Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario / Un total de 2.461 individuos de Salmón del Atlántico (Salmo salar), de 29 familias de propios hermanos, con aproximadamente 85 individuos por familia en etapa de pre-smolt fueron desafiados con la bacteria Piscirickettsia salmonis para inducir la enfermedad piscirickettsiosis (SRS). El análisis se realizó definiendo la sobrevivencia a la enfermedad como una característica binaria mediante un modelo binario (MB) y como la respuesta binaria a una suma de factores de efecto desconocido que se comportan según una curva de distribución normal, llamado modelo umbral (MU). El principal parámetro que se obtuvo fue la heredabilidad la que se definió como la capacidad de sobrevivir frente al desafío con el agente patógeno. Además se calculó la respuesta a la selección, definiéndose como la disminución de la mortalidad poblacional debido a la infección con el patógeno. La heredabilidad y la respuesta a la selección fueron analizadas con ambos modelos al día 30, 40 y 51 obteniéndose heredabilidades de entre 0,195 a 0,25 para el modelo binario y de entre 0,457 a 0,417 para el modelo umbral; mientras que la respuesta a la selección con el modelo binario fue entre -0,019 y -0,066 y para el modelo umbral varió entre -0,082 y -0,179. Estos resultados llevan a pensar que un programa genético tendiente a seleccionar la población por su capacidad genética para resistir la piscirickettsiosis, tendría una efectividad considerable y podría ser una buena alternativa para aumentar la competitividad de la industria salmonícola nacional / Proyecto Corfo-Innova (05CT6 PP-10)

Magíster en farmacología / El carcinoma escamoso de laringe es una enfermedad altamente invalidante ya que puede afectar la capacidad del habla, respiración y deglución del paciente que lo sufre. Los principales factores causales identificados son cigarro y alcohol. Las vías de respuesta inflamatoria, proliferativa y de reparación de ADN pueden contribuir al riesgo de cáncer de laringe. El objetivo de este estudio es determinar asociaciones entre variantes genéticas COX-2 rs20417, COX-2 rs689466, EGF rs4444903, EGFR rs2227983, P53 rs1042522 y el riesgo de cáncer de laringe en la población chilena. Se realizó un estudio casos y controles, con 100 pacientes con cáncer escamoso de laringe y 139 voluntarios adultos sin cáncer. La genotipificación se realizó mediante PCR-RLFP. Se observa que estos polimorfismos son capaces de incrementar el riesgo de cáncer de laringe asociado a la combinación de consumo de tabaco y alcohol en una razón de 0,34 veces para COX-2 rs20417, 0,5 veces para EGF rs4444903, 0,56 veces para P53 rs1042522, 1,72 veces para EGFR rs2227983 y 4,7 veces para COX-2 rs689466. Esto sugiere que las variantes COX-2 rs20417, COX-2 rs689466, EGF rs4444903, EGFR rs2227983 y P53 rs1042522 actúan como modificadores de riesgo de cáncer de laringe. / Laryngeal squamous cell carcinoma is a kind of cancer that can be highly disabling to the patient, affecting speech, swallowing and respiratory skills, and leading to impaired quality of life. Smoking and alcohol abuse are principal risk factors linked to this disease. Inflammation signaling pathways, mitogens and DNA repair genes are factors that can be involved in carcinogenesis. The aim of this research is to assess the effect of COX-2 rs20417, COX-2 rs689466, EGF rs4444903, EGFR rs2227983, P53 rs1042522 single nucleotide polymorphisms in the risk of laryngeal cancer development in Chilean population. For this case control study, we recruited 100 cancer patients and 139 healthy volunteers. SNP genotype was analyzed from genomic DNA by PCR-RFLP. We observed that these SNPs are capable of increase the smoking plus alcohol risk of laryngeal cancer in a ratio of 0,34 fold for COX-2 rs20417 SNP, 0,5 fold for EGF rs4444903 SNP, 0,56 fold for P53 rs1042522 SNP, 1,72 fold for EGFR rs2227983 SNP and 4,7 fold for COX-2 rs689466 SNP. These findings suggest that COX-2 rs20417, COX-2 rs689466, EGF rs4444903, EGFR rs2227983 and P53 rs1042522 single nucleotide polymorphisms acts as risk modifier factors for laryngeal cancer.

GRado de magíster en ciencias biológicas, mención biología celular y molecular. / A nivel mundial, el cáncer de mama (CM), es el más frecuente y la principal causa de muerte por cáncer en mujeres (14%), representando el 23% del total de casos nuevos de cáncer. En Chile, es la primera causa de muerte por cáncer en mujeres, y la mortalidad por CM, ha ido en aumento en las últimas dos décadas. Debido a lo anterior, es pertinente realizar estudios que permitan conocer mejor sus bases etiológicas, para poder tomar medidas que permitan su prevención y su detección temprana. En la literatura existen variadas publicaciones en relación a genes codificantes que aumentan la susceptibilidad a desarrollar CM. Este, es el caso de los genes BRCA1/2, ATM, PALB2 entre otros, sin embargo en los últimos años se ha puesto mayor atención a la influencia que pudiesen tener secuencias no codificantes sobre el riesgo de desarrollar CM. Especialmente, existe gran interés en los miRNAs, y polimorfismos presentes en ellos, que pudieran ser la causa de aumento de riesgo para CM. Se ha demostrado que la presencia de SNPs en las secuencias de precursores o miRNAs maduros, afecta la maduración y el procesamiento de estos RNAs pequeños, así como también el silenciamiento de sus mRNAs blancos, proponiéndose este mecanismo como el responsable del desarrollo de diversas patologías entre ellas el CM. En este trabajo se analizaron las frecuencias alélicas y genotípicas de tres SNPs (rs2910164, rs3764444 y rs11614913) presentes en los miRNAs 146a y miRNA-499 y miRNA-196 respectivamente, y su asociación con el aumento de susceptibilidad a desarrollar CM en mujeres chilenas. Los resultados muestran que los SNPs presentes tanto en el miRNA-499 como en el miRNA-196, disminuyen el riesgo a desarrollar CM y actuarían como potenciales factores protectores para la patología. Por el contrario, el SNP presente en el miRNA-146a se asoció con aumento de riesgo para desarrollar CM en mujeres con CM esporádico, sin historia familiar para la patología, mientras que en pacientes con historia familiar mostró ser un factor protector. Estos resultados muestran la complejidad biológica que estaría detrás de cada tipo de CM, y los efectos tan distintos que los miRNAs podrían tener en diferentes contextos celulares. Para estudiar la funcionalidad biológica que pudiese tener el SNP presente en el pre- miRNA- 146a, se clonó este fragmento desde pacientes portadores para el alelo de riesgo y de sujetos controles, para posteriormente estudiar su efecto in vitro mediante la transfección en células de mama humana. Aunque no analizado, se espera que un cambio en la secuencia de un precursor de miRNA, afecte de tal manera su estructura secundaria que aumente o disminuya su disponibilidad para la maquinaria de procesamiento, resultando en cambios en los niveles de expresión de los miRNAs maduros. Estos cambios tendrían un impacto directo sobre la tasa de silenciamiento de los mRNAs blancos, que al estar más o menos silenciados promoverían un desequilibrio que aportaría con la transformación celular. / Worldwide, breast cancer (CM) is the most common and the leading cause of cancer death in women (14%), representing 23% of all new cancer cases. In Chile, it is the leading cause of cancer death in women, and mortality from CM, has been increasing in the last two decades. Because of this, it is appropriate to conduct studies to better understand their etiological bases, to take measures to prevention and early detection. In the literature there are various publications regarding coding genes that increase susceptibility to CM. This is the case of BRCA1 / 2, ATM, PALB2 among other genes, however in recent years there has been more attention to the influence that may have non-coding sequences on the risk of developing CM, specifically there is great interest in miRNAs, and polymorphisms present in them, which could be the cause of increased risk for CM. It has been shown that the presence of SNPs in the sequences of precursors or mature miRNAs affects maturation and processing of these small RNAs, as well as the silencing of their targets mRNAs, proposing this mechanism as responsible for the development of various diseases among CM them. In this work the allele and genotype frequencies of three SNPs (rs2910164, rs3764444 and rs11614913) present in the miRNAs 146a and miRNA-499 and miRNA-196 respectively, and its association with increased susceptibility to CM in Chilean women were analyzed. The results demonstrate that the SNPs present in both the miRNA-499 and miRNA-196, decrease the risk of developing CM and act as potential protective factors for the disease. By contrast, the SNP present in the miRNA-146a was associated with increased risk for women with CM CM sporadic, without family history of the disease, while in patients with family history was shown to be a protective factor. These results show the biological complexity that would be behind each type of CM, and the very different effects that miRNAs may have in different cellular contexts. To study the biological functionality that might be present in the pre miRNA- SNP 146a, this fragment was cloned from patients for the risk allele and control subjects, transforming later to study its effect in vitro by transfection into cells human breast.Despite not studied, it is expected that a change in the sequence of a miRNA precursor, so affecting its secondary structure to increase or decrease their availability for processing machinery, resulting in changes in the expression levels mature miRNAs. These changes may have a direct impact on the rate of silencing targets mRNAs, which being more or less silenced would promote an imbalance that would contribute to tumor cell transformation.

El síndrome de Lynch (SL) se caracteriza por presentar heterogeneidad genética, pleiotropismo y penetrancia incompleta y variable, sugiriendo la posibilidad de un riesgo poligénico y posiblemente, la implicación de otros genes de cáncer hereditario en familias con fenotipos complejos. La co-ocurrencia de diferentes variantes patogénicas en diferentes genes de predisposición hereditaria a cáncer en un individuo, lo que se conoce con las siglas MINAS, está probablemente infradiagnosticada. La identificación de segundas alteraciones genéticas en línea germinal en genes de cáncer hereditario tiene un importante impacto para el paciente y sus familiares. En esta tesis se realizó un estudio retrospectivo en una cohorte de casos índice de SL para intentar dimensionar esta situación a priori rara o muy rara. Los resultados obtenidos muestran que la prevalencia de más de un alelo patogénico que predispone a cáncer en pacientes con síndrome de Lynch es relevante, entorno al 6% y que la presencia de más de un alelo patogénico en genes de predisposición a cáncer no suele asociarse a las manifestaciones clínicas esperadas de ambos genotipos, en el momento del diagnóstico. Sin embargo, son necesarios más estudios para confirmar estos hallazgos. Por otro lado, la poliposis asociada a la actividad correctora de las polimerasas (PPAP) es otro síndrome de cáncer hereditario. Para este síndrome, existen pocas variantes patogénicas descritas y el fenotipo clínico asociado se basa en un número limitado, pero creciente, de familias descritas. La caracterización molecular exhaustiva y un análisis detallado del fenotipo clínico asociado a variantes patogénicas recurrentes en los genes responsables, podría ayudar a a mejora de la evaluación del riesgo de cáncer en estas familias; permitiendo así mismo ofrecer un seguimiento más personalizado y eficiente. Por ello, realizamos un estudio para intentar establecer el carácter fundador, el fenotipo clínico asociado y la penetrancia de la variante patogénica, no descrita previamente (POLD1:c.1421T>C; p.Leu474) e identificada dentro del Programa de Cáncer Hereditario de la Comunidad Valenciana en cuatro familias aparentemente no relacionadas. Los resultados obtenidos establecieron el carácter fundador de la variante de interés, con un haplotipo común de unas 3Mb, siendo la primera variante patogénica con carácter fundador identificada en el gen POLD1 y además el fenotipo clínico de la variante coincide a priori con el del SL.