraints from the analysis of finite strain (ductile or brittle), rock magnetism (AMS, palaeomagnetism), geochronology (U/Pb on zircon and 40Ar/39Ar on single crystals) and gravity. Different objects have been recognised, revealing different amounts of extension (MCC vs. sheared pluton), and show that the continental crust is locally highly deformed, with emplacements of large MCCs between "rafts" or "boudins" domains which are weakly strained to unstrained. By comparison of available crustal and mantle data (seismic tomography, geochemistry), this study shows that the lithospheric thinning recognised for the Mesozoic is mainly related to a major mantle heat flux, the extension plays a limited role in this thinning (<20%). In addition, given the exceptional high geothermal gradient in the region at the end of the Mesozoic, it seems very likely that MCC may have developed without pre-thickened crust. Comparative analysis of stretching directions within the crust and mantle highlights that the subduction of the (palaeo) Pacific plate along the East Asian margin may play an initial and major role during Late Mesozoic extensional event. A geodynamic model has been proposed to show the role of the successive retreat of subducting slabs coupled to a thermal erosion of the lithosphere.
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Mécanismes de l'extension continentale au Mésozoïque en Asie de l'EstCharles-Moreau, Nicolas 01 December 2010 (has links) (PDF)
La lithosphère continentale peut s'étirer selon trois modes (rift large, rift étroit et Core Complex). En Asie de l'Est, une extension continentale a eu lieu de la fin du Mésozoïque au Cénozoïque et ne semble correspondre à aucun des trois modes actuellement définis. Cette période est caractérisée par un amincissement lithosphérique exceptionnel (>100 km), la présence de MCC, de bassins sédimentaires et une importante activité magmatique. Basé sur une approche multi-échelles, ce travail vise à mieux comprendre les mécanismes à l'origine de cette déformation lithosphérique (jamais abordés) ainsi que du moteur de l'extension (encore vivement discuté). Pluridisciplinaire, cette étude apporte de nouvelles contraintes à partir de l'analyse de la déformation finie (ductile ou fragile), du magnétisme des roches (ASM, paléomagnétisme), de la géochronologie (U/Pb sur zircon et 40Ar/39Ar sur monograins) et de la gravimétrie. Différents objets reconnus, révélant des quantités d'extension différentes (MCC vs. pluton cisaillé), montrent que la croûte continentale se déforme de manière très localisée, par la mise en place de larges dômes extensifs séparant des domaines de " radeaux " ou " boudins " présentant une déformation faible à nulle. Par comparaison des données crustales et mantelliques (tomographie sismique, géochimie) disponibles, cette étude met en évidence que l'amincissement lithosphérique reconnu pour le Mésozoïque est principalement lié à un important flux thermique du manteau, l'extension n'ayant qu'un rôle limité dans cet amincissement (<20%). En outre, eu égard au gradient géothermique exceptionnellement élevé de la région, à la fin du Mésozoïque, il semble très probable que des MCC puissent s'être développés sans épaississement préalable de la croûte. L'analyse comparée des directions d'étirement dans la croûte et dans le manteau met en évidence le rôle majeur de la subduction des panneaux plongeants le long de la marge est-asiatique. Un modèle géodynamique a été proposé montrant le rôle du retrait successif des panneaux plongeants couplé à un phénomène d'érosion thermique de la lithosphère.
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Vem är Troy Perry? : En uppsats om homosexuell befrielseteologiFrejdig, Liselotte January 2006 (has links)
<p>In this essay I plan to mainly write about the Christian church. However, I will shortly mention other parishes.</p><p>In the first part I will in the first chapter write how the church saw earlier on HBLT (Homo-, Bisexual, Lesbians and Transgender) people. In the second chapter how the situation is today and finally in the third chapter I will try to see how the situation is in the future in both in a positive and negative aspect.</p><p>In the second part I will write about Troy Perry, the founder of M.C.C. Metropolitan Community Churches). In the first chapter I will write shortly about when he was growing up, in the second about his vocation to become a minister and in the third chapter about his founding of M.C.C.</p><p>In the third and last part I will in the first chapter write about the first years, in the second chapter about how it is today and in the third and last chapter what the elders in the church sees how the future will look like.</p><p>My main question is to see if M.C.C. is needed even in the future.</p> / <p>I denna uppsats tänker jag skriva om den framför allt kristna kyrkan. Även om jag kommer att beröra andra församlingar i texten, först och främst islam.</p><p>I den första delen tänker jag i första avsnittet skriva om hur kyrkan har sett på HBT (Homo-, Bisexuella och Transpersoner). I det andra avsnittet hur det ser ut i dag. I det tredje avsnittet hur det kan komma att se ut i framtiden. Både vad jag tror och vad jag hoppas. Kursivering betyder att ordet finns i ordförklaringarna.</p><p>I den andra delen tänker jag skriva om Troy Perry (M.C.C.’s grundare). I första delen berättar jag lite om hans uppväxt. Andra avsnittet om hans kallelse till präst och i det tredje när han grundar M.C.C. (Metropolitan Comunity Churches)</p><p>I den sista och tredje och sista delen tänker jag i första avsnittet skriva om M.C.C. och kyrkans första tid I andra avsnittet hur det ser ut i dag och slutligen i det tredje avsnittet hur kyrkans ledning ser på framtiden.</p><p>Min frågeställning är om M.C.C. behövs även i framtiden.</p>
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Vem är Troy Perry? : En uppsats om homosexuell befrielseteologiFrejdig, Liselotte January 2006 (has links)
In this essay I plan to mainly write about the Christian church. However, I will shortly mention other parishes. In the first part I will in the first chapter write how the church saw earlier on HBLT (Homo-, Bisexual, Lesbians and Transgender) people. In the second chapter how the situation is today and finally in the third chapter I will try to see how the situation is in the future in both in a positive and negative aspect. In the second part I will write about Troy Perry, the founder of M.C.C. Metropolitan Community Churches). In the first chapter I will write shortly about when he was growing up, in the second about his vocation to become a minister and in the third chapter about his founding of M.C.C. In the third and last part I will in the first chapter write about the first years, in the second chapter about how it is today and in the third and last chapter what the elders in the church sees how the future will look like. My main question is to see if M.C.C. is needed even in the future. / I denna uppsats tänker jag skriva om den framför allt kristna kyrkan. Även om jag kommer att beröra andra församlingar i texten, först och främst islam. I den första delen tänker jag i första avsnittet skriva om hur kyrkan har sett på HBT (Homo-, Bisexuella och Transpersoner). I det andra avsnittet hur det ser ut i dag. I det tredje avsnittet hur det kan komma att se ut i framtiden. Både vad jag tror och vad jag hoppas. Kursivering betyder att ordet finns i ordförklaringarna. I den andra delen tänker jag skriva om Troy Perry (M.C.C.’s grundare). I första delen berättar jag lite om hans uppväxt. Andra avsnittet om hans kallelse till präst och i det tredje när han grundar M.C.C. (Metropolitan Comunity Churches) I den sista och tredje och sista delen tänker jag i första avsnittet skriva om M.C.C. och kyrkans första tid I andra avsnittet hur det ser ut i dag och slutligen i det tredje avsnittet hur kyrkans ledning ser på framtiden. Min frågeställning är om M.C.C. behövs även i framtiden.
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Mondragón é aqui? cooperativismo e internacionalização / Is Mondragón here? cooperativism and internationalizationMondadore, Ana Paula Carletto, 1981- 22 August 2018 (has links)
Orientador: Marcia de Paula Leite / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Filosofia e Ciências Humanas / Made available in DSpace on 2018-08-22T17:00:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2013 / Resumo: A Mondragón Corporação Cooperativa (MCC) - por meio das instituições e normas criadas desde o seu início (nos anos 1950) e, a partir dos anos 1990, dos investimentos em novas plantas de produção ou alianças com outras empresas fora da Espanha, incluindo o Brasil - representa hoje o maior empreendimento cooperativo de produção no mundo. Como negócio, a internacionalização da Mondragón é um sucesso, entretanto, expõe diversas contradições em relação ao ideário e princípios cooperativistas. Pesquisamos a internacionalização da Mondragón em uma filial instalada no Brasil comparando-a com a sua sede na Espanha e, a partir disso, consideramos que o processo de internacionalização da MCC e a forma como se organiza fora do País Basco é uma escolha pragmática e econômica, capaz de viabilizar a competitividade das cooperativas no mercado, além de manter e financiar as suas estruturas solidárias no País Basco. No entanto, essa atuação internacional degenera os ideais do cooperativismo, pois, insere a divisão entre capital e trabalho, por meio da ampla utilização e exploração do trabalho assalariado / Abstract: Mondragón Cooperative Corporation (MCC) - through the institutions and rules created since its beginning (in the 1950's) and, since 1990, through the investments in new production plants or alliances with other companies outside Spain, including Brazil - represents nowadays the biggest production cooperative enterprise in the world. As a business, Mondragón's internationalization is a success, however, it exposes a lot of contradictions in relation to the cooperative ideals and principles. We have researched Mondragón's internationalization in a branch installed in Brazil comparing it to its head office in Spain and from this, we considered that MCC internationalization process and the ways it is organized outside the Basque Country is a pragmatic and economical choice, which can enable the competition among the cooperatives in the market, besides keeping and funding its solidary structures in Basque Country. Nevertheless, this international acting degenerates the cooperative ideals since it inserts the division between capital and work, through the wide use and exploration of wage labor / Doutorado / Ciencias Sociais / Doutora em Ciências Sociais
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Two Dimensional PIC/MCC Simulations of RF CCPs with a Dielectric Side Wall / Simulations bidimensionnelles PIC/MCC de CCP RF avec un mur latéral diélectriqueLiu, Yue 20 November 2017 (has links)
Un code de simulation de plasma à deux dimensions électrostatique à coordonnées cartésiennes Particle-in-cell/ Monte Carlo Collision (PIC/MCC) est présenté, incluant un nouveau traitement de l'équilibre des charges aux limites diélectriques. Il est utilisé pour simuler un plasma dans le gaz Ar dans un réacteur à plaques parallèles à couplage capacitif à radiofréquence a géométrie symétrique avec une paroi latérale diélectrique épaisse. La paroi latérale diélectrique protège efficacement le plasma du champ électrique augmenté au niveau de la jonction entre l'électrode alimentée et l'électrode à la masse, dont on a montré précédemment qu'elle produisait une augmentation localise de la densité de plasma. Néanmoins, un réchauffement accru des électrons est observé dans une région adjacente à la limite diélectrique, conduisant à des maxima de le taux d'ionisation, de la densité du plasma et du flux ionique vers les électrodes dans cette région. Les différents composants du chauffage électronique sont dérivés des simulations PIC/MCC et montrent que cette augmentation du chauffage électronique provient d'un chauffage ohmique accru dans la direction axiale lorsque la densité électronique diminue vers la paroi latérale. Nous avons étudié la validité de différentes formules analytiques pour estimer le chauffage ohmique en les comparant aux résultats PIC. Le chauffage des électrons à composantes x a proximité des coins a été observé aux fréquences d'excitation plus élevées, provenant d'un champ RF oscillant important dans la direction x. / A Cartesian-coordinate two-dimensional electrostatic Particle-in-cell/Monte-Carlo Collision (PIC/MCC) plasma simulation code is presented, including a new treatment of charge balance at dielectric boundaries. It is used to simulate an Ar plasma in a symmetric radiofrequency capacitively-coupled parallel-plate reactor with a thick dielectric side-wall. The dielectric side-wall effectively shields the plasma from the enhanced electric field at the powered-grounded electrode junction, which has previously been shown to produce locally enhanced plasma density. Nevertheless, enhanced electron heating is observed in a region adjacent to the dielectric boundary, leading to maxima in ionization rate, plasma density and ion flux to the electrodes in this region. The electron heating components are derived from the PIC/MCC simulations and show that this enhanced electron heating results from increased Ohmic heating in the axial direction as the electron density decreases towards the side-wall. We investigated the validity of different analytical formulas to estimate the Ohmic heating by comparing them to the PIC results. The x component electron heating near the corners was observed at higher driving frequency, which is caused by a significant RF oscillating field in the x direction.
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Mécanismes de l'extension continentale au Mésozoïque en Asie de l'EstCharles, Nicolas 01 December 2010 (has links) (PDF)
La lithosphère continentale peut s'étirer selon trois modes (rift large, rift étroit et Core Complex). En Asie de l'Est, une extension continentale a eu lieu de la fin du Mésozoïque au Cénozoïque et ne semble correspondre à aucun des trois modes actuellement définis. Cette période est caractérisée par un amincissement lithosphérique exceptionnel (>100 km), la présence de MCC, de bassins sédimentaires et une importante activité magmatique. Basé sur une approche multi-échelles, ce travail vise à mieux comprendre les mécanismes à l'origine de cette déformation lithosphérique (jamais abordés) ainsi que du moteur de l'extension (encore vivement discuté). Pluridisciplinaire, cette étude apporte de nouvelles contraintes à partir de l'analyse de la déformation finie (ductile ou fragile), du magnétisme des roches (ASM, paléomagnétisme), de la géochronologie (U/Pb sur zircon et 40Ar/39Ar sur monograins) et de la gravimétrie. Différents objets reconnus, révélant des quantités d'extension différentes (MCC vs. pluton cisaillé), montrent que la croûte continentale se déforme de manière très localisée, par la mise en place de larges dômes extensifs séparant des domaines de « radeaux » ou « boudins » présentant une déformation faible à nulle. Par comparaison des données crustales et mantelliques (tomographie sismique, géochimie) disponibles, cette étude met en évidence que l'amincissement lithosphérique reconnu pour le Mésozoïque est principalement lié à un important flux thermique du manteau, l'extension n'ayant qu'un rôle limité dans cet amincissement (<20%). En outre, eu égard au gradient géothermique exceptionnellement élevé de la région, à la fin du Mésozoïque, il semble très probable que des MCC puissent s'être développés sans épaississement préalable de la croûte. L'analyse comparée des directions d'étirement dans la croûte et dans le manteau met en évidence le rôle majeur de la subduction des panneaux plongeants le long de la marge est-asiatique. Un modèle géodynamique a été proposé montrant le rôle du retrait successif des panneaux plongeants couplé à un phénomène d'érosion thermique de la lithosphère.
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Analysis of cellular transcriptomic changes induced by Merkel cell polyomavirus miRNAAkhbari, Pouria January 2017 (has links)
Merkel cell carcinoma (MCC) is a highly aggressive skin cancer with rising global incidence. Merkel cell polyomavirus (MCV) was discovered in 2008 in 80% of MCC samples and since then a causal link between MCV and the majority of MCC cases has been established. microRNAs (miRNA, miR) are a family of small non-coding RNAs which play a key role in post-transcriptional regulation of gene expression and are considered significant players in disease and development in many species. Whilst the focus of MCV research has thus far been on the oncogenic MCV early proteins, large tumour (LT) and small tumour (sT) antigens, there is a knowledge gap regarding MCV miRNA and its functional significance in MCV pathogenesis. Given the emerging importance of viral miRNAs in virus-host interaction and pathogenesis, the aim of this doctoral research project was to investigate alterations in host cell transcripts induced by MCV miRNA and determine any functional significance these might have on virus-host cell interaction. RNA sequencing (RNA-Seq) in the presence and absence of MCV miRNA uncovered a multitude of downregulated cellular transcripts. Gene ontology analysis revealed that MCV miRNA targets transcripts associated with multiple cellular processes, however, regulation of immune response was overrepresented in our datasets. Validation of RNA-Seq data using MCV miRNA mimics and a synthetic, fully replicative MCV genome (MCVSyn) confirmed RNA-Seq data at mRNA and protein expression level for several targets, including the cytokine stimulating gene, SP100, and the neutrophil stimulator chemokine, CXCL8. Moreover, dual luciferase assays revealed that SP100 and MAPK10 (a member of mitogen-activated protein kinases (MAPK) family which is involved in regulation of CXCL8 expression) are directly and specifically targeted and downregulated by MCV miRNA. The MCV miRNA-dependent dysregulation of CXCL8 secretion is associated with impaired neutrophil migration, suggesting that the virus miRNA may be implicated in evasion of the host immune response.
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