Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-11T12:28:25Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1023850 bytes, checksum: 994a712b696e9c127f8008bb3eeee4d0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T12:28:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1023850 bytes, checksum: 994a712b696e9c127f8008bb3eeee4d0 (MD5) Previous issue date: 2003-07-10 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Este estudo objetivou reduzir a dimensionalidade dos dados de 844 animais de uma população F2 de suínos por meio de componentes principais, bem como avaliar a associação entre as características de desempenho, de carcaça e de qualidade da carne, utilizando correlação canônica. Na redução da dimensionalidade, observou-se que, para as características de desempenho, de carcaça e de qualidade da carne, respectivamente 6, 17 e 4 componentes principais, obtidos a partir da matriz de correlação, apresentaram variância inferior a 0,7 (autovalor inferior a 0,7), sugerindo respectivamente 6, 17 e 4 variáveis para descarte, por apresentarem maiores coeficientes, em valor absoluto, a partir do último componente principal. A razão para isso é que variáveis altamente correlacionadas com os componentes de menor variância representam variação praticamente insignificante. Com base nesses resultados, recomendam-se as seguintes variáveis para serem mantidas em experimentos futuros: tamanho da leitegada ao nascimento, número de tetos, peso aos 77 dias de idade, consumo de ração e conversão alimentar dos 77 aos 105 dias de idade (desempenho); idade ao abate, peso da banda direita, comprimento da carcaça pelo Método Brasileiro de Classificação de Carcaça, maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorso-lombar, profundidade de lombo, pesos do baço, do coração, da banda direita resfriada, do pernil, da copa, da paleta, do carré, das costelas, da papada, do filezinho e do rim (carcaça); e pH medido aos 45 minutos e 24 horas post-mortem, luminosidade, gordura intramuscular, perda por cozimento e índice de vermelho (qualidade da carne). No estudo da associação entre os grupos de variáveis observou-se que aqueles com características de desempenho e de carcaça não são considerados independentes, pois foram fortemente correlacionados, visto que a correlação do primeiro par canônico foi de 0,78. Os dois primeiros pares canônicos foram estatisticamente relevantes (P < 0,01 e P < 0,05, respectivamente). No exame das variáveis que compõem o primeiro par canônico, para as características de desempenho, houve predomínio absoluto da variável peso aos 77 dias de idade; em se tratando das características de carcaça, a variável idade ao abate teve predomínio absoluto. No segundo par canônico, para as características de desempenho, houve predomínio absoluto da variável número de tetos; para as características de carcaça, a variável peso das costelas teve a maior contribuição, juntamente com a variável peso da banda direita. Para os grupos características de desempenho e características de qualidade da carne, observou-se que existe independência, pois a correlação do primeiro par canônico foi de 0,23, sendo estatisticamente irrelevante (P > 0,05). Para os grupos características de carcaça e características de qualidade da carne, observou-se que não existe independência, sendo os três primeiros pares canônicos estatisticamente relevantes (P < 0,01). No exame das variáveis que compõem o primeiro par canônico, para as características de carcaça, houve predomínio da variável peso do filezinho, seguida, principalmente, da variável comprimento de carcaça pelo Método Brasileiro de Classificação de Carcaça; no caso das características de qualidade da carne, houve predomínio absoluto da variável luminosidade. No que diz respeito às variáveis que compõem o segundo par canônico, para as características de carcaça, houve maior predomínio da variável peso do carré, seguida principalmente das variáveis comprimento da carcaça pelo Método Brasileiro de Classificação de Carcaça, maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorso-lombar, e pesos da paleta e da banda direita resfriada; para as características de qualidade da carne, a variável gordura intramuscular teve predomínio absoluto. No exame das variáveis que compõem o terceiro par canônico, para as características de carcaça, houve maior predomínio da variável peso da banda direita resfriada; para as características de qualidade da carne, a variável perda por cozimento teve maior predomínio, seguida, principalmente, da variável índice de vermelho. / This study aimed to reduce the data dimension of a F2 swine population of 844 animals using principal components, as well as evaluating the association among the performance, carcass and meat quality traits, using canonical correlation. In performance, carcass e meat quality traits it was observed that, 6, 17 and 4 principal components respectively, showed variation lower than 0.7; suggesting that, respectively, 6, 17 and 4 variables could be discarded. The reason is that when variable are highly correlated with the principal components of smaller variance, their variation is practically insignificant. Based in those results it is recommended the use of the following variables in future experiments: litter size at birth, teat number, weight at 77 days of age, feed intake and feed:gain ratio from 77 to 105 days of age (performance traits); slaughter age, right half carcass weight, carcass length by the Brazilian Carcass Classification Method, higher backfat thickness at boston shoulder area (in the midline), loin depth, spleen weight, heart weight, cold right half carcass weight, ham weight, boston shoulder weight, picnic shoulder weight, loin (bone-in) weight, spareribs weight, jowl weight, sirloin weight and kidney weight (carcass traits); pH measured 45 minutes and 24 hours post-mortem, lightness, intramuscular fat, cooking loss and redness (meat quality traits). In the study of the association between sets of variables, it was observed that performance and carcass traits, are not considered independent, because they were strongly correlated, since the first canonical correlation (r) was 0.78. The first two canonical variate pairs were estatistically significant (P < 0.01 and P < 0.05, xirespectively). In the performance traits, there was an absolute predominance of the weight at 77 days of age variable, in the first canonical variate pair; and in the carcass traits, slaughter age had absolute predominance. In the second canonical variate pair, there was an absolute predominance of the teat number variable (performance traits) and spareribs weight followed by the right half carcass weight variable (carcass traits). It was observed independence in the sets of performance and meat quality traits, because the first canonical correlation (r) was 0.23 (P > 0.05). There was no independence between the sets of carcass and meat quality traits, which the first three canonical variate pairs are estatistically significant (P < 0.01). In the carcass traits, there was a predominance of the sirloin weight variable, followed mainly, by the carcass length by to the Brazilian Carcass Classification Method, in the first canonical variate pair; and in the meat quality traits, lightness had absolute predominance. In the second canonical variate pair, in the carcass traits, there was larger predominance of the loin (bone-in) weight variable, followed mainly, by the carcass length by the Brazilian Carcass Classification Method, higher backfat thickness at boston shoulder area (in the midline), picnic shoulder weight and cold right half carcass weight (carcass traits); intramuscular fat had absolute predominance in the meat quality traits. In the third canonical variate pair, there was larger predominance of cold right half carcass weight variable, in the carcass traits; and cooking loss had larger predominance, followed mainly, by the redness variable in the meat quality traits.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-08T14:02:51Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2237559 bytes, checksum: 9322a666704bab17201155acbf19c590 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-08T14:02:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2237559 bytes, checksum: 9322a666704bab17201155acbf19c590 (MD5) Previous issue date: 2000-09-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Para caracterizar novas fontes de resistência à ferrugem, oito linhagens desenvolvidas pelo Departamento de Agricultura dos Estados Unidos foram inoculadas com quatro raças fisiológicas de Uromyces appendiculatus coletadas no Brasil. Os cultivares Ouro Negro e US Pinto 111 foram utilizados como padrões de resistência e suscetibilidade, respectivamente. As linhagens BelMiDak-RMR-12 e BelMiDak-RR-3 destacaram-se como as mais resistentes e o cultivar Ouro Negro apresentou um nível de resistência igual às melhores linhagens norte-americanas. Objetivando mapear genes relacionados à resistência do feijoeiro-comum à ferrugem, antracnose e mancha-angular, foram desenvolvidas diferentes populações segregantes (F 2 e linhas recombinantes endogâmicas - RIL's). As análises de segregação revelaram diferentes modos de herança da resistência a cada uma das raças fisiológicas utilizadas. Análises de ligação genética revelaram que diferentes genes de resistência à ferrugem e à antracnose estavam ligados entre si. Os genes de resistência à mancha-angular também foram mapeados juntos, porém em outro grupo de ligação. Foram identificados dois marcadores moleculares RAPD (OX11 630 e OF10 1050 ), flanqueando o bloco gênico que confere resistência à ferrugem e três (OBA16 669 , OBA16 583 e OAD9 3210 ) ligados ao bloco gênico que confere resistência à mancha-angular. Com relação a características quantitativas, foram estimados diferentes parâmetros genéticos, correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais e efeitos diretos e indiretos de cada característica sobre a produção, mediante o uso da análise de trilha. Os caracteres "número médio de vagens por planta" e "número médio de sementes por vagem" apresentaram maiores correlações genotípicas com a produção por planta. O carácter "número médio de sementes por planta" apresentou o maior efeito direto sobre a produção por planta. Outro objetivo do trabalho foi o de comparar dois delineamentos experimentais para estimar diferentes parâmetros genéticos obtidos a partir da avaliação de 154 RIL's de feijoeiro-comum: um delineamento em blocos casualizados (DBC) e o outro usando um ensaio comparativo, no qual as linhagens foram representadas por parcelas únicas avaliadas juntamente com testemunhas intercalares (DTI). A média das características e a precisão experimental foi semelhante nos dois delineamentos. O DBC teve maior capacidade de detecção de variabilidade genética e maior acurácia que o DTI. Com base em diferentes características de produção, resistência a doenças, tipo de grão e hábito de crescimento, dez RIL's foram selecionadas e enviadas ao Ensaio Preliminar de Linhagens (EPL). As RIL's selecionadas trazem vantagens como a introdução de importantes genes de resistência em feijão com grão tipo carioca e bege e também o desenvolvimento de linhagens de feijão com grão preto produtivas, resistentes a doenças e com hábito de crescimento não prostado (IIb). Com base em 14 características de resistência a doenças, sete características morfológicas, 49 marcadores moleculares e oito características quantitativas, foi construído um mapa de ligação gênica e mapeado os locos de características quantitativas relacionadas ao ciclo e ao rendimento do feijoeiro-comum. Adotando um valor de LOD de 4,0 e uma freqüência máxima de recombinação de 0,40, 43 marcadores, que segregaram na proporção esperada (1:1) a P<0,05 foram mapeados em nove grupos de ligação, cobrindo uma distância de recombinação total de 247,8 cM. O grupo 1 apresentou maior número de marcadores, sendo o grupo onde estão concentrados todos os genes de resistência à ferrugem e à antracnose. Os resultados encontrados neste trabalho lançaram bases para o desenvolvimento de mapas específicos saturados e de utilidade em programas de melhoramento que visem à resistência a doenças e o aumento do rendimento do feijoeiro-comum. / Quantitative, morphological, molecular, and disease resistance were evaluated in common bean for breeding and genetic mapping purposes. To characterize new resistance sources to rust, eight lines developed at the United States Department of Agriculture were inoculated with four races of Uromyces appendiculatus collected in Brazil. Cultivars Ouro Negro and US Pinto 111 were used as resistance and susceptibility standards, respectively. Lines BelMiDak- RMR-12 and BelMiDak-RR-3 were the most resistant ones. Cultivar Ouro Negro presented a resistance level comparable to the most resistant american lines. To map genes related to the common bean resistance to rust, anthracnose and angular leaf spot, different segregating populations (F 2 and recombinant inbred lines - RILs) were developed. Segregation analyses revealed different modes for resistance inheritance to the three pathogens used. Genetic linkage analyses revealed that genes for rust and anthracnose, but not for angular leaf spot resistance, were linked in the same linkage group. Two random amplified polymorphic DNA markers (OX11 630 and OF10 1050 ) were identified flanking the gene block conferring resistance to rust. Three markers (OBA16 669 , OBA16 583 and OAD9 3210 ) were linked to the gene block conferring resistance to angular leaf spot. Different genetic parameters, phenotypic, genotypic and environmentalcorrelations, were estimated as well as the direct and indirect effect of each characteristic on yield using the path analysis. Mean number of pods and mean number of seeds per pod presented the highest genotypic correlation with yield per plant. The character mean number of seeds per plant present the highest direct effect on yield per plant. Another objective of the present work was to compare two experimental designs to estimated different genetic parameters obtained from the evaluation of 154 common bean RILs: a random block design (RBD) and a comparative design in which the lines were represented by unique parcels evaluated together with intercalar witnesses (IWD)). The averages of the characteristics and the experimental precision were similar in both types of design. RBD was better to detect genetic variability and was more accurate than IWD. Based on different yield related characters, disease resistance, grain type, and growth habit, ten RILs were selected to be evaluated in the Preliminary Line Assay. These RILs may lead to varieties with carioca or bege type seeds resistant to several diseases and to varieties with black seeds, resistant to diseases, productive and with non-prostrate growth habit (type IIb). Based on 14 disease resistance loci, seven morphological traits, and 49 molecular markers a genetic linkage map was built and eight quantitative trait loci related with cycle and yield were mapped. Using a LOD score of 4.0 and a recombination frequency of 0.40, 43 marcadores segregating 1:1 with a P<0.05 were mapped into nine linkage groups, covering a total recombination distance of 247.8 cM. Linkage group number 1 grouped the highest number of markers. mapped to this group. The resistance genes for rust and anthracnose The results obtained in this work are the basis for the development of specific saturated maps to be used in common bean breeding programs aiming at the disease resistance and yield. / Tese importada do Alexandria

SANTOS, F. H. C. Estimativas de parâmetros genéticos e identificação de QTLs candidatos em cajueiro. 2012. 138 f. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-07-03T20:01:13Z No. of bitstreams: 1 2012_tese_fhcsantos.pdf: 6618925 bytes, checksum: 0e243cdd285977c8625b1bf191ad93e7 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2014-07-16T20:21:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_tese_fhcsantos.pdf: 6618925 bytes, checksum: 0e243cdd285977c8625b1bf191ad93e7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-16T20:21:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_tese_fhcsantos.pdf: 6618925 bytes, checksum: 0e243cdd285977c8625b1bf191ad93e7 (MD5) Previous issue date: 2012 / Knowledge about genetic parameters, identification of quantitative trait loci (QTL) and marker-assisted selection have great interest for genetic improvement. The objectives of this research were to evaluate the yield potential of eighty four clones of cashew, to estimate their genetic parameters and to identify QTLs associated with plant height, canopy diameter, anthracnose, black mold, number of hermaphrodite flower/panicle and nut weight. Considering these objectives, two trials were planted in two different countries (Pacajús and Paraipaba), state of Ceará, Brazil. The experimental phase was conducted in a randomized block design with two replications, two plants per plot. Apart the traits were evaluated during years 2009, 2010 and 2011. Detection of candidate QTLs were realized using the methods non-parametric mapping, interval mapping and multiple QTL mapping. The evidence of genotypic variability was detected in F1 generation to all characters analyzed. The high potential for the selection of genotypes with the best characteristics to resistance to anthracnose and black mold, hermaphrodite flower and yield. The generation F1 clones named as: 1, 16, 17, 41, 57, 65, 76 and 78 were considered the most promising materials for breeding propose. The joint analysis indicated significant genotype by environment interaction for all traits studied. QTLs for traits of agronomic importance were identified with potential for marker-assisted selection. There is presence of QTLs for all traits, explaining between 2.16 to 19.47% of the total phenotypic variation in the traits canopy diameter and hermaphrodite flowers, respectively. QTL analysis over years and places revealed important effects of genotype by environment interaction on QTL detection. This result agrees with the differences found for the average trait among years and places related, among other causes, the alternation of some clones (genotypes) for traits analyzed and the amount of rain for the environment. / O conhecimento sobre os parâmetros genéticos, a identificação de locos de características quantitativas (QTL) e a seleção assistida por marcadores têm grande importância para o melhoramento genético vegetal. Objetivou-se com o presente estudo avaliar o potencial de produção de oitenta e quatro clones de cajueiro, estimar parâmetros genéticos e identificar QTLs associados à altura da planta, diâmetro da copa, antracnose, mofo-preto, número de flores hermafroditas/panícula e peso da castanha. Considerando estes objetivos, dois experimentos foram conduzidos em dois locais (Pacajus e Paraipaba), no estado do Ceará, Brasil. Os experimentos foram conduzidos em delineamento de blocos casualizados com duas repetições e duas plantas por parcela. As características foram avaliadas nos anos 2009, 2010 e 2011. A identificação dos QTLs candidatos foi realizada utilizando os métodos de mapeamento não-paramétrico, mapeamento por intervalo e mapeamento de QTLs múltiplos. Os resultados permitem observar apresença de variabilidade genotípica na geração F1 para todos os caracteres avaliados, com alto potencial para seleção de genótipos superiores, com resistência à antracnose e ao mofo-preto, altas produções de flor hermafrodita/panícula e de castanha. Os clones da geração F1: 1, 16, 17, 41, 57, 65, 76 e 78 foram considerados os mais promissores para as características analisadas. A análise conjunta indicou a presença de interação genótipo x ambiente para todas as características estudadas. Há presença de QTLs para todos os caracteres avaliados, explicando entre 2,16% a 19,47% da variação fenotípica total nos caracteres diâmetro de copa e flores hermafroditas, respectivamente. As análises de QTL ao longo dos anos e locais revelaram efeitos importantes da interação genótipo x ambiente na detecção de QTL. Este resultado concorda com as diferenças encontradas na média das características ao longo dos anos e locais, estando relacionada, entre outras causas, à alternância de alguns clones (genótipos) para as características analisadas e a quantidade de chuva por ambiente.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 365530 bytes, checksum: 14eb9333accf37cc0f88b5dbb33077f0 (MD5) Previous issue date: 2008-02-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Molecular markers can be used to identify chromosomal regions harboring quantitative trait locos (QTL) that control traits of economic importance in farm animals. To study these locos in the pig, a resource population has been generated from a cross between two Naturalized Brazilian Piau grand sires and eighteen Commercial grand dams (Landrace x Large White x Piétrain). A total of 614 F2 progeny from 50 matings of F1 parents were produced. Phenotypic data on performance, carcass, internal organs, viscera, carcass cuts and meat quality traits were collected on the F2 animals. Parentals, F1 e F2 animals were genotyped for 17 microsatellite markers covering the chromosomes 5, 7 e 8. The loci were considered appropriate for quantitative analysis, when it was analysed their values for observed heterogosity (Ho), expected heterozigosity (He) and polimorfic information content (PIC). In the chromosome 5, the average values of the Ho, He; and PIC found were 0,73; 0,66 and 0,61; in the chromosome 7, the values found were 0,81, 071 and 0,67 and in the chromosome 8 had the average values for Ho, He and PIC of 0,65; 0,65 and 0,61 respectively. After the genotype scoring, it was constructed the linkage map for these markers in the population. Association analyses were performed using interval mapping by regression for QTL detection. Seventeen QTL were mapped for carcass and cuts carcass traits on the three chromosomes, while just one QTL for feed intake were found for performance trait in the eight chromosome. One QTL for Total (bone-in) loin weight (Kg) and for bacon depth were mapped and not yet described in the literature on the seven chromosome. The generated information of significant QTL will be useful for future studies dealing fine mapping with and identification of genes that could provide a better understanding of physiology and production traits of pigs. / Marcadores moleculares podem ser usados para identificar regiões cromossômicas que contêm locos de características quantitativas (QTL) que controlam fenótipos de importância econômica em animais de produção. Para estudá-los em suínos, foi gerada uma população de um cruzamento entre dois varrões da raça naturalizada Piau e dezoito fêmeas da linha comercial (Landrace x Large White x Pietrain). Uma progênie de 614 animais na F2 foi produzida de 50 acasalamentos da F1. Os dados fenotípicos de desempenho, carcaça, órgãos internos, vísceras, corte de carcaça e qualidade de carne foram coletados nos animais F2. Os animais parentais, F1 e F2 foram genotipados para 17 marcadores tipo microssatélites cobrindo os cromossomos 5, 7 e 8. Os locos foram considerados adequados para estudos de características quantitativas, quando foram analisados os valores de heterozigosidade observada (Ho), heterozigosidade esperada (He) e conteúdo de informação polimórfica (PIC). No cromossomo 5, os valores das médias de Ho, He e PIC encontrados foram 0,73; 0,66 e 0,61; no cromossomo 7, os valores encontrados foram 0,81, 071 e 0,67 e no cromossomo 8 os valores foram 0,65; 0,65 e 0,61. Com o resultado da genotipagem foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. As análises de associação foram feitas utilizando mapeamento por intervalo por regressão para detecção de QTL. Foram detectados 17 QTL para características de carcaça e corte de carcaça nos três cromossomos, enquanto para característica de desempenho apenas um QTL para conversão alimentar foi encontrado no cromossomo oito. Não foram encontrados nas literaturas consultadas QTL para Peso de Carré e Espessura de Bacon no cromossomo sete. As informações dos QTL significativos encontrados servem para estudos futuros como o mapeamento fino e identificação de genes que ajudam no melhor entendimento da fisiologia e características de produção de suínos.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-02-08T14:02:33Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE_CarlosBusanello.pdf: 2235732 bytes, checksum: e2445dbcb147a88becd9a9bd9fe1e349 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-02-13T12:05:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 TESE_CarlosBusanello.pdf: 2235732 bytes, checksum: e2445dbcb147a88becd9a9bd9fe1e349 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T12:05:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE_CarlosBusanello.pdf: 2235732 bytes, checksum: e2445dbcb147a88becd9a9bd9fe1e349 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-09-06 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul - FAPERGS / O conhecimento da capacidade geral de combinação-CGC e capacidade específica de combinação-CEC são fundamentais para conhecer as melhores combinações em um grupo de linhagens elite de milho para um programa de melhoramento. Para identificar estas relações foi utilizado um grupo de 10 linhagens cruzadas entre si em um delineamento dialélico incluindo os recíprocos, totalizando 90 híbridos. Estes híbridos foram testados em três ambientes, Pato Branco-PR, Campos Novos-SC e Frederico Westphalen-RS representando a região Sul do Brasil na safra agrícola 2012/2013. Os efeitos aditivos foram mais importantes que os efeitos não aditivos para a variação dos híbridos. O genitor 6 foi o que apresentou a maior estimativa do efeito da CGC, com alelos favoráveis ao incremento de peso de espiga e peso de grão. Para estas mesmas características, levando em consideração a CEC, a hibridação envolvendo os genitores 1x2 promoveu aumento no ambiente 1, e a hibridação envolvendo os genitores 4x8 promoveu redução considerável destas características. A ação do ambiente interferiu na expressão da maioria dos caracteres, indicando a necessidade de conhecer os fatores genéticos e ambientais na composição de novos híbridos de milho. Para mapeamento de QTLs foi utilizado 73 linhas de introgressão provenientes do cruzamento entre B73 e Gaspé Flint seguido de retrocruzamento, esta população foi avaliada em duas condições hídricas de campo principalmente para arquitetura do sistema radicular, bem como, caracteres morfológicos e componentes do rendimento em Ravenna, Itália. Com a genotipagem das linhas pôde-se confeccionar um mapa no qual representa 80% do genoma do Gaspé Flint introgredido em B73 contendo 329 bins independentes. A utilização do software REST para quantificar as variáveis do sistema radicular em raízes de milho em condições de campo foi eficaz, rápida e precisa. A análise de QTLs indica 35 possíveis regiões principalmente nos cromossomos 1, 2 e 4 para as características de raiz, levando em consideração todas as 31 características, foram encontrados 132 possíveis QTLs distribuídos por todos os cromossomos. Para a condição de estresse hídrico observa- se que raízes que apresentam ângulo aberto, grandes áreas e peso seco sendo superficiais, reduzem o rendimento de grãos. / The understanding about general-GCA and specific-SCC combining ability are key to identify the best combinations in an elite lineage group of a maize breeding program. In order to identify these relationships, a group comprising 10 lineages crossed with each other in a diallel design, including the reciprocal crosses, totalling 90 hybrids, were used. The hybrids were tested in three different environments, Pato Branco-PR, Campos Novos-SC and Frederico Westphalen-RS, representing the Southern Region of Brazil in the agricultural harvest of 2012/2013. For hybrid variance, additive were more important than non-additive effects. Parent 6 showed the highest estimated effect of GCA, with favorable alleles for increments of ear and grain weight. For these same traits, taking into account the SCC, the hybridization involving 1x2 parents promotes an increase in the environment 1. On the other hand, the hybridization involving 4x8 parents promotes a pronounced reduction of these traits. The expression of most traits analyzed were affected by environmental action and it indicates that the understanding of genetic and environmental factors is necessary for the development of new maize hybrids. For QTL mapping, 73 introgressed lines from the crossing between B73 and Gaspé Flint followed by backcross were used and evaluated under two field water regimes. The major traits analyzed were root architecture, plant morphological traits and yield components. Based in the genotyping analysis of the lines, it was possible to obtain a map in which 80% of the Gaspé Flint genome is introgressed in B73 comprising 329 independent bins. The software REST was employed to quantify the variables of the maize root system under field conditions and it was effective, fast and accurate. The QTL analyses indicate 25 probable regions mainly in the chromossomes 1, 2 and 4 for the root traits. Taking into account all of the 31 traits, 90 probable QTLs, distributed in all chromossomes, were found. For watering stress condition, it was possible to observe that roots with open angle, bigger area and dry mass, as well as superficial, reduces grain yield.

INTRODUÇÃO: O polimorfismo dentro do gene TCF7L2, rs7903146, é, até o momento, o marcador genético mais significantemente associado ao risco de diabetes mellitus tipo 2, sendo também associado à doença arterial coronariana. Contudo, pouco ainda se conhece sobre o papel funcional desse polimorfismo na patologia dessas doenças. O objetivo desse projeto foi investigar esse papel funcional, no fenótipo de células vasculares de músculo liso de 92 indivíduos, usando abordagens de comparação de níveis de expressão gênica e de comparação de correlações de expressão gênica, de modo que tais comparações fossem representadas visualmente como redes de interação gênica. MÉTODOS: Inicialmente, foram comparados os níveis de expressão de 41 genes (genes que possuem ou estão perto de variantes genéticas associadas ao diabetes mellitus tipo 2 e outros genes relacionados às vias de sinalização de diabetes mellitus tipo 2 ou às vias de proliferação celular) entre indivíduos com o alelo associado ao risco de diabetes mellitus tipo 2 (CT e TT) e indivíduos sem o alelo de risco (CC) do rs7903146. Com a finalidade de se observar se os genes estavam se relacionando de modo diferente entre os grupos genotípicos, foram comparados os padrões de correlação de expressão dos 41 genes. RESULTADOS: Quanto às comparações de níveis de expressão entre os grupos, cinco formas de splicing do gene TCF7L2 e os genes CDKAL1, IGF2BP2, JAZF1, CDKN2B, CAMK1D, JUN, CDK4, ATP2A2, e FKBP1A apresentaram níveis de expressão significativamente diferentes. Quanto às comparações de correlação de expressão entre os grupos, os genes RXR?, CALM1, CALR e IGF2BP2 foram os que mostraram os mais diferentes padrões de correlação com os outros genes. CONCLUSÃO: Deste modo, o alelo de risco analisado é apontado como tendo influência em cis na regulação da expressão de determinadas formas de splicing do gene TCF7L2 em células vasculares de músculo liso; além de parecer influenciar nas expressões e nas interações de genes relacionados à homeostase glicolítica e/ou proliferação celular. Sendo assim, através de nossas análises identificaram-se possíveis candidatos-alvos no tratamento de redução do risco em indivíduos com alto risco de desenvolvimento de diabetes mellitus tipo 2 e de doença arterial coronariana, especialmente os indivíduos que possuem os genótipos de risco analisados do gene TCF7L2 / INTRODUCTION: The SNP within the TCF7L2 gene, rs7903146, is, to date, the most significant genetic marker associated with type 2 diabetes mellitus risk, well as being associated with coronary artery disease. Nonetheless, its functional role in these diseases pathology is poorly understood. The aim of the present study was to investigate this role, in vascular smooth muscle cells from 92 patients undergoing aortocoronary bypass surgery, using expression levels and expression correlation comparison approaches, which were visually represented as gene interaction networks. METHODS: Initially, the expression levels of 41 genes (seven TCF7L2 splice forms and other 40 relevant genes) were compared between rs7903146 wild-type (CC) and type 2 diabetes mellitus risk (CT + TT) genotype groups. Next, the expression correlation patterns of the 41 genes were compared between genotypic groups in order to observe if the relationships between genes were different. RESULTS: Five TCF7L2 splice forms and CDKAL1, IGF2BP2, JAZF1, CDKN2B, CAMK1D, JUN, CDK4, ATP2A2 and FKBP1A genes showed significant expression differences between groups. RXR?, CALM1, CALR and IGF2BP2 genes were pinpointed as showing the most different expression correlation pattern with other genes. CONCLUSION: Therefore, type 2 diabetes mellitus risk alleles appear to be influencing TCF7L2 splice form\'s expression in vascular smooth muscle cells; besides it can be influencing expression and interactions of genes related to glucose homeostasis and/or cellular proliferation. Thereby, through our analysis were identified possible treatment target candidates for risk reduction in individuals with high-risk of developing type 2 diabetes mellitus and coronary artery disease, especially individuals harboring TCF7L2 risk genotypes

INTRODUÇÃO: O polimorfismo dentro do gene TCF7L2, rs7903146, é, até o momento, o marcador genético mais significantemente associado ao risco de diabetes mellitus tipo 2, sendo também associado à doença arterial coronariana. Contudo, pouco ainda se conhece sobre o papel funcional desse polimorfismo na patologia dessas doenças. O objetivo desse projeto foi investigar esse papel funcional, no fenótipo de células vasculares de músculo liso de 92 indivíduos, usando abordagens de comparação de níveis de expressão gênica e de comparação de correlações de expressão gênica, de modo que tais comparações fossem representadas visualmente como redes de interação gênica. MÉTODOS: Inicialmente, foram comparados os níveis de expressão de 41 genes (genes que possuem ou estão perto de variantes genéticas associadas ao diabetes mellitus tipo 2 e outros genes relacionados às vias de sinalização de diabetes mellitus tipo 2 ou às vias de proliferação celular) entre indivíduos com o alelo associado ao risco de diabetes mellitus tipo 2 (CT e TT) e indivíduos sem o alelo de risco (CC) do rs7903146. Com a finalidade de se observar se os genes estavam se relacionando de modo diferente entre os grupos genotípicos, foram comparados os padrões de correlação de expressão dos 41 genes. RESULTADOS: Quanto às comparações de níveis de expressão entre os grupos, cinco formas de splicing do gene TCF7L2 e os genes CDKAL1, IGF2BP2, JAZF1, CDKN2B, CAMK1D, JUN, CDK4, ATP2A2, e FKBP1A apresentaram níveis de expressão significativamente diferentes. Quanto às comparações de correlação de expressão entre os grupos, os genes RXR?, CALM1, CALR e IGF2BP2 foram os que mostraram os mais diferentes padrões de correlação com os outros genes. CONCLUSÃO: Deste modo, o alelo de risco analisado é apontado como tendo influência em cis na regulação da expressão de determinadas formas de splicing do gene TCF7L2 em células vasculares de músculo liso; além de parecer influenciar nas expressões e nas interações de genes relacionados à homeostase glicolítica e/ou proliferação celular. Sendo assim, através de nossas análises identificaram-se possíveis candidatos-alvos no tratamento de redução do risco em indivíduos com alto risco de desenvolvimento de diabetes mellitus tipo 2 e de doença arterial coronariana, especialmente os indivíduos que possuem os genótipos de risco analisados do gene TCF7L2 / INTRODUCTION: The SNP within the TCF7L2 gene, rs7903146, is, to date, the most significant genetic marker associated with type 2 diabetes mellitus risk, well as being associated with coronary artery disease. Nonetheless, its functional role in these diseases pathology is poorly understood. The aim of the present study was to investigate this role, in vascular smooth muscle cells from 92 patients undergoing aortocoronary bypass surgery, using expression levels and expression correlation comparison approaches, which were visually represented as gene interaction networks. METHODS: Initially, the expression levels of 41 genes (seven TCF7L2 splice forms and other 40 relevant genes) were compared between rs7903146 wild-type (CC) and type 2 diabetes mellitus risk (CT + TT) genotype groups. Next, the expression correlation patterns of the 41 genes were compared between genotypic groups in order to observe if the relationships between genes were different. RESULTS: Five TCF7L2 splice forms and CDKAL1, IGF2BP2, JAZF1, CDKN2B, CAMK1D, JUN, CDK4, ATP2A2 and FKBP1A genes showed significant expression differences between groups. RXR?, CALM1, CALR and IGF2BP2 genes were pinpointed as showing the most different expression correlation pattern with other genes. CONCLUSION: Therefore, type 2 diabetes mellitus risk alleles appear to be influencing TCF7L2 splice form\'s expression in vascular smooth muscle cells; besides it can be influencing expression and interactions of genes related to glucose homeostasis and/or cellular proliferation. Thereby, through our analysis were identified possible treatment target candidates for risk reduction in individuals with high-risk of developing type 2 diabetes mellitus and coronary artery disease, especially individuals harboring TCF7L2 risk genotypes