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Método de propagação de Phytopythium sp. e análise de proteínas diferencialmente expressas em raízes de mandioca inoculadas com patógenoSILVA, Jonny Lúcio de Sousa January 2018 (has links)
Cassava (Manihot esculenta Crantz) is an important crop for Brazil, where it is the main producer of roots. In regions with high humidity and temperature, the development of various diseases is favored, and stands out as root rot. The pathogens causing rot, when interacting with a binding cassava, with a reaction cascade culminating in the production of pathogen related aces (PRs), and induced biosensitivity (SAR), where biology interacts, both in apoplast and in the simplest way, more quickly and with vigor to the attack of pathogen, thus allowing an advanced plant a resistance. The present study aims to generate the methodology for the study of Phytophythium sp. in cassava roots and to study a protein expression of roots of genotypes tolerant and susceptible to a root protein in response to infection with the pathogen. The culture medium with gentle cassava root in the dark provided a 19% increase in mycelial development and 615% in sporulation of the pathogen and is the most suitable for the cultivation of the pathogen. "Among inoculum blends, 140 were differentially expressed with op ≤ 0.01, generating stress groups related to biotic stress, stress oxidative, energy metabolism and abiotic stress as a group of proteins not yet associated with a plant-pathogen interaction. / A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é uma importante cultura para o Brasil, onde o Pará é o principal produtor de raízes. Em regiões com alta umidade e temperatura, o desenvolvimento de diversas doenças é favorecido, e se destaca as podridões de raiz. Os patógenos causadores das podridões, ao interagir com a mandioca por infecção, induzem uma cascata de reações culminando na produção de proteínas como aquelas relacionadas a patógenos (PRs) e a resistência sistêmica induzida (SAR), onde biologicamente interagem, tanto no apoplasto quanto no simplasto, mais rapidamente e com vigor ao ataque de patógeno, possibilitando assim a planta promover uma resistência. O presente estudo tem como objetivo gerar metodologia para o estudo da infecção do Phytophythium sp. em raízes de mandioca e estudar a expressão protêica de raízes de genótipos tolerantes e suscetíveis a podridão mole da raiz em resposta a infecção com o patógeno. O meio de cultura contendo raiz de mandioca mansa no escuro proporcionou um incremento de 19% no desenvolvimento micelial e de 615% na esporulação do patógeno e é o mais adequado para o cultivo do patógeno. Quanto ao tipo de inoculação, a resposta foi melhor nas raízes que obtiveram ferimentos severos, com cerca 5mm de profundidade. Dentre as proteínas obtidas, 140 foram diferencialmente expressas com o p≤0.01, gerando grupos de proteínas relacionadas ao estresse biótico, estresse oxidativo, metabolismo energético e estresse abiótico bem como outro grupo de proteínas ainda não associadas com a interação planta-patógeno.
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Podridão radicular da mandioca causada por Phytopythium sp.: propagação, etodologia de inoculação e prospecção de genes de resposta.LIMA, Aline Medeiros January 2017 (has links)
UFRA / Cassava is one of the most dynamic agricultural products in the world, being cultivated in many countries, however your productive is affected by pathogens, mainly those witch cause root rot, with Phytopythium sp. Studies related with identification of genes in the interaction between cassava-P/?yto/?y//?7MOT sp. are not found in the literature. Therefore, the main objective of thesis was prospecting genes involved in the mechanisms of response of cassava to the agent that causes root rot. The thesis is divided in six chapter, the first does a general contextualization, in second chapter was identified genes related with cassava immunity that possess potential for combat against root rot pathogen, the third chapter discussed the potential of phytocystatin in the control of plant diseases caused by fungi. In the chapter four a search of the cassava genome was carried out by genes that will code phytocystatin and these were characterized in silico and compared phylogenetically with phytocystatin from other cultures. Chapter five is about the adaptations methodology of rapid propagation of cassava for obtainment of seedlings aiming at greenhouse studies, such as the inoculation of root rot agent in cassava plants. The sixth chapter presents the results aiming at the inoculation of root rot agent of roots in cassava plants. The adaptation of the rapid propagation method of cassava was effective in the production of seedlings for studies at the molecular levei of the interaction of cassava -Phytopythium sp. In total, nine genes involved in biotic stress response were investigated, of which seven presented differential expression pattems in the roots inoculated with Phytopythium sp. The analysis of the cassava genome resulted in the identification of novel phytochemical gene isoforms that are distributed on seven chromosomes. These genes become eligible for use in breeding programs aimed at combating root rot in cassava caused by Phytopythium sp. Key / A mandioca é um dos mais dinâmicos produtos da agricultura mundial, sendo cultivada em mais de cem países, no entanto sua produtividade é afetada por patógenos, principalmente os causadores de podridões radiculares, como o Phytopythium sp. Não há relatos de estudos que identificaram genes envolvidos na interação Mandioca- Phytopythium sp., portanto esta tese tem como objetivo principal a prospecção de genes envolvidos nos mecanismos de resposta da mandioca ao agente causador da podridão radicular. A tese está dividida em seis capítulos, onde o primeiro faz a contextualização geral, o segundo identificou genes relacionados à imunidade de mandioca que possuam potencial para atuar na defesa contra o agente causador da podridão radicular, o terceiro capítulo discutiu o potencial das fitocistatinas no controle de doenças de plantas causadas por fungos. No quarto capítulo foi realizada uma busca no genoma da mandioca por genes que irão codificar fitocistatina e estes foram caracterizados />? silico e comparados filogeneticamentes com fitocistatinas de outras culturas. O quinto capítulo trata de uma adaptação no método de propagação rápida da mandioca para a obtenção de mudas visando estudos em casa de vegetação, tais como, a inoculação do agente causador da podridão radicular das raízes em plantas de mandioca. O sexto capítulo apresenta os resultados visando realizar a inoculação do agente causador da podridão radicular das raízes em plantas de mandioca. A adaptação do método de propagação rápida da mandioca foi eficaz na produção de mudas para estudos em nível molecular da interação mandioca-Phytopythium sp. No total foram investigados nove genes envolvidos na resposta ao estresse biótico, dos quais sete apresentaram padrões de expressão diferencial nas raízes inocuculadas com Phytopythium sp.. A análise do genoma da mandioca resultou na identificação de nove isoformas de genes da fitocistatina que estão distribuídas em sete cromossomos. Estes genes se tornam canditados para utilização em programas de melhoramento genético que visem o combate a podridão radicular em mandioca causado ^ox Phytopythium sp.
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