L'autophagie est importante pour le recyclage et la mobilisation des éléments nutritifs dans les plantes. Plusieurs lignées sur-exprimant les gènes AtATG8a-i d’Arabidopsis ont été sélectionnées afin de déterminer l'effet de l'augmentation de l'activité autophagique sur l'efficacité de la remobilisation de l'azote. Les lignées sur-expresseur ont présenté une meilleure remobilisation de l'azote des feuilles de la rosette jusqu'aux graines qque le contrôle, mais uniquement dans des conditions de culture en nitrate pléthorique. Les lignées sur-exprimant ATG8a et ATG8g ont été les plus performantes. Une vaste collection de mutants atg, comprenant les mutants atg8a-i, a ensuite été utilisée pour mesurer la remobilisation de l’azote des rosettes, aux tiges et aux semences, afin de déterminer quels gènes ATG sont essentiels pour la remobilisation. Une attention particulière a été accordée à la famille de gènes ATG8a-i afin de déterminer si un membre de la famille ATG8 pourrait être plus spécifiquement dédié au recyclage de l'azote lors de la sénescence des feuilles pour la remobilisation. Bien que les divers mutants atg8 n’aient pas présenté de différence majeure par rapport au sauvage, l'un d'entre eux a montré un léger phénotype de sénescence précoce, suggérant que cette isoforme pourrait être plus spécialisée dans la remobilisation de l'azote. Afin d'améliorer l'activité de l'autophagie chez l'orge, nous avons surexprimé HvATG5 chez l'orge et testé la sensibilité des sur-expresseurs à plusieurs conditions de stress. Nous avons constaté que les sur-expresseurs de HvATG5 étaient plus tolérants à une faible alimentation en nitrate, à une faible teneur en soufre, et surtout moins sensibles aux effets de l'obscurité prolongée. Afin d'estimer les rôles respectifs des protéases induites par la sénescence et de l'autophagie, plusieurs mutants de protéase (sag12, rd21A, cathB3) ont été croisés avec des mutants d'autophagie (atg5, atg7. Leur contribution à la remobilisation de l'azote a été mesurée par marquage 15N. / Autophagy is important for nutrient recycling and mobilization in plants. Several Arabidopsis AtATG8a-i overexpressing lines were selected in order to determine the effect of increasing autophagy on nitrogen remobilization efficiency. The overexpressing lines remobilized more nitrogen from the rosette leaves to the seeds but only when cultivated under high nitrate conditions. The lines overexpressing ATG8a and ATG8g were the most performant. A large collection of atg mutants including the atg8a-i mutants was then used to monitor N-remobilization from the rosettes to the stems and seeds in order to determine which ATG genes are essential for N remobilization. A special focus was dedicated to the ATG8a-i gene family in order to determine whether a member of the ATG8 family could be more specifically dedicated to N-recycling during leaf senescence for remobilization. Although the various atg8 mutants were not different from wild-type, one of them presented slight early senescence phenotype, suggesting this isoform could be more specialized in N remobilization. In order to enhance autophagy activity in barley, we overexpressed HvATG5 in barley and tested sensitivity of over-expressors to several stress conditions. We found that barley HvATG5 over-expressors were more tolerant to low nitrate supply, to low sulfur, and especially less sensitive to dark-stress effects. In order to estimate the respective roles of autophagy and senescence induced proteases, several protease mutants (sag12, rd21A, cathB3) were crossed with autophagy mutants (atg5, atg7) in order to monitor their respective contributions to nitrogen remobilization.

L'azote est une ressource importante pour la croissance des plantes, et pour les pathogènes des cultures. L'objectif de cette thèse est de proposer une modélisation mécaniste des dynamiques d'azote dans une plante de blé en post-floraison. Pour cela, une approche structure-fonction a été mise en oeuvre. Des expérimentations ont permis de caractériser les dynamiques spatio-temporelles d'azote dans la tige feuillée. La masse d'azote surfacique des limbes et des gaines diminuait avec la distance depuis le sommet du couvert, mais elle était homogène le long d'un limbe ou d'une gaine. Les dynamiques temporelles étaient identiques pour les gaines et les limbes suggérant que ces deux entités répondent de la même manière à la lumière interceptée et à l'état azoté de la plante. De plus, les dynamiques étaient synchrones pour tous les phytomères et identiques à un facteur d'échelle près. En période d'absence d'absorption d'azote racinaire, ces dynamiques suivaient une cinétique d'ordre un. Ces résultats ont permis de développer un modèle structure-fonction des dynamiques d'azote au sein de la structure botanique d'une tige feuillée. Les principales hypothèses de ce modèle sont: (i) la teneur en azote d'un limbe est déterminée par le turnover des protéines de l'appareil photosynthétique; (ii) les différentes entités de la tige feuillée partagent un pool commun d'azote mobile. Ce modèle a été validé sur une gamme contrastée de conditions environnementales avec un jeu unique de six paramètres. Les relations azote-éclairement sont une propriété émergente des processus décrits à l'échelle locale. Ce travail ouvre des perspectives pour simuler la régulation des dynamiques d'azote dans des modèles individus-centrés de peuplements végétaux.