Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-11T12:28:25Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1023850 bytes, checksum: 994a712b696e9c127f8008bb3eeee4d0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T12:28:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1023850 bytes, checksum: 994a712b696e9c127f8008bb3eeee4d0 (MD5) Previous issue date: 2003-07-10 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Este estudo objetivou reduzir a dimensionalidade dos dados de 844 animais de uma população F2 de suínos por meio de componentes principais, bem como avaliar a associação entre as características de desempenho, de carcaça e de qualidade da carne, utilizando correlação canônica. Na redução da dimensionalidade, observou-se que, para as características de desempenho, de carcaça e de qualidade da carne, respectivamente 6, 17 e 4 componentes principais, obtidos a partir da matriz de correlação, apresentaram variância inferior a 0,7 (autovalor inferior a 0,7), sugerindo respectivamente 6, 17 e 4 variáveis para descarte, por apresentarem maiores coeficientes, em valor absoluto, a partir do último componente principal. A razão para isso é que variáveis altamente correlacionadas com os componentes de menor variância representam variação praticamente insignificante. Com base nesses resultados, recomendam-se as seguintes variáveis para serem mantidas em experimentos futuros: tamanho da leitegada ao nascimento, número de tetos, peso aos 77 dias de idade, consumo de ração e conversão alimentar dos 77 aos 105 dias de idade (desempenho); idade ao abate, peso da banda direita, comprimento da carcaça pelo Método Brasileiro de Classificação de Carcaça, maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorso-lombar, profundidade de lombo, pesos do baço, do coração, da banda direita resfriada, do pernil, da copa, da paleta, do carré, das costelas, da papada, do filezinho e do rim (carcaça); e pH medido aos 45 minutos e 24 horas post-mortem, luminosidade, gordura intramuscular, perda por cozimento e índice de vermelho (qualidade da carne). No estudo da associação entre os grupos de variáveis observou-se que aqueles com características de desempenho e de carcaça não são considerados independentes, pois foram fortemente correlacionados, visto que a correlação do primeiro par canônico foi de 0,78. Os dois primeiros pares canônicos foram estatisticamente relevantes (P < 0,01 e P < 0,05, respectivamente). No exame das variáveis que compõem o primeiro par canônico, para as características de desempenho, houve predomínio absoluto da variável peso aos 77 dias de idade; em se tratando das características de carcaça, a variável idade ao abate teve predomínio absoluto. No segundo par canônico, para as características de desempenho, houve predomínio absoluto da variável número de tetos; para as características de carcaça, a variável peso das costelas teve a maior contribuição, juntamente com a variável peso da banda direita. Para os grupos características de desempenho e características de qualidade da carne, observou-se que existe independência, pois a correlação do primeiro par canônico foi de 0,23, sendo estatisticamente irrelevante (P > 0,05). Para os grupos características de carcaça e características de qualidade da carne, observou-se que não existe independência, sendo os três primeiros pares canônicos estatisticamente relevantes (P < 0,01). No exame das variáveis que compõem o primeiro par canônico, para as características de carcaça, houve predomínio da variável peso do filezinho, seguida, principalmente, da variável comprimento de carcaça pelo Método Brasileiro de Classificação de Carcaça; no caso das características de qualidade da carne, houve predomínio absoluto da variável luminosidade. No que diz respeito às variáveis que compõem o segundo par canônico, para as características de carcaça, houve maior predomínio da variável peso do carré, seguida principalmente das variáveis comprimento da carcaça pelo Método Brasileiro de Classificação de Carcaça, maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorso-lombar, e pesos da paleta e da banda direita resfriada; para as características de qualidade da carne, a variável gordura intramuscular teve predomínio absoluto. No exame das variáveis que compõem o terceiro par canônico, para as características de carcaça, houve maior predomínio da variável peso da banda direita resfriada; para as características de qualidade da carne, a variável perda por cozimento teve maior predomínio, seguida, principalmente, da variável índice de vermelho. / This study aimed to reduce the data dimension of a F2 swine population of 844 animals using principal components, as well as evaluating the association among the performance, carcass and meat quality traits, using canonical correlation. In performance, carcass e meat quality traits it was observed that, 6, 17 and 4 principal components respectively, showed variation lower than 0.7; suggesting that, respectively, 6, 17 and 4 variables could be discarded. The reason is that when variable are highly correlated with the principal components of smaller variance, their variation is practically insignificant. Based in those results it is recommended the use of the following variables in future experiments: litter size at birth, teat number, weight at 77 days of age, feed intake and feed:gain ratio from 77 to 105 days of age (performance traits); slaughter age, right half carcass weight, carcass length by the Brazilian Carcass Classification Method, higher backfat thickness at boston shoulder area (in the midline), loin depth, spleen weight, heart weight, cold right half carcass weight, ham weight, boston shoulder weight, picnic shoulder weight, loin (bone-in) weight, spareribs weight, jowl weight, sirloin weight and kidney weight (carcass traits); pH measured 45 minutes and 24 hours post-mortem, lightness, intramuscular fat, cooking loss and redness (meat quality traits). In the study of the association between sets of variables, it was observed that performance and carcass traits, are not considered independent, because they were strongly correlated, since the first canonical correlation (r) was 0.78. The first two canonical variate pairs were estatistically significant (P < 0.01 and P < 0.05, xirespectively). In the performance traits, there was an absolute predominance of the weight at 77 days of age variable, in the first canonical variate pair; and in the carcass traits, slaughter age had absolute predominance. In the second canonical variate pair, there was an absolute predominance of the teat number variable (performance traits) and spareribs weight followed by the right half carcass weight variable (carcass traits). It was observed independence in the sets of performance and meat quality traits, because the first canonical correlation (r) was 0.23 (P > 0.05). There was no independence between the sets of carcass and meat quality traits, which the first three canonical variate pairs are estatistically significant (P < 0.01). In the carcass traits, there was a predominance of the sirloin weight variable, followed mainly, by the carcass length by to the Brazilian Carcass Classification Method, in the first canonical variate pair; and in the meat quality traits, lightness had absolute predominance. In the second canonical variate pair, in the carcass traits, there was larger predominance of the loin (bone-in) weight variable, followed mainly, by the carcass length by the Brazilian Carcass Classification Method, higher backfat thickness at boston shoulder area (in the midline), picnic shoulder weight and cold right half carcass weight (carcass traits); intramuscular fat had absolute predominance in the meat quality traits. In the third canonical variate pair, there was larger predominance of cold right half carcass weight variable, in the carcass traits; and cooking loss had larger predominance, followed mainly, by the redness variable in the meat quality traits.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1580756 bytes, checksum: 350f6dfe8f9943efab139b47104445dc (MD5) Previous issue date: 2010-02-23 / Data from an F2 swine population, consisting of 600 animals derived from crosses between Piau sires and Commercial dams were used in order to detect QTL with parent-of-origin effects. Phenotypic data on performance, carcass, internal organs, viscera, carcass cuts and meat quality traits were collected in the F2 animals. The population was genotyped for 16 microsatellite loci covering the chromosomes 1, 2 and 144. Based on the genotypes a specific linkage map was constructed for this population. Association analyses were performed using interval mapping by regression for QTL detection. A decision tree for identifying QTL with parent-of-origin effects based on tests against the Mendelian mode of expression was used. Twenty three QTL were detected using the Mendelian model of analysis, three on the chromosome one, five on chromosome two and 15 on chromosome four. It was also detected 12 QTL with parentof-origin effects. Six of these QTL were identified on chromosome one, where three were paternally expressed and three were maternally expressed. Three QTL were detected on chromosome two, where one was paternally expressed and the other two were maternally expressed. The remaining three QTL were identified on chromosome four, all of them were paternally expressed. None of the QTL with parent-of-origin effects was detected by the Mendelian model. The results generated in this study may contribute to a better understanding of the genetic mechanisms involved in the control of quantitative traits. / Com o objetivo de detectar QTL com efeito da origem parental dos alelos, foram utilizados dados de uma população F2 de suínos, composta de 600 animais, obtidos a partir do cruzamento de machos Piau e fêmeas comerciais. Nos animais F2, foram avaliadas características de desempenho, carcaça, órgãos e vísceras, cortes de carcaça e qualidade de carne. Para a genotipagem de todos os animais, foram utilizados 16 locos de microssatélites distribuídos nos cromossomos 1, 2 e 4. Com o resultado da genotipagem, foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. As análises de associação foram baseadas no mapeamento por intervalo usando métodos de regressão. Para identificar QTL com efeito da origem parental dos alelos, foi utilizada uma árvore de decisão baseada em testes contra o modelo de expressão Mendeliana. Usando o método de análise para esse tipo de expressão, foram detectados 23 QTL mendelianos: três no cromossomo 1, cinco no cromossomo 2 e 15 no cromossomo 4. Foram detectados também 12 QTL com efeito da origem parental dos alelos: seis no cromossomo 1 (três de expressão paterna e três de expressão materna), outros três no cromossomo 2 (um de expressão paterna e os outros dois de expressão materna) e três no cromossomo 4 (todos de expressão paterna). Nenhum dos QTL com efeito da origem parental dos alelos foi identificado pelo modelo Mendeliano. Os resultados obtidos podem contribuir para o melhor entendimento dos mecanismos genéticos envolvidos no controle das características quantitativas.