Activities in the motor cortex are found to be dynamical in nature. Modeling these activities and comparing them with neural recordings helps in understanding the underlying mechanism for the generation of these activities. For this purpose, Recurrent Neural networks or RNNs, have emerged as an appropriate tool. A clear understanding of how the design choices associated with these networks affect the learned dynamics and internal representation still remains elusive. A previous work exploring the dynamical properties of discrete time RNN architectures (LSTM, UGRNN, GRU, and Vanilla) such as the fixed point topology and the linearised dynamics remains invariant when trained on 3 bit Flip- Flop task. In contrast, they show that these networks have unique representational geometry. The goal for this work is to understand if these observations also hold for networks that are more biologically realistic in terms of neural activity. Therefore, we chose to analyze rate networks that have continuous dynamics and biologically realistic connectivity constraints and on spiking neural networks, where the neurons communicate via discrete spikes as observed in the brain. We reproduce the aforementioned study for discrete architectures and then show that the fixed point topology and linearized dynamics remain invariant for the rate networks but the methods are insufficient for finding the fixed points of spiking networks. The representational geometry for the rate networks and spiking networks are found to be different from the discrete architectures but very similar to each other. Although, a small subset of discrete architectures (LSTM) are observed to be close in representation to the rate networks. We show that although these different network architectures with varying degrees of biological realism have individual internal representations, the underlying dynamics while performing the task are universal. We also observe that some discrete networks have close representational similarities with rate networks along with the dynamics. Hence, these discrete networks can be good candidates for reproducing and examining the dynamics of rate networks. / Aktiviteter i motorisk cortex visar sig vara dynamiska till sin natur. Att modellera dessa aktiviteter och jämföra dem med neurala inspelningar hjälper till att förstå den underliggande mekanismen för generering av dessa aktiviteter. För detta ändamål har återkommande neurala nätverk eller RNN uppstått som ett lämpligt verktyg. En tydlig förståelse för hur designvalen associerade med dessa nätverk påverkar den inlärda dynamiken och den interna representationen är fortfarande svårfångad. Ett tidigare arbete som utforskar de dynamiska egenskaperna hos diskreta RNN- arkitekturer (LSTM, UGRNN, GRU och Vanilla), såsom fastpunkts topologi och linjäriserad dynamik, förblir oförändrad när de tränas på 3-bitars Flip- Flop-uppgift. Däremot visar de att dessa nätverk har unik representationsgeometri. Målet för detta arbete är att förstå om dessa observationer också gäller för nätverk som är mer biologiskt realistiska när det gäller neural aktivitet. Därför valde vi att analysera hastighetsnätverk som har kontinuerlig dynamik och biologiskt realistiska anslutningsbegränsningar och på spikande neurala nätverk, där neuronerna kommunicerar via diskreta spikar som observerats i hjärnan. Vi reproducerar den ovannämnda studien för diskreta arkitekturer och visar sedan att fastpunkts topologi och linjäriserad dynamik förblir oförändrad för hastighetsnätverken men metoderna är otillräckliga för att hitta de fasta punkterna för spiknätverk. Representationsgeometrin för hastighetsnätverk och spiknätverk har visat sig skilja sig från de diskreta arkitekturerna men liknar varandra. Även om en liten delmängd av diskreta arkitekturer (LSTM) observeras vara nära i förhållande till hastighetsnäten. Vi visar att även om dessa olika nätverksarkitekturer med varierande grad av biologisk realism har individuella interna representationer, är den underliggande dynamiken under uppgiften universell. Vi observerar också att vissa diskreta nätverk har nära representationslikheter med hastighetsnätverk tillsammans med dynamiken. Följaktligen kan dessa diskreta nätverk vara bra kandidater för att reproducera och undersöka dynamiken i hastighetsnät.

La tolérance aux pannes est une propriété très importante des réseaux optiques de nouvelle génération. Cette thèse aborde la conception des mécanismes de protection contre des pannes liées à la défaillance d’une fibre optique ou à une catastrophe naturelle. Deux systèmes de protection classiques, à savoir la protection par des cycles préconfigurés(p-cycles) et la protection du chemin de secours, sont étudiés pour atteindre une efficacité de protection élevée, tout en considérant le coût de l’équipement optique,la consommation d’énergie et l’utilisation de la ressource spectrale. Ces problèmes de survivabilité sont d’abord formulés en utilisant la programmation linéaire en nombres entiers (PLNE), et ensuite résolus soit par algorithmes heuristiques, soit par une approche de décomposition.La panne d’une seule fibre optique est le scénario le plus courant. Nous allons donc considérer d’abord des pannes liées à la défaillance d’une fibre optique dans les réseaux optiques multi-débit. Pour réduire le coût des transpondeurs, un système de protection par p-cycles de longueur adaptable et peu coûteux est proposé. Spécifiquement, les p cycles de longueur limitée sont conçus pour utiliser un débit approprié en fonction du coût du transpondeur et de la portée de transmission. Un modèle de programmation linéaire en nombres entiers (PLNE) sans énumération des cycles candidats est formulé pour générer directement les p-cycles de coût dépenses d’investissement minimum. De plus, un algorithme GPA (Graph Partitioning in Average) et un algorithme d’estimation des nombres de cycles (EI) sont développés pour rendre le modèle PLNE plus efficace au niveau du temps de calcul. En ce qui concerne la consommation d’énergie des réseaux optiques élastiques résilients,nous proposons d’utiliser un schéma de p-cycles dirigés, efficaces en énergie,pour protéger le trafic asymétrique. En raison de l’avantage de distinguer du volume de trafic dans les deux directions, les p-cycles dirigés consomment peu d’énergie en attribuant de créneaux ou slots du spectre et des formats de modulation différents à chaque direction.Un modèle PLNE est formulé pour minimiser la consommation d’énergie totale sous contraintes de génération du cycle dirigée, d’allocation de spectre, d’adaptation de modulation et de capacité de protection. Pour le passage à l’échelle, le modèle PLNE est décomposé en deux sous-problèmes: une méthode d’énumération de cycles améliorée et un modèle PLNE simplifié pour la sélection des cycles. Nous avons montré que les p-cycles dirigés obtiennent une meilleure performance comparant les p-cyclesiii non-dirigés pour le trafic asymétrique en termes de la consommation d’énergie et de l’utilisation du spectre.Afin d’améliorer l’efficacité d’utilisation du spectre dans réseaux optiques élastiques, une protection par p-cycles (SS-p-cycle) à spectre partagé est proposée. Les SS-p-cycles permettent de réduire l’utilisation du spectre et le taux de fragmentation spectrale en exploitant un partage de spectre spécial entre plusieurs p-cycles ayant des liens communs.Les modèles PLNE est conçus dans les cas "sans" ou "avec" conversion spectrale afin de minimiser l’utilisation du spectre. Ces modèles peuvent obtenir la solution optimale pour un petit réseaux optiques élastiques, et une heuristique efficace est développée pour résoudre les instances à grande échelle. Les résultats de simulations montrent que les SS-p-cycles ont des avantages significatifs pour réduire l’utilisation de la ressource spectrale et la défragmentation des fréquence. De plus, la conversion du spectre aide les SS-p-cycles à acquérir une meilleure utilisation du spectre. / Network survivability is a critical issue for optical networks to maintain resilience against network failures. This dissertation addresses several survivability design issues against single link failure and large-scale disaster failure in optical networks. Twoclassic protection schemes, namely pre-configured Cycles (p-Cycle) protection and path protection, are studied to achieve high protection capacity efficiency while taking intoaccount the equipment cost, power consumption and resource usage. These survivable network design problems are first formulated by mathematical models and then offered scalable solutions by heuristic algorithms or a decomposition approach.We first consider single link failure scenario. To cut the multi-line rates transponderscost in survivable Mixed-Line-Rate (MLR) optical networks, a distance-adaptive andlow Capital Expenditures (CAPEX) cost p-cycle protection scheme is proposed withoutcandidate cycle enumeration. Specifically, path-length-limited p-cycles are designed touse appropriate line rate depending on the transponder cost and transmission reach.A Mixed Integer Linear Programming (MILP) model is formulated to directly generate the optimal p-cycles with the minimum CAPEX cost. Additionally, Graph Partitioning in Average (GPA) algorithm and Estimation of cycle numbers (EI) algorithm are developed to make the proposed MILP model scalable, which are shown to be efficient.Regarding the power consumption in survivable Elastic Optical Networks (EONs),power-efficient directed p-cycle protection scheme for asymmetric traffic is proposed.Owing to the advantage of distinguishing traffic amount in two directions, directedp-cycles consume low power by allocating different Frequency Slots (FSs) and modulation formats for each direction. An MILP model is formulated to minimize total power consumption under constraints of directed cycle generation, spectrum assignment,modulation adaptation and protection capacity allocation. To increase the scalability, the MILP model is decomposed into an improved cycle enumeration and a simplified Integer Linear Programming (ILP) model. We have shown that the directedp-cycles out perform the undirected p-cycles in terms of power consumption and spectrum usage.In order to improve the spectrum usage efficiency in p-cycle protection, a SpectrumShared p-cycle (SS-p-cycle) protection is proposed for survivable EONs with and without spectrum conversion. SS-p-cycles permit to reduce spectrum usage and Spectrum Fragmentation Ratio (SFR) by leveraging potential spectrum sharing among multiplep-cycles that have common link(s). The ILP formulations are designed in both cases of with and without spectrum conversion to minimize the spectrum usage of SS-p-cycleswhich can obtain the optimal solution in small instance, and a time-efficient heuristic algorithm is developed to solve large-scale instances. Simulation results show that SSp-cycles have significant advantages on both spectrum allocation and defragmentation efficiency, and the spectrum conversion does help SS-p-cycle design to acquire better spectrum utilization.