Kraftig övergödning i Östersjön leder till ökad blomning av alger som medför syrebrist i havet. Musselodling kan ses som en åtgärd för problemet. På den svenska östkusten beräknas skördningen av musslor vara på ca 65 000 ton/år. Rötningsförsöket av blåmusslorna skedde i en pilotanläggning på Linnéuniversitet som består utav en lakbädd och en UASB-reaktor (Upflow Anaerobic Sludge Blanket), där syrabildningen sker i lakbädden och metanbildningen i UASB. Musslorna gav ett metanutbyte på 0,32 m 3/(kg VS) för hela rötningsperioden. Ensy AB specialiserar sig på att producera koncentrerad växtnäring från gödsel. De har som planer att utveckla sin verksamhet för att samköra produktion av biogas från gödsel. Gödslet som erhölls från Ensy AB rötades i ett satsvist försök i nio behållare med 100g/behållare. Rötningen av gödslet gav ett metanutbyte av 0,073 m3/(kg*VS). Försöket visar att det finns potential att använda blåmusslor som resurs för biogasproduktion. Genom utnyttjandet av musslor och gödsel som biogassubstrat kan övergödningen minskas, dessutom minskar utsläppet av metangas.