Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-06-27T04:23:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 345983.pdf: 6571309 bytes, checksum: eff889a321cea8a94cbde6e36c5b4a0d (MD5) Previous issue date: 2017 / Os ecossistemas costeiros fornecem bens e serviços valiosos. Entretanto, a maioria destes ecossistemas já apresentam impactos antropogênicos. Historicamente os ecossistemas costeiros são alvo do descarte de resíduos industriais, agrícolas e de efluentes urbanos. Esta contaminação, além de gerar riscos à saúde humana, modifica a ecologia dos ecossistemas marinhos. Esta dissertação está dividida em dois capítulos. O primeiro trata do sequenciamento e caracterização do transcriptoma de glândula digestiva de vieiras da espécie Nodipecten nodosus. As leituras passaram por verificação de qualidade e foram montadas através de três diferentes métodos. A montagem de melhor qualidade (Velvet k = 45) apresentou um tamanho de contig N50 de 2.301 pares de base (pb), compreendendo 76.861 transcritos. Destes,33,72% foram anotados em bancos de dados públicos. Diversos transcritos de genes envolvidos na biotransformação de xenobióticos e com atividade antioxidante foram identificados. No segundo capítulo foram apresentados os resultados da classificação dos 33 transcritos citocromos P450 (CYP) buscados no transcriptoma de glândula digestiva da vieira N. nodosus. Seis novas famílias CYP foram identificadas. Além disso, a proteína CYP30E1 foi caracterizada estruturalmente, através de métodos computacionais. As sequências analisadas apresentaram, em geral, os motivos característicos desta superfamília conservados. A caracterização do CYP30E1 revela uma altas emelhança com o CYP3A4 humano, indicando funções semelhantes no metabolismo de alguns xenobióticos. Esta dissertação apresenta importantes contribuições na caracterização do transcriptoma da vieira N. nodosus e de seus transcritos CYP.<br> / Abstract : Coastal ecosystems provide valuable goods and services. However, most of these ecosystems already show anthropogenic impacts. Historically, coastal ecosystems have been subject to the disposal of industrial, agricultural and urban wastes. This contamination, in addition to producing risks to human health, modifies the marine ecosystem's ecology. This work is divided into two chapters. The first deals with the sequencing and characterization of the transcriptome of the digestive gland of scallops from the species N. nodosus. High-throughput sequencing reads went through quality checking and were assembled through three different methods. The assembly with the highest quality (Velvet k = 45) had a N50 contig size of 2,301 base pairs, comprising 76,861 transcripts. Of these, 33.72% were annotated in public databases. Several transcripts from genes involved in xenobiotic transformation or that had antioxidant activity were identified. In the second chapter, the results of the classification of 33 cytochrome P450 transcritos, searched in the digestive gland transcriptome of the scallop N. nodosus, were presented. Six new CYP families were identified. In addition, the protein CYP30E1 was characterized structurally, by computational methods. The analyzed sequences presented, in general, well conserved motifs from this superfamily. The characterization of the CYP30E1 revealed a high similarity with the human CYP3A4, indicating similar function in the metabolism of xenobiotics. This dissertation produced important contributions in the transcriptome characterization of the scallop N.nodosus and its CYP transcripts.

Made available in DSpace on 2012-09-06T01:11:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 1101.pdf: 3025551 bytes, checksum: 8c55c754b212d6d8e1ba67e8680694aa (MD5) Previous issue date: 2008 / O monitoramento de alimentos sujeitos a contaminação por HidrocarbonetosPolicíclicos Aromáticos (HPAs) é importante visto que algumas dessas substâncias são carcinogênicas e ubíquas na natureza, ocasionando possíveis riscos para a Saúde Pública. Os moluscos bivalves Nodipecten nodosus (vieiras), cultivados em fazendas marinhas e destinados para consumo humano, são importantes tanto na segurança alimentar como na vigilância de poluição ambiental, uma vez que apresentam potencial utilidade como organismos sentinelas. O objetivo principal é avaliar a presença de HPAs nesses animais, cultivados em fazendas marinhas no Rio de Janeiro. Foram analisadas 19 amostras compostas de músculo+gônadas e 3 amostras compostas de glândualas digestivas de vieiras provenientes de três fazendas marinhas da Baía de Ilha Grande. A extração das amostras foi realizada com extratores Soxhlet com nhexano/acetona (80:20 v/v) e os extratos foram fortificados com padrões internos. A purificação foi realizada com colunas abertas de sílica/alumina e as substâncias de interesse foram eluídas com n-hexano/diclorometano (80:20v/v). A análise instrumentalfoi realizada por cromatoia a gás acoplada a um espectrômetro de massas. Os níveis de HPAs totais encontrados nas amostras de músculo+gônadas (M+G) das três fazendas marinhas variou de 21,8 a 30,0 ng/g em peso úmido (p.u.) e de 99,0 a 131 ng/g em peso seco (p.s.). Tais níveis são semelhantes aos de regiões de baixa poluição relatados naliteratura. Já nas glândulas digestivas (GD), os níveis de HPAs variaram de 60,5 a 147 ng/g p.u. A semelhança dos perfis entre as amostras de tecidos distintos, mudando apenas os níveis, sugere que o acúmulo de HPAs ocorre preferencialmente nos tecidosmais gordurosos. / Os compostos de 5 e 6 anéis, mais importantes toxicologicamente, não ultrapassaram 1 ng/g p.u. ou 4 ng/g p.s. A investigação da origem dos HPAs, através das razões de fenantreno / antraceno e fluorantreno/pireno, nos dois tecidos, apontou para origem mista dessas substâncias, ou seja, pirolítica e petrogênica. Do ponto de vista dasegurança alimentar, se apresentaram aptas para consumo. Nenhuma das amostras de músculo+gônadas ultrapassou o nível máximo de benzo(a)pireno recomendado pela União Européia para bivalves de consumo humano (10 ng/g p.s.).