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Building networks of sexual partners. Application for the study of the transmission dynamics of Human Papillomavirus (HPV)Sánchez Alonso, Víctor 29 July 2019 (has links)
[ES] Desde tiempos inmemorables en la historia de la humanidad las enfermedades de transmisión sexual (ETSs) han sido una gran amenaza para la salud pública. Las preocupaciones comienzan en la edad moderna con pandemias tales como la sífilis, cuya propagación ocurre en Europa a comienzos del siglo XVI.
El virus de papiloma humano (VPH) es la causa directa de más de medio millón de casos nuevos de cáncer de cuello de útero, el segundo más maligno entre mujeres y una de las principales causas de muerte por cáncer en todo el mundo. Además causa verrugas anogenitales y otras enfermedades relacionadas.
En este trabajo estudiamos el contagio del VPH en una red de contactos sexuales. Para predecir la evolución de este tipo de enfermedades, necesitamos un modelo fiable de la red social subyacente sobre el que la infección prolifera. Hemos construido una red de parejas sexuales durante toda la vida basada en datos demográficos y encuestas sobre hábitos sexuales.
La mayoría de los enfoques para modelizar ETSs por lo general y del VPH en particular, se hacen usando modelos clásicos donde la hipótesis de mezcla homogénea (todo el mundo puede transmitir a todo el mundo) es asumida de manera implícita. Sin embargo, la mezcla homogénea no es una hipótesis razonable y las consecuencias de estas suposiciones se ven de hecho, en que los efectos de los calendarios de vacunación contra el VPH se detectan en Australia mucho antes de lo que los modelos clásicos predijeron.
Hay un debate sobre la conveniencia de la vacunación de los niños. Elbasha et al. encontraron evidencias de que la vacunación en niños podría llegar a ser coste-efectiva. En nuestro modelo consideramos poblaciones tanto de hombres que solo tienen relaciones con mujeres y que las tienen entre ellos, permitiéndonos sacar conclusiones al respecto. Con nuestro modelo simulamos y llevamos a cabo campañas de vacunación de modo que podemos sacar conclusiones atendiendo a las mejores estrategias. Estos resultados pueden ayudar a los responsables de Salud Pública a tomar decisiones apropiadas con respecto al VPH. / [CAT] Des de temps inmemorables en la història de la humanitat les malalties de transmissió sexual (MTSs) han sigut una gran amenaça per a la salut pública. Les preocupacions comencen en l'edat moderna amb pandèmies com ara la sífilis, la propagació de la qual ocorre a Europa al començament del segle XVI.
El virus de papilloma humà (VPH) és el causant directe de més de mig milió de casos nous de càncer de coll d'úter, el segon mes maligne entre dones i una de les principals causes de mort per càncer en tot el món. A més causa berrugues anogenitales i altres malalties relacionades.
En este treball estudiem la dinàmica de transmissió del VPH en una xarxa de contactes sexuals. Per a predir l'evolució d'este tipus de malalties, necessitem un model fiable de la xarxa social subjacent sobre la qual la infecció prolifera. Hem construït un xarxa de parelles sexuals durant tota la vida basada en dades demogràfiques i enquestes sobre hàbits sexuals.
La majoria dels enfocaments per a modelizar MTSs generalment i del VPH en particular, es fan usant models clàssics on la hipótesi de mescla homogènia (tot el món pot transmetre a tot el món) és assumida de manera implícita. No obstant això la mescla homogènia no és una hipòtesi raonable i les conseqüències d'estes suposicions es veuen de fet, en que els efectes dels calendaris de vacunació contra el VPH es detecten a Austràlia molt abans del que els models clàssics van predir. / [EN] Sexually transmitted diseases (STDs) have been a major public health threat for a long time in human history. Modern concerns about STD began with the pandemic of syphilis which spread over Europe in the early sixteenth century.
The human papillomavirus (HPV) is the direct cause of more than half million new cases of cervical cancer, the second most common malignancy among women and a leading cause of cancer death worldwide. It also causes anogenital warts and other related diseases.
In this work we have studied the transmission dynamics of HPV over a sexual contacts network. In order to predict the evolution of these kind of diseases, we need a reliable model of the underlying social network in which the infection spreads. We have built a lifetime sexual partners (LSP) network based on demographic data and surveys about sexual habits.
Most of the modeling approaches to STD in general and HPV in particular, are done using classical models where the hypothesis of homogeneous mixing (everybody can transmit a disease to everybody) is assumed. However, homogeneous mixing is not a reasonable hypothesis and consequences of this assumption can be seen, for instance, in that the effects of vaccination schedules against HPV have been detected in Australia much sooner than what the classical models predicted.
There is a debate concerning the vaccination of young men. Elbasha et al. found some evidences that the vaccination of boys could also be cost-effective. In our model we consider both heterosexual men, and men who have sex with men (MSM) populations and the connections among them letting us to study this matter. With our model simulate and carry out vaccination campaigns in order to figure out the best strategies. All these results can be useful for policy makers in Public Health to make appropriate decisions respect to HPV. / Sánchez Alonso, V. (2019). Building networks of sexual partners. Application for the study of the transmission dynamics of Human Papillomavirus (HPV) [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/124344 / TESIS
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Modeling Risk for Sexually Transmitted Infections in Women in a Court-Ordered Substance Treatment ProgramDeavers, Frances 01 January 2014 (has links)
Developing a comprehensive model of Sexually Transmitted Infection (STI) risk factors and their inter-relationships is vital to improving methods of risk identification and treatment delivery. The CDC posed three general categories that may serve as a framework for such a model: sexual network, individual behavior, and social/ structural risk. None of the extant risk models incorporate measures from all three categories. Additionally, none of these models, generally focused on individual behavior, use medical data on infection as their outcome variable. This is problematic because the ultimate outcome of infection is also influenced by sexual network and social/ structural variables, in addition to individual behaviors. Therefore the current study aimed to develop a comprehensive model of risk incorporating sexual network, individual behavior, and social/ structural risk variables, using medical data on infection status as the outcome variable. The sample consisted of 506 women in a court-ordered substance treatment program. An Exploratory Factor Analysis provided preliminary evidence for a three factor model corresponding to the CDC framework. However, a Confirmatory Factor Analysis failed to confirm this model. Additionally, a logistic regression suggested that this model has limited clinical utility for this sample. Future studies may more conclusively determine the importance of various STI risk variables, the relationships between them, and whether they mirror the CDC theoretical framework. With rates of infection still high in the United States, and even increasing among women for certain STIs, this is a critical public health issue that should continue to be examined.
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In Atlantic salmon, space use of potential breeders stabilises population dynamics and shapes sexual selection. / L’utilisation de l’espace par les potentiels reproducteurs stabilise la dynamique de la population et façonne la sélection sexuelle chez le saumon Atlantique.Bouchard, Colin 14 December 2018 (has links)
La fragmentation des habitats ainsi que la réduction de leur disponibilité sont des menaces importantes pour les écosystèmes, notamment aquatiques. La disponibilité et la qualité des sites de fraie du saumon Atlantique peut donc être limitante dans certaines rivières. Après la migration en rivière, les femelles saumon vont chercher à s'établir dans un des sites de fraie disponibles. La distribution spatiale des femelles va alors influer sur la distribution spatiale des mâles reproducteurs qui vont chercher soit à monopoliser plusieurs femelles (pour les mâles dominants), soit à les approcher en adoptant un comportement "furtif" (pour les mâles satellites). L'accès des mâles aux femelles va donc dépendre de la distribution spatiale des femelles et des déplacements des mâles dans la rivière. La distribution des femelles va également jouer sur la distribution spatiale des juvéniles, les concentrant à certains endroits. Cette concentration peut augmenter la mortalité densité-dépendante qui modifie la dynamique de la population. Cette thèse avait pour but d'évaluer comment l'utilisation de l'espace des potentiels reproducteurs, c'est à dire les individus matures, influence la dynamique de la population et la sélection sexuelle.Des séries temporelles de stock (oeufs déposés) et de recrutement (juvéniles) pour la population de saumon de la Nivelle ont été associées à des mesures de l'agrégation spatiale des nids creusés par les femelles. L'effet des déplacements et de la distribution des reproducteurs sur leur participation à la reproduction a notamment été testé via la reconstruction du réseau d'interactions sexuelles dans la Nivelle.J'ai ainsi démontré que l'agrégation spatiale des nids influa sur la variabilité du recrutement mais pas sur le recrutement moyen. Cette agrégation qui résulte de l'agrégation des femelles a également été liée au nombre de reproducteurs ayant engendrés des juvéniles. Le réseau d'interactions sexuelles a permis de mettre en évidence une structure sociale locale au sein de la population. Cette structure et les compétiteurs présents pouvaient par exemple diminuer le succès reproducteur des mâles. Notamment, les tacons matures qui participent à la reproduction avant de migrer en mer renforçaient la compétition sexuelle dont les mâles dominants faisaient l'objet. Enfin, ces mêmes tacons matures adoptèrent des comportements spatiaux du fait de leur statut de maturité avec des individus bougeant peu et des individus se déplaçant vers l'amont. Ces comportements spatiaux influaient leur participation à la reproduction, l'étendue des domaines de vie et les déplacements vers l'amont augmentaient la probabilité de rencontrer une femelle.Mes résultats m'ont permis de mettre en évidence l'effet de l'utilisation de l'espace des potentiels reproducteurs sur la dynamique de la population et sur la sélection sexuelle. Ainsi, en combinant différentes échelles spatiales et temporelles il a été montré que l'agrégation des femelles pouvait être bénéfique pour la dynamique de la population. Il semble que les femelles tendent à s'agréger d'abord sur les meilleurs sites de fraie avec une plus forte stabilité environnementale. Cette distribution des femelles affecta la capacité des mâles à monopoliser plusieurs femelles, une agrégation modérée permettant une monopolisation. La participation des mâles furtifs anadromes ou tacons matures était également dépendante de l'agrégation des femelles. Il apparait que la disponibilité d'habitats adéquats pour la reproduction semble limitante dans la Nivelle et notamment du fait de la présence de barrages. Ce manque semble affecter le système d'appariement de la population et la sélection sexuelle y opérant. Des mesures visant à améliorer la qualité des sites de fraie déjà disponibles ainsi que leur accessibilité pourraient être envisagées. / Habitat fragmentation and reduction in the availability of suitable habitats are significant threats to ecosystems in particularly for freshwater ones. For instance, accessibility, availability, and quality of breeding sites of Atlantic salmon, \textit{Salmo salar}, can be restricting in some rivers due to human activities and dams. Such threats may affect distribution of potential breeders because after their up-river migration, salmon females distribute within available breeding sites. Spatial distribution of females determines the spatial distribution of breeder males. Dominant males try to monopolise several females, whereas subordinate males adopt a sneaky behaviour. Access to females by males depends on the spatial distribution of females and on males' displacements within a river. The spatial distribution of females generates the spatial distribution of juveniles, aggregating them at some breeding sites. The latter aggregation of juveniles may raise the density-dependent mortality with potential consequences on population dynamics. The thesis aims to assess how space use of potential breeders, namely mature individuals able to spawn or fertilise eggs, influence population dynamics and sexual selection.I combined different approaches and different temporal and spatial scales to potential effects of space use of potential breeders. Time series of stock (deposited eggs) and of recruitment (juveniles) for the salmon population of the Nivelle River were combined with measures of spatial aggregation of nests. The effects of displacements and spatial distribution of potential breeders on their participation in reproduction were tested through inferring the sexual network of the population.I found that spatial aggregation of nests improved the recruitment variability but did not affect the average recruitment. The spatial aggregation of nests resulting from female aggregation was also linked to the number of effective breeders through a U-shaped curve. Such relationships suggested mate monopolization dependent on the spatial aggregation of females. The negative effect of the spatial isolation of females on their number of mates also suggest such mate monopolization. Then, the inferred sexual network enabled me to highlight a local social structure within the population. The latter structure and social competitors impacted the reproductive success of anadromous males. The participation of mature parr was one of the factors diminishing the sexual competition faced by anadromous males. Finally, mature parr were more mobile and moved more upstream than immature parr. Spatial behaviours of mature parr were linked to their participation in reproduction, individuals exhibiting wider home ranges had a higher probability to encounter females.Altogether my results show that space use of potential breeders affect both population dynamics and sexual selection. Then, spatial aggregation of females and of their nests can be beneficial for population dynamics as shown by combining different temporal and spatial scales. Females seemed to aggregate within the best breeding sites with a better environmental stability. The spatial distribution of females affected the ability of males to monopolise several females and participation of sneaky males. The availability of suitable good breeding habitats seemed restricting in the Nivelle, potentially due to the presence of impassable upstream dams. The lack of suitable breeding sites seemed impacting the mating system of the population and the sexual selection operating in. Some management actions to improve the quality of breeding sites and their availability could be planned.
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