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Détection et caractérisation de peptides obliques au sein de protéines amyloïdogéniques

Crowet, Jean-Marc 31 March 2008 (has links)
Létude des protéines amyloïdogéniques représente un intérêt fondamental car ces protéines subissent une transconformation et une agrégation qui sont étroitement liées à lapparition de maladies incurables telles que la maladie dAlzheimer, de Parkinson ou de Creutzfeldt-Jakob. Ces phénomènes ne sont pas encore complètement expliqués tant au niveau énergétique que structural. Les peptides obliques sont de courts fragments protéiques de 11 à 19 acides aminés qui sont capables de sinsérer obliquement dans les membranes biologiques et de les déstabiliser. Récemment, des peptides obliques ont été mis en évidence dans deux protéines amyloïdogéniques responsables de maladies neurodégénératives. Il sagit du peptide b amyloïde, qui cause la maladie dAlzheimer, et de la protéine PrP, agent de la maladie de Creutzfeldt-Jakob. Au sein des protéines amyloïdogéniques, les peptides obliques pourraient être impliqués dans leffet neurotoxique de ces protéines. En affectant directement la membrane cellulaire grâce à leurs propriétés déstabilisatrices, ils conduiraient à la mort cellulaire. Dautre part, les peptides obliques pourraient aussi être impliqués dans le processus de transconformation de ces protéines. Le but de ce travail est de mettre en évidence des fragments obliques parmi dautres protéines amyloïdogéniques décrites dans la littérature, par des méthodes de modélisation moléculaire puis détudier expérimentalement les propriétés de plusieurs de ces peptides vis-à-vis des liposomes, ainsi que leur structure et leur toxicité. Ce travail a également permis de poser les bases dune méthode de détection automatique des peptides obliques. A lissue de cette étude, 22 peptides obliques, appartenant à 18 protéines amyloïdogéniques différentes, ont pu être mis en évidence parmi un ensemble de 53 protéines étudiées, et 7 peptides obliques ont été étudiés expérimentalement. Les résultats renforcent lhypothèse dune implication de certains peptides obliques dans les phénomènes de transconformation et/ou de toxicité associés aux protéines amyloïdogéniques.

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