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Purification and characterisation of plasmodium falciparum Hypoxanthine phosphoribosyltransferaseMurungi, Edwin Kimathi January 2007 (has links)
Magister Scientiae - MSc / Malaria remains the most important parasitic disease worldwide. It is estimated that over 500 million infections and more that 2.7 million deaths arising from malaria occur each year. Most (90%) of the infections occur in Africa with the most affected groups being children of less than five years of age and women. this dire situation is exacerbated by the emrggence of drug resistant strains of Plasmodium falciparum. The work reported in this thesis focuses on improving the purification of PfHPRT by investigating the characteristics of anion exchange DE-52 chromatography (the first stage of purification), developing an HPLC gel filtration method for examining the quaternary structure of the protein and possible end stage purification, and initialcrystalization trials. a homology model of the open, unligaded PfHPRT is constructed using the atoomic structures of human, T.ccruz and STryphimurium HPRT as templates. / South Africa
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Cytochrome c Oxidase from Rhodobacter sphaeroides: Oligomeric Structure in the Phospholipid Bilayer and the Structural and Functional Effects of a C-Terminal Truncation in Subunit IIICvetkov, Teresa L. 13 July 2010 (has links)
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Le chaperon moléculaire Lo18 de Oenococcus oeni : caractérisation de ses activités en lien avec sa plasticité oligomériqueMaitre, Magali 19 December 2012 (has links)
O. oeni est une bactérie lactique responsable de la fermentation malolactique des vins. Un des mécanismes impliqués dans la survie de O. oeni dans ce milieu requière la synthèse de la protéine de stress de faible masse moléculaire (sHsp) Lo18. Cette sHsp exerce une activité de chaperon sur des substrats protéiques et lipidiques.Des variations de pH (5 à 9) ont permis de moduler l’oligomérisation de Lo18 in vitro et de démontrer que sa plasticité oligomérique est un élément clé pour ses activités. Des observations de la sHsp par microscopie électronique ont montré que Lo18 s’organise à pH 5 en un 16-mère composé de deux anneaux superposés ayant comme structure de base probable un dimère.La réponse adaptative de O. oeni a également été caractérisée suite à des stress fluidifiant sa membrane plasmique. Une étude transcriptomique a révélé une augmentation du taux de transcrits pour des gènes dont les produits interviennent dans la biosynthèse des acides gras membranaires saturés et insaturés lors d’un stress à l’alcool benzylique. Des approches physiologique, moléculaire et structurale ont permis de proposer un modèle décrivant l’action chronologique de Lo18 en lien avec ses deux activités de chaperon en réponse à un stress éthanol. Dès l’application du stress, Lo18 est fortement synthétisée et agit préférentiellement à la membrane sous une forme quaternaire simplifiée. O. oeni modifie alors sa composition en acides gras membranaires, affectant ainsi l’affinité de Lo18 pour la membrane ainsi que ses activités.Les résultats obtenus permettent non seulement, de mieux comprendre le fonctionnement et le rôle de Lo18 dans la réponse au stress de O. oeni mais aussi de mettre en exergue les mécanismes d’adaptation préservant l’intégrité de sa membrane cellulaire, élément essentiel dans la survie et la performance des ferments malolactiques dans le vin / Oenococcus oeni is a lactic acid bacterium which is able to perform malolactic fermentation in wine. The synthesis of the small heat-shock protein (sHsp) Lo18 is one of the mechanisms involved in O. oeni survival in wine. Lo18 possess a chaperone activity on both protein and lipid substrates. pH variations in the range 5-9 were used to modulated Lo18 oligomerization in vitro and indicated that oligomer plasticity is essential for its activities. Electron microscopy studies showed that Lo18 is organised in a double-ring of stacked octamers to form a 16-mer structure at pH 5. The dimer observed at basic pH is thought to be the building block leading to oligomerization.The adaptive response of O. oeni to stress fluidizing its cytoplasmic membrane was also investigated. A transcriptomic study indicated an increase of the transcript level of genes involved in biosynthesis of saturated and unsaturated membrane fatty acids during benzylalcohol stress. On the basis of physiological, molecular and structural approaches, a model describing the first steps of O. oeni response to ethanol stress was proposed. In the early steps of the stress, Lo18 is synthesised and addressed to the membrane under a simplified structure. During the course of adaptation to the presence of ethanol, changes of the phospholipids content occur. This affects Lo18 activities and its affinity for O. oeni membrane.The results allow us to better understand the activities and the role of Lo18 in stress response of O. oeni and highlight the mechanisms involved in the maintenance of membrane integrity, a crucial event for malolactic starter performance in wine
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