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Quantum Chemical Studies of Protein-Bound Chromophores, UV-Light Induced DNA Damages, and Lignin Formation

Durbeej, Bo January 2004 (has links)
Quantum chemical methods have been used to provide a better understanding of the photochemistry of astaxanthin and phytochromobilin; the photoenzymic repair of UV-light induced DNA damages; and the formation of lignin. The carotenoid astaxanthin (AXT) is responsible for the colouration of lobster shell. In solution, the electronic absorption spectra of AXT peak in the 470-490 nm region, corresponding to an orange-red colouration. Upon binding to the lobster-shell protein-complex α-crustacyanin, the absorption maximum is shifted to 632 nm, yielding a slate-blue colouration. Herein, the structural origin of this bathochromic shift is investigated on the basis of recent experimental work. The tetrapyrrole phytochromobilin (PΦB) underlies the photoactivation of the plant photoreceptor phytochrome. Upon absorption of 660-nm light, PΦB isomerizes from a C15-Z,syn configuration (in the inactive form of the protein) to C15-E,anti (in the active form). In this work, a reaction mechanism for this isomerization is proposed. DNA photolyases are enzymes that repair DNA damages resulting from far-UV-light induced [2+2] cycloaddition reactions involving pyrimidine nucleobases. The catalytic activity of these enzymes is initiated by near-UV and visible light, and is governed by electron transfer processes between a catalytic cofactor of the enzyme and the DNA lesions. Herein, an explanation for the experimental observation that the repair of cyclobutane pyrimidine dimers (CPD) – the major type of lesion – proceeds by electron transfer from the enzyme to the dimer is presented. Furthermore, the formation of CPD is studied. Lignin is formed by dehydrogenative polymerization of hydroxycinnamyl alcohols. A detailed understanding of the polymerization mechanism and the factors controlling the outcome of the polymerization is, however, largely missing. Quantum chemical calculations on the initial dimerization step have been performed in order to gain some insight into these issues.
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Comportamiento térmico y mecánico del poli(etilén tereftalato) (PET) modificado con resinas poliméricas basadas en bisfenol-A

Sánchez Mora, Johan José 07 November 2003 (has links)
Se realizó el estudio de las propiedades térmicas y mecánicas de mezclas de Poli(Etilén Tereftalato) (PET) con resinas poliméricas basadas enl Bisfenol-A: Poli(Carbonato de Bisfenol-A) (PC) y Poli(Hidroxi-Éter de Bisfenil-A) (PHEB), en contenidos no superiores a un 30% en peso de estos polímeros y preparadas por extrusión doble-husillo.Una evaluación físico-química (ft-IR, densidad y MVR) de ambos sistemas indicó que pueden ocurrir reacciones de transesterificación, principalmente entre el PET y el PC y verificado vía DSC y DMTA, mientras que dichas reacciones tienen una baja extensión en el caso del PHEB, principalmente evidenciado en la pérdida de la capacidad de cristalización del PET (sin mayores cambios en su transición vítrea) en presencia de PC y casi invariabilidad al adicionar PHEB. Con el apoyo de SEM se verificó la presencia de fases ricas de ambos componentes en las mezclas en todo el rango de composiciones, verificándose el carácter inmiscible de ambos sistemas.A través de un fraccionamiento térmico por Autonucleaciones y Recocidos Sucesivos (SSA) y medidas del MVR, ensayos que favorecieron la transesterificación, se estableció que ésta promueve un aumento de la masa molecular en ambos sistemas, donde en las mezclas PET/PC esto se da por reacciones de extensión de cadena y que en las mezclas PET/PHEB conducen a la formación de ramificaciones largas y entrecruzamientos.Las propiedades mecánicas a tracción y flexión indicaron un aumento de la resistencia mecánica y deformabilidad a mayor contenido de fase bisfenólica, al observarse un aumento de los parámetros característicos de estos ensayos, donde módulos elásticos y tensiones siguieron generalmente una desviación positiva de la "Ley Aditiva de Mezcla" (LAM). Tales tendencias indicaron un efecto rigidizante de la fase bisfenólica combinado con interacciones fuertes entre los componentes que favoreció la transmisión de tensiones y la deformabilidad de la mezcla, existiendo una compatibilidad mecánica aceptable al menos a bajas velocidades de deformación, principalmente en las mezclas PET/PC en donde hay evidencias de un aumento en la tenacidad. Se verificó que hay mejoras en la Resistencia al Impacto tanto caída de dardo como pendular al menos hasta un 20% de PC, superando a las mezclas PET/PHEB las cuales manifestaron una fuerte sensibilidad a la entalla.En el análisis de la fractura a través de la Mecánica de la Fractura Elástico Lineal (LEFM) a altas velocidades y el Trabajo Esencial de Fractura (EWF) a bajas velocidades de solicitación, para contenido no superiores a 10% de fase PC y PHEB donde la morfología de fases fue comparable (partículas), se tiene que los parámetros de fractura fueron siempre superiores para las mezclas PET/PC, con una tendencia general de que el PC aporta mejoras a estos parámetros respecto al PET, mientras que el PHEB no los afecta o tiende a disminuirlos. Esto sugiere que que la adhesión interfacial es un factor determinante que favorece la transmisión de tensiones, particularmente favorable en las mezclas PET/PC por su mayor reactividad.A mayores contenidos de fase bisfenólica, el comportamiento es más complejo como consecuencia del particular balance entre tamaño, geometría y orientación de la fase dispersa que tiende a dominar sobre la adhesión interfacial, detectándose procesos de cavitación en la mayoría de las condiciones de ensayos que promovieron pocas mejoras o decaimiento en los parámetros de fractura respecto al PET. Cabe destacar que los parámetros de fractura LEFM indicaron que todos los materiales presentaron una fractura en condiciones mixtas con una componente importante de tensión plana, con excepción de las mezclas PET/PHEB que corresponderían a condiciones de deformación plana, todo lo cual fue corroborado a través del análisis fractográfico.

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