Pagrindinis šio baigiamojo darbo tikslas yra pilnas, A. Deveikio realizuoto neutronų ir protonų pasiskirstymo atomo branduolio sluoksniuose algoritmo ir realizuotos programos, išanalizavimas ir vietų, duosiančių reikšmingą pagreitinimą algoritmo skaičiavimams ir konfiguravimams atlikti, paieška. Darbą sudaro penkios struktūrines dalys. Pirmoje dalyje yra aprašyti optimizavimo metodai ir pateikti atliktų bandymų, įrodančių optimizuotų fragmentų privalumus, rezultatai. Antrą darbo dalį sudaro trumpas esamo algoritmo logikos aprašymas. Trečia ir ketvirta darbo dalys yra pagrindinės, jose aprašyta visa optimizavimo darbo eiga. Paskutinėje dalyje yra pateikti korektiško optimizuoto darbo veikimo įrodymai bei optimizuoto algoritmo galimybių apžvalga. Darbo rezultate buvo gautas optimizuotas neutronų ir protonų pasiskirstymo atomo branduolio sluoksniuose algoritmas bei jo programinė realizacija, kuri gali būti naudojama atomo branduolio sluoksnių modelių skaičiavimuose ir Many Fermion Dynamic code programos pakete. / The main goal of this thesis is full analysis the algorithm of the distribution of neutrons and protons in the layers of atom nucleus together with a program created by A.Deveikis and the search of places which provide important acceleration for the calculations and configurations of the algorithm. The paper consists of 5 structural parts. In the first part of the paper, optimization methods are described and the results of the research proving the advantages of optimized fragments of the program provided. The second part of the paper consists of a short description of the logic of the algorithm. The third and the fourth part of the paper describe the process of optimization. The last part of the paper proves appropriate operation of the program and foresees the opportunities of the algorithm. As a result, the optimized algorithm of the distribution of neutrons and protons in the layers of atom nuclear was created. The realisation of the algorithm can be used in the calculations of the models of atom nuclear layers and the package of Many Fermion Dynamic code.