A doença de Alzheimer (DA) é complexa e de etiologia desconhecida. Provavelmente componentes multifatoriais influenciam no desencadeamento dessa patologia, sendo que o único fator genético de risco bem estabelecido até o momento para a doença é a variante alélica APOE*E4. Nos últimos anos, descobriu-se uma série de polimorfismos em genes diferentes sugerindo que essas alterações possam ter participação discreta na patologia. O presente estudo avaliou vinte e um polimorfismos distribuídos em treze genes, sendo estes APOE, ACE, APP, BDNF, CALHM1, CST3, GAB2, GAPDH, GSK3B, GSTP1, IL1A, IL1B e SORL1 , em pacientes, controles idosos e indivíduos com comprometimento cognitivo leve, na tentativa de verificar se existe algum tipo de associação entre os polimorfismos investigados como fatores de risco para DA. Nossos resultados mostraram associações positivas entre cinco polimorfismos conferindo risco elevado para o desenvolvimento de DA (rs429358 e rs7412 de APOE, rs2373115 de GAB2, rs6438552 de GSK3B e rs641120 de SORL1). Outro achado consistente de nosso estudo foi que 20/21 polimorfismos estudados apresentaram ao menos um genótipo associado com risco elevado para DA na presença de um alelo APOE*E4. Com nosso trabalho contribuímos para aumentar o conhecimento sobre a etiologia da DA, identificando possíveis marcadores moleculares de suscetibilidadenessa patologia. / Alzheimers disease (AD) is complex, and its ethiology is not completely understood yet. It is likely that multifactorial components do account for this pathology development, being the allelic variant APOE*E4 is the only well-established genetic risk factor so far. Recently, a series of polymorphisms located at different genes were related to AD, suggesting that those variations might have a modest participation in this pathology. The present study evaluated twenty-one polymorphisms distributed in thirteen genes, being them APOE, ACE, APP, BDNF, CALHM1, CST3, GAB2, GAPDH, GSK3B, GSTP1, IL1A, IL1B and SORL1, in elderly controls, AD and mild cognitive impairment patients, attempting to verify if there is any kind of association between the selected polymorphisms as risk factors for AD. Our results show positive associations between five polymorphisms and AD (APOE rs429358 and rs7412, GAB2 rs2373115, GSK3B rs6438552 and SORL1 rs641120). Another consistent finding was that 20/21 polymorphisms analyzed showed at least one genotype associated with increased risk for AD at the presence of at least one APOE*E4 allele. We intend that our research might contribute to increase what is known about AD ethiology, by deciphering possible molecular susceptibility markers evolved with this pathology.

A doença de Alzheimer (DA) é complexa e de etiologia desconhecida. Provavelmente componentes multifatoriais influenciam no desencadeamento dessa patologia, sendo que o único fator genético de risco bem estabelecido até o momento para a doença é a variante alélica APOE*E4. Nos últimos anos, descobriu-se uma série de polimorfismos em genes diferentes sugerindo que essas alterações possam ter participação discreta na patologia. O presente estudo avaliou vinte e um polimorfismos distribuídos em treze genes, sendo estes APOE, ACE, APP, BDNF, CALHM1, CST3, GAB2, GAPDH, GSK3B, GSTP1, IL1A, IL1B e SORL1 , em pacientes, controles idosos e indivíduos com comprometimento cognitivo leve, na tentativa de verificar se existe algum tipo de associação entre os polimorfismos investigados como fatores de risco para DA. Nossos resultados mostraram associações positivas entre cinco polimorfismos conferindo risco elevado para o desenvolvimento de DA (rs429358 e rs7412 de APOE, rs2373115 de GAB2, rs6438552 de GSK3B e rs641120 de SORL1). Outro achado consistente de nosso estudo foi que 20/21 polimorfismos estudados apresentaram ao menos um genótipo associado com risco elevado para DA na presença de um alelo APOE*E4. Com nosso trabalho contribuímos para aumentar o conhecimento sobre a etiologia da DA, identificando possíveis marcadores moleculares de suscetibilidadenessa patologia. / Alzheimers disease (AD) is complex, and its ethiology is not completely understood yet. It is likely that multifactorial components do account for this pathology development, being the allelic variant APOE*E4 is the only well-established genetic risk factor so far. Recently, a series of polymorphisms located at different genes were related to AD, suggesting that those variations might have a modest participation in this pathology. The present study evaluated twenty-one polymorphisms distributed in thirteen genes, being them APOE, ACE, APP, BDNF, CALHM1, CST3, GAB2, GAPDH, GSK3B, GSTP1, IL1A, IL1B and SORL1, in elderly controls, AD and mild cognitive impairment patients, attempting to verify if there is any kind of association between the selected polymorphisms as risk factors for AD. Our results show positive associations between five polymorphisms and AD (APOE rs429358 and rs7412, GAB2 rs2373115, GSK3B rs6438552 and SORL1 rs641120). Another consistent finding was that 20/21 polymorphisms analyzed showed at least one genotype associated with increased risk for AD at the presence of at least one APOE*E4 allele. We intend that our research might contribute to increase what is known about AD ethiology, by deciphering possible molecular susceptibility markers evolved with this pathology.

Orientador: Rogério Abdallah Curi / Resumo: Na raça Quarto de Milha de equinos (Equus caballus), diferentes objetivos de seleção levaram à formação de linhagens com distintas habilidades, entre as quais a de trabalho e a de corrida. A linhagem de trabalho destina-se às provas de caráter funcional, explorando habilidades como agilidade e obediência, características consideradas de grande importância no manejo do gado a campo. Os animais de corrida apresentam melhor desempenho em pistas de curtas distâncias do que qualquer outra raça de equinos. O objetivo deste estudo foi caracterizar, por meio da genotipagem de SNP em larga escala, o desequilíbrio de ligação (LD), calculado por r², nas linhagens de trabalho e de corrida de cavalos Quarto de Milha criados no Brasil. Também foi investigado o tamanho efetivo (Ne) das duas populações, bem como as suas estruturas e relações. Para tanto, foram utilizados 428 equinos Quarto de Milha, de ambos os sexos, registrados na associação Brasileira de criadores da raça (ABQM), sendo 68 da linhagem de trabalho e 360 da de corrida. Estes animais tiveram o sangue colhido no Jockey Club de Sorocaba (Sorocaba/SP) e em propriedades rurais localizadas em dezenas de cidades do interior do Estado de São Paulo. Cento e oitenta e oito animais, 68 da linhagem de trabalho e 120 da de corrida foram genotipados, no ano de 2011, utilizando arranjo de 54.602 SNP (54K). As demais amostras da linhagem de corrida (n = 240) foram genotipadas, no ano de 2015, com arranjo de 65.157 SNP (65K). Após a realizaç... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In the Quarter Horse breed (Equus caballus), different selection objectives led to the formation of lineages with different abilities, including cutting and racing. The cutting line intended for functional tests, exploring skills such as agility and obedience, characteristics considered of great importance in the management of cattle. Racing animals perform better on runways short distances than any other horse breed. The objective of this study was to characterize, by means of large-scale SNP genotyping, the linkage disequilibrium (LD), calculated by r², in the cutting and racing lines of Quarter Horses created in Brazil. The effective size (Ne) of the two populations was investigated, as well as their structures and relationships. For that, 428 Quarter Horses of both sexes, registered in the Brazilian Association of Breeders (ABQM) were used, of which 68 were from the cutting line and 360 from the racing. These animals had blood collected at the Jockey Club of Sorocaba (Sorocaba/SP) and on rural properties located in dozens of cities in the interior of the São Paulo State. One hundred and eighty-eight animals, 68 of the cutting line and 120 of the racing were genotyped in the year 2011, using a 54,602 SNP array (54K). The other racing line samples (n = 240) were genotyped in 2015, with an array of 65,157 SNP (65K). After the imputation process, the number of informative SNP in the racing line was 55,114. Thus, for the subsequent genetic analyzes performed on the cutting and... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

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A linhagem de trabalho destina-se às provas de caráter funcional, explorando habilidades como agilidade e obediência, características consideradas de grande importância no manejo do gado a campo. Os animais de corrida apresentam melhor desempenho em pistas de curtas distâncias do que qualquer outra raça de equinos. O objetivo deste estudo foi caracterizar, por meio da genotipagem de SNP em larga escala, o desequilíbrio de ligação (LD), calculado por r², nas linhagens de trabalho e de corrida de cavalos Quarto de Milha criados no Brasil. Também foi investigado o tamanho efetivo (Ne) das duas populações, bem como as suas estruturas e relações. Para tanto, foram utilizados 428 equinos Quarto de Milha, de ambos os sexos, registrados na associação Brasileira de criadores da raça (ABQM), sendo 68 da linhagem de trabalho e 360 da de corrida. Estes animais tiveram o sangue colhido no Jockey Club de Sorocaba (Sorocaba/SP) e em propriedades rurais localizadas em dezenas de cidades do interior do Estado de São Paulo. Cento e oitenta e oito animais, 68 da linhagem de trabalho e 120 da de corrida foram genotipados, no ano de 2011, utilizando arranjo de 54.602 SNP (54K). As demais amostras da linhagem de corrida (n = 240) foram genotipadas, no ano de 2015, com arranjo de 65.157 SNP (65K). Após a realização de processo de imputação, o número de SNP informativos na linhagem de corrida foi de 55.114. Desta forma, para as análises genéticas subsequentes realizadas nas linhagens de trabalho e de corrida foram utilizados 43.117 e 55.114 SNP, respectivamente. O r² genômico médio entre pares de marcadores foi 0,22 para a linhagem de trabalho e 0,27 para a de corrida. Na linhagem de trabalho o r² foi inferior a 0,2 entre 100 e 150 Kb, enquanto na de corrida foram encontrados valores de r² menores que 0,2 entre 300 e 350 Kb. A estimativa dos valores de Ne foi de 60 e 50 animais na última geração para as linhagens de trabalho e de corrida, respectivamente. A maior extensão do LD e o menor Ne na linhagem de corrida podem ser explicados pela sua estrutura populacional mais fechada em decorrência do maior rigor no registro genealógico dos animais, além da grande influência do Puro-Sangue Inglês na sua formação. O estudo da estrutura da população indicou clara distinção entre as duas linhagens da raça. Na linhagem de corrida, contudo, foram evidenciadas substruturas populacionais decorrentes da formação de famílias que descendem de diferentes e importantes reprodutores. / In the Quarter Horse breed (Equus caballus), different selection objectives led to the formation of lineages with different abilities, including cutting and racing. The cutting line intended for functional tests, exploring skills such as agility and obedience, characteristics considered of great importance in the management of cattle. Racing animals perform better on runways short distances than any other horse breed. The objective of this study was to characterize, by means of large-scale SNP genotyping, the linkage disequilibrium (LD), calculated by r², in the cutting and racing lines of Quarter Horses created in Brazil. The effective size (Ne) of the two populations was investigated, as well as their structures and relationships. For that, 428 Quarter Horses of both sexes, registered in the Brazilian Association of Breeders (ABQM) were used, of which 68 were from the cutting line and 360 from the racing. These animals had blood collected at the Jockey Club of Sorocaba (Sorocaba/SP) and on rural properties located in dozens of cities in the interior of the São Paulo State. One hundred and eighty-eight animals, 68 of the cutting line and 120 of the racing were genotyped in the year 2011, using a 54,602 SNP array (54K). The other racing line samples (n = 240) were genotyped in 2015, with an array of 65,157 SNP (65K). After the imputation process, the number of informative SNP in the racing line was 55,114. Thus, for the subsequent genetic analyzes performed on the cutting and racing lines, 43,117 and 55,114 SNP were used, respectively. The mean genomic r² between pairs of markers was 0.22 for the cutting line and 0.27 for the racing. In the cutting line the r² was less than 0.2 between 100 and 150 Kb, while in the racing r² values were lower than 0.2 between 300 and 350 Kb. The estimates of Ne values were 60 and 50 animals in the last generation for the cutting and racing lines, respectively. The longer extent of the LD and the smaller Ne in the racing line can be explained by its more closed population structure due to the greater rigor in the genealogical register of the animals, further on the great influence of the Thoroughbred in its formation. The population structure study indicated a clear distinction between the two lineages of the breed. However, in the racing line, population substructures were evidenced due to the formation of families that descend from different and important stallions.