Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2011 / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2012-04-20T10:26:07Z No. of bitstreams: 1 2011_EricaSantosdoCarmodeSouza.pdf: 5575768 bytes, checksum: f548899469d78785d8aeb0e5f7b97382 (MD5) / Approved for entry into archive by Leila Fernandes (leilabiblio@yahoo.com.br) on 2012-04-20T12:08:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_EricaSantosdoCarmodeSouza.pdf: 5575768 bytes, checksum: f548899469d78785d8aeb0e5f7b97382 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-04-20T12:08:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_EricaSantosdoCarmodeSouza.pdf: 5575768 bytes, checksum: f548899469d78785d8aeb0e5f7b97382 (MD5) / De um total de 22 fungos estudados, 19 foram encontrados em plantas nativas do Cerrado e três em plantas exóticas. Espécies possivelmente novas de fungos foram estudadas em folhas de Ocotea sp. (Janetia relatada pela primeira vez em Lauraceae e espécies de Vonarxella, Johansonia, Phillipsiella e Staibia connari); em folhas de uma Asteraceae não identificada (um novo celomiceto); em Roessleria brasiliana (Acrostroma sp.); e em Mauritia sp. (Pestalotiopsis sp.) e Micropholis venulosa (Stigmopeltis sp.), além disso, em Lauraceae não identificada foram estudados dois gêneros novos de ascomicetos ambos associados a tricomas foliares. Outras prováveis espécies novas foram descritas em Ilex affinis (Phyllachora sp. e Stomiopeltis sp.); em Eugenia sp. (Asterinella sp.); em Davilla rugosa (Phyllachora davilae); em Butia sp. (Coccodiella sp.); em Lantana camara (Limacinia sp.), em Triunfetta rhomboidea (Puccinia malvacearum). Em plantas exóticas no cerrado resgistraram-se duas novas espécies de Cercospora em pimenta-do-reino (Piper nigrum) e pinhão-manso (Jatropha curcas) e uma Pseudocercospora em Licuala jeanencyi (Arecaceae). _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / A total of 22 fungal species were studied; nineteen of them on native Cerrado plants and three on exotic species grown in the Cerrado. Fungal species considered as probably new taxa were studied on leaves of Ocotea sp. (Janetia sp., a first record on Lauraceae, and Vonarxella sp., Johansonia sp., Phillipsiella sp., and Staibia connari); on leaves of a non-identified Asteraceae (a new coelomycete); on Roessleria brasiliana (Acrostroma sp.); on Mauritia sp. (Pestalotiopsis sp.); and on Micropholis venulosa (Stigmopeltis sp.). On a non-identified species belonging in the Lauraceae, two new trichome-associated ascomycete genera were studied. Other probably new species were described and illustrated on Ilex affinis (Phyllachora sp. and Stomiopeltis sp.); on Eugenia sp. (Asterinella sp); on Davilla rugosa (Phyllachora davilae); on Butia sp. (Coccodiella sp.); on Lantana camara (Limacinia sp.), on Triunfetta rhomboidea (Puccinia malvacearum).Two new Cercospora species were detected on exotic host species found in Brasilia (Piper nigrum and Jatropha curcas), and a Pseudocercospora species on Licuala jeanencyi (Arecaceae) collected in Recife, Pernambuco.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-09-30T15:22:50Z No. of bitstreams: 1 2012_MariaRosaVargasZanatta.pdf: 25496899 bytes, checksum: 752391de782354ac2fbb29853582d3c5 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-10-16T13:41:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_MariaRosaVargasZanatta.pdf: 25496899 bytes, checksum: 752391de782354ac2fbb29853582d3c5 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-10-16T13:41:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_MariaRosaVargasZanatta.pdf: 25496899 bytes, checksum: 752391de782354ac2fbb29853582d3c5 (MD5) / O Distrito Federal possui a maior porcentagem de área (10,4%) em unidades de conservação de proteção integral de todos os estados do Bioma. Atinge, localmente, a porcentagem-meta estabelecida pela CDB (>10%) e se aproxima da meta da GSPC (>15%). Entretanto, acredita-se que muitas espécies podem estar desprotegidas, atualmente, 32,9% está fora de UCPI. Para cumprir outra meta da GSPC, a avaliação do risco de extinção de todas as espécies vegetais do Brasil deve ser feita até 2014. Muitas vezes a única fonte de informação disponível para avaliação das espécies são a obra princeps e os dados de herbário. Atualmente o Distrito Federal é a unidade da federação com maior densidade de coletas, mas estão distribuídas de forma desigual, principalmente entre as UCs. Os objetivos deste trabalho são: avaliar a efetividade das UCPI em proteger táxons de importância para a conservação no DF; e realizar avaliação de risco de extinção de táxons endêmicos do DF. Foi gerada uma lista de 132 táxons-alvo de importância para a conservação para nortear coletas nas quatro UCPI do DF menos amostradas (RBC, PNB, EEAE e MNP). Os táxons foram procurados em material não identificado dos principais herbários da região (UB, IBGE, CEN e HEPH). Foram coletados 22 táxons-alvo (37 amostras) em campo. 24,1% dos táxons-controle foram coletados. As áreas que apresentaram maior número de táxons-alvo foram as de maior diversidade de ambientes RBC (15 táxons, 19 amostras) e PNB (9 táxons, 12 amostras). Nos herbários foram encontradas 117 amostras (39 táxons-alvo) de UCPI que estavam com identificação incorreta ou incompleta. A porcentagem de táxons-alvo presentes em UCPI aumentou de 16% para 37% com os resultados das coletas em campo e das buscas nos herbários. A maior representatividade foi alcançada com os táxons ameaçados (71%) e quase alcançou a meta da GSPC. Os táxons endêmicos do DF estão representados em apenas 41%, portanto, alguns estão correndo alto risco de extinção. Com relação a todos os táxons-alvo, as coletas de campo resultaram em um incremento um pouco maior na representatividade em UCPI do que os registros de herbário. As avaliações resultaram em 16 CR, 3 EN, 3 VU e 7 DD. Conclui-se que esforços de coleta ainda são necessários, mesmo na unidade da federação com maior densidade de coletas do Brasil. É de extrema urgência a criação e/ou ampliação de unidades de conservação na região norte/noroeste do DF. São necessárias ações urgentes de conservação principalmente direcionadas aos táxons avaliados como CR. Existem espécies endêmicas do DF que estão correndo alto risco de extinção. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Distrito Federal has the highest percentage of area (10,4%) protected in conservation units “de proteção integral” (UCPIs) above any other state in Brazil. Locally, it marginally surpasses the porcentage-goal established by the CDB (>10%) and approaches the GSPC goal (>15%). However, many species may still be unprotected, since, at present 32,9% of taxa have never been registered in a UCPI. To attain another goal, the GSPC one, the evaluation of risk extinction of all plant species in Brazil must be concluded by 2014. The only information available concerning many plants are frequently the original description and herbarium collections.At present the Distrito Federal is the Federation unit with the highestdensity of collections, but these are unequally distributed particularly between the different UCs. The objective of this study are: to evaluate the efectivity of the UCPIs in protecting taxa of importance for conservation in the DF; and to evaluate extinction risk of endemic taxa of the DF. A short-list of 132 taxa of major conservation importance was generated to guide collections in the four least sampled UCPIs of the DF (RBC, PNB, EEAE e MNP). Short list taxa were also searched for amongst the non identified material from the main local herbaria (UB, IBGE, CEN e HEPH). Twenty-two taxa (37 samples) were found during field collections and 24,1% control taxa were collected. Areas that presented the largest number of shortlist taxa from a larger habitat diversity were RBC (15 taxa, 19 samples) and PNB (9 taxa, 12 samples). Herbarium searches resulted in 117 sample (39 short-list taxa) in UCPIs that were incompletely or incorrectly identified. The percentage of short list taxa present in UCPIs increased from 16% to 37% with the results from field collections combined with herbarium searches. The highest representativity (71%) was reached when only the endangered taxa were considered and came close to GSPC goals. Endemic taxa of the DF are represented in only 41%, therefore, over half are under threat of extinction. When all short list taxa were considered, field collections resulted in a slightly larger increment of representativity in UCPI than by searching herbaria. Evaluations resulted in 16 CR, 3 EN, 3 VU and 7 DD. We conclude that collection efforts are still necessary, even in the Federation Unit (Distrito Federal) with the highest collection density in Brazil. The implementation of a new conservation unit in the north/Northeast of the DF, or the expansion of existing ones in that direction, is urgently necessary. Urgent conservation measures are needed particularly directed at taxa evaluated as CR. There are taxa endemic to the DF that are running a high extinction risk.

Encholirium é um gênero de Bromeliaceae de distribuição restrita ao território brasileiro, ocorrendo exclusivamente em afloramentos rochosos nos domínios do Cerrado, Caatinga e Floresta Atlântica, e com centro de diversidade na Cadeia do Espinhaço de Minas Gerais. Possui 23 espécies, das qua is 12 não estão protegidas por nenhuma Unidade de Conservação. O objetivo deste trabalho foi gerar informações úteis para a conservação de três espécies deste gênero, endêmicas da porção mineira da Cadeia do Espinhaço, através da análise da estrutura genética de suas populações. O conhecimento da distribuição da variabilidade genética existente em populações naturais de espécies ameaçadas é fundamental para o planejamento de sua conservação. E. pedicellatum e E. biflorum são espécies conhecidas por apenas uma população cada, ambas ocorrendo fora de Unidades de Conservação, e, desta forma, criticamente ameaçadas de extinção. E. subsecundum é mais bem distribuída, apresentando algumas populações protegidas. As três espécies apresentam propagação vegetativa e aparentemente o estabelecimento de plântulas nas populações é um evento raro. Foram amostradas quatro populações de E. subsecundum ao longo de 200 km, além das populações de E. biflorum e E. pedicellatum. Toda a amostragem foi estruturada em nível de agrupamentos de plantas dentro de populações, respeitando a distribuição espacial dos indivíduos. Utilizaram-se cinco primers RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) para gerar aproximadamente 60 bandas polimórficas para cada espécie. A técnica permitiu observar que cada indivíduo amostrado apresenta um genótipo diferente (com exceção de um clone encontrado para E. biflorum), evidenciando uma variabilidade anteriormente subestimada pelo hábito clonal das plantas, pela sua morfologia uniforme e pelo tamanho reduzido das populações. A porcentagem de bandas polimórficas, bem como o Índice de Diversidade de Shannon- Wiener, indicam que a espécie E. subsecundum, de distribuição mais ampla, apresenta maior diversidade genética molecular, seguida de E. biflorum. Através da Análise de Variância Molecular, AMOVA, observou-se que o padrão de distribuição da variabilidade genética molecular varia de espécie para espécie. Forte estruturação genética em nível de agrupamentos de plantas foi detectada para E. biflorum e E. pedicellatum. E. biflorum apresenta 16,06% da variância genética molecular entre agrupamentos (Fst= 0,16), que distam em média 11,6 m entre si, enquanto E. pedicellatum apresenta 8,44% da variância entre agrupamentos distando em média 88 m entre si (Fst = 0,08). Já a espécie E. subsecundum apresenta 14,52% da variância entre populações distantes em média 116,6 km umas das outras (Fst = 0,15). Nas três espécies, as diferenças genéticas moleculares existentes entre os indivíduos do mesmo agrupamento são responsáveis pela maior parte da variabilidade genética molecular total (maior do que 80% da variabilidade nos três casos). Tais resultados têm implicação direta para a conservação, sendo especialmente úteis para a otimização de coletas para a formação de bancos de germoplasma ex situ. / Encholirium is a Brazilian genus of Bromeliaceae which occurs exclusively in rocky landscapes in areas of Cerrado, Caatinga and Atlantic Forest. It’s diversity center is located at Cadeia do Espinhaço, Minas Gerais State, Brazil. Of the 23 species of Encholirium, 12 are not protected by any Conservation Unit, occurring only in non-protected territories. The aim of this work was to generate baseline information to the conservation of three Encholirium species, endemic to the rocky mountains of "Cadeia do Espinhaço" in Minas Gerais state, through its populations genetic analyses. Information on genetic diversity and its distribution has a great potential in devising conservation strategies. E. pedicellatum and E. biflorum are known by only one population, both occurring in non-protected territories, being critically endangered. E. subsecundum is more widespread, and some of its populations are protected by Conservation Units. These three species reproduces clonally and seedling recruitment is apparently a rare event in natural populations. Samples of E. subsecundum were collected in four populations along 200 km. E. biflorum and E. pedicellatum were collected in the only known populations. The sampling process was made carefully in order to respect the natural distribution of individuals in "patches" or "colonies" within populations. Five Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) primers generated approximately 60 polymorphic bands for each species. This technique demonstrated that there is a single genotype for every individual sampled (except for one clone found in E. biflorum). High levels of genetic variability were not expected, due to the clonal growth, homogeneous morphology of the plants, and small populations size. The percentage of polymorphic bands and the Shannon-Wiener diversity index showed that E. subsecundum has higher levels of genetic diversity, followed by E. biflorum. The results of an Analysis of Molecular Variance (AMOVA) showed that the populations of E. biflorum and E. pedicellatum are strongly struturated at the patches level. In E. biflorum, 16.06% (Fst= 0.16) of the total genetic diversity resided among the patches of the population, which are, on the average, 11.6 m separated, whereas in E. pedicellatum 8.44% (Fst = 0.08) of the total genetic diversity was attributable to the differences among patches, which are, on the average, 88 m apart. In E. subsecundum, 14.52% (Fst = 0.15) of the total genetic diversity resided among populations, which are, on the average, 116.6 km separated. The results are valuable to the development of conservation strategies, in particular to guide future samplings to compose germoplasm banks.

Submitted by Ricardo Camacho (rscamacho@ufpa.br) on 2018-04-13T18:00:23Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_ModelagemDistribuicaoEspecies.pdf: 1065686 bytes, checksum: 82cef1617a2644a970b7e5dd9c0d2f69 (MD5) / Approved for entry into archive by Ricardo Camacho (rscamacho@ufpa.br) on 2018-04-13T18:01:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_ModelagemDistribuicaoEspecies.pdf: 1065686 bytes, checksum: 82cef1617a2644a970b7e5dd9c0d2f69 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-13T18:01:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_ModelagemDistribuicaoEspecies.pdf: 1065686 bytes, checksum: 82cef1617a2644a970b7e5dd9c0d2f69 (MD5) Previous issue date: 2012-09-13 / Afim de identificar locais com potencial para conservação de espécies ameaçadas foram comparados modelos de distribuição de espécies comerciais da flora ameaçadas do estado do Pará, com os mapas das Unidades de Conservação do estado, e observar a ocorrência destas espécies dentro e fora destas áreas. Atualmente 53 espécies da flora do estado do Pará encontram-se ameaçadas de extinção. As espécies eleitas fazem parte do Projeto de Conservação de castanheira, pau-cravo, pau-rosa e maçaranduba, desenvolvido por meio do convênio entre Museu Paraense Emílio Goeldi (MPEG), Ominia Minérios/Alcoa e Fundação de Amparo e Desenvolvimento da Pesquisa (FADESP). A elaboração dos modelos foi feita a partir do software Maxent 3.3.3, que utiliza o método da máxima entropia para analisar os dados de ocorrência das espécies e gerar seus modelos de distribuição. Os modelos de distribuição demonstram quais áreas são aptas à presença das espécies, com base em dados de ocorrência, e as características destes locais, compostas pelas variáveis ambientais. / In order to identify potential sites for endangered species conservation were compared distribution models of commercial endangered species of the states of Pará flora, with maps of protected areas in the state, and observe the occurrence of these species within and outside these areas. This study aims to compare distribution models of endangered commercial species of the state of Pará flora, with the maps of protected areas in the state, and observe the occurrence of these species within and outside these areas. Through this comparison objective is to indicate potential sites for conservation of these species. Currently 53 species of the state of Pará flora are threatened with extinction. The species chosen are part of the Conservation Project pau-cravo, castanheira, pau-rosa and and maçaranduba, developed through a partnership between Goeldi Museum (MPEG), Ominia Minerals / Alcoa and Foundation of Research and Development (FADESP). The development of these models was made by the software Maxent 3.3.3, which uses the method of maximum entropy to analyze the data of species occurrence and generate their distribution models. The distribution models show which areas are suitable for the presence of the species, based on data of occurrence, and the characteristics of these sites, composed by environmental variables.

Encholirium é um gênero de Bromeliaceae de distribuição restrita ao território brasileiro, ocorrendo exclusivamente em afloramentos rochosos nos domínios do Cerrado, Caatinga e Floresta Atlântica, e com centro de diversidade na Cadeia do Espinhaço de Minas Gerais. Possui 23 espécies, das qua is 12 não estão protegidas por nenhuma Unidade de Conservação. O objetivo deste trabalho foi gerar informações úteis para a conservação de três espécies deste gênero, endêmicas da porção mineira da Cadeia do Espinhaço, através da análise da estrutura genética de suas populações. O conhecimento da distribuição da variabilidade genética existente em populações naturais de espécies ameaçadas é fundamental para o planejamento de sua conservação. E. pedicellatum e E. biflorum são espécies conhecidas por apenas uma população cada, ambas ocorrendo fora de Unidades de Conservação, e, desta forma, criticamente ameaçadas de extinção. E. subsecundum é mais bem distribuída, apresentando algumas populações protegidas. As três espécies apresentam propagação vegetativa e aparentemente o estabelecimento de plântulas nas populações é um evento raro. Foram amostradas quatro populações de E. subsecundum ao longo de 200 km, além das populações de E. biflorum e E. pedicellatum. Toda a amostragem foi estruturada em nível de agrupamentos de plantas dentro de populações, respeitando a distribuição espacial dos indivíduos. Utilizaram-se cinco primers RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) para gerar aproximadamente 60 bandas polimórficas para cada espécie. A técnica permitiu observar que cada indivíduo amostrado apresenta um genótipo diferente (com exceção de um clone encontrado para E. biflorum), evidenciando uma variabilidade anteriormente subestimada pelo hábito clonal das plantas, pela sua morfologia uniforme e pelo tamanho reduzido das populações. A porcentagem de bandas polimórficas, bem como o Índice de Diversidade de Shannon- Wiener, indicam que a espécie E. subsecundum, de distribuição mais ampla, apresenta maior diversidade genética molecular, seguida de E. biflorum. Através da Análise de Variância Molecular, AMOVA, observou-se que o padrão de distribuição da variabilidade genética molecular varia de espécie para espécie. Forte estruturação genética em nível de agrupamentos de plantas foi detectada para E. biflorum e E. pedicellatum. E. biflorum apresenta 16,06% da variância genética molecular entre agrupamentos (Fst= 0,16), que distam em média 11,6 m entre si, enquanto E. pedicellatum apresenta 8,44% da variância entre agrupamentos distando em média 88 m entre si (Fst = 0,08). Já a espécie E. subsecundum apresenta 14,52% da variância entre populações distantes em média 116,6 km umas das outras (Fst = 0,15). Nas três espécies, as diferenças genéticas moleculares existentes entre os indivíduos do mesmo agrupamento são responsáveis pela maior parte da variabilidade genética molecular total (maior do que 80% da variabilidade nos três casos). Tais resultados têm implicação direta para a conservação, sendo especialmente úteis para a otimização de coletas para a formação de bancos de germoplasma ex situ. / Encholirium is a Brazilian genus of Bromeliaceae which occurs exclusively in rocky landscapes in areas of Cerrado, Caatinga and Atlantic Forest. It’s diversity center is located at Cadeia do Espinhaço, Minas Gerais State, Brazil. Of the 23 species of Encholirium, 12 are not protected by any Conservation Unit, occurring only in non-protected territories. The aim of this work was to generate baseline information to the conservation of three Encholirium species, endemic to the rocky mountains of “Cadeia do Espinhaço” in Minas Gerais state, through its populations genetic analyses. Information on genetic diversity and its distribution has a great potential in devising conservation strategies. E. pedicellatum and E. biflorum are known by only one population, both occurring in non-protected territories, being critically endangered. E. subsecundum is more widespread, and some of its populations are protected by Conservation Units. These three species reproduces clonally and seedling recruitment is apparently a rare event in natural populations. Samples of E. subsecundum were collected in four populations along 200 km. E. biflorum and E. pedicellatum were collected in the only known populations. The sampling process was made carefully in order to respect the natural distribution of individuals in “patches” or “colonies” within populations. Five Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) primers generated approximately 60 polymorphic bands for each species. This technique demonstrated that there is a single genotype for every individual sampled (except for one clone found in E. biflorum). High levels of genetic variability were not expected, due to the clonal growth, homogeneous morphology of the plants, and small populations size. The percentage of polymorphic bands and the Shannon-Wiener diversity index showed that E. subsecundum has higher levels of genetic diversity, followed by E. biflorum. The results of an Analysis of Molecular Variance (AMOVA) showed that the populations of E. biflorum and E. pedicellatum are strongly struturated at the patches level. In E. biflorum, 16.06% (Fst= 0.16) of the total genetic diversity resided among the patches of the population, which are, on the average, 11.6 m separated, whereas in E. pedicellatum 8.44% (Fst = 0.08) of the total genetic diversity was attributable to the differences among patches, which are, on the average, 88 m apart. In E. subsecundum, 14.52% (Fst = 0.15) of the total genetic diversity resided among populations, which are, on the average, 116.6 km separated. The results are valuable to the development of conservation strategies, in particular to guide future samplings to compose germoplasm banks.