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Diversidade de microrganismos no trato intestinal e res?duos digestivos de Trigoniulus Corallinus (GERVAIS) (DIPLOPODA, SPIROBOLIDA, PACHYBOLIDAE). / Diversity of microorganisms in the gut and food waste of Trigoniulus corallinus (GERVAIS) (DIPLOPODA, SPIROBOLIDA, PACHYBOLIDAE).Passos, Samuel Ribeiro 23 February 2010 (has links)
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2010 - Samuel_Ribeiro_Passos.pdf: 16768295 bytes, checksum: 38c2614ad26085e9a101652551af84b5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-05T14:54:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2010-02-23 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior, CAPES, Brasil. / The increasing demand for biological processes alternative, environmentally friendly and
efficient in converting lignocellulosic material, expanding their application potential for
agribusiness, motivates researches worldwide. Thus, organisms isolated in nature, in specific
ecosystems, become increasingly important because of their physiological and metabolic
diversity, which gives them a great potential in the development of biotechnological processes
of interest to society. The aim of this study was to assess the microbial community associated
with the intestinal tract of millipede Trigoniulus corallinus and bioprospecting for
microorganisms with cellulolytic capacity. The millipedes were collected and incubated with
litter in diets of grass (Paspalum notatum) and ?sabia? (Mimosa caesalpinifolia). Sampling
occurred at 15, 30, 45, and 75 days of incubation. The intestinal tract of five individuals was
removed, sectioned the posterior third, processed and stored in ultrasound. DNA from
microbes associated with the intestinal tract, litter and coprolite was extracted, and DGGE
analysis using 16S rDNA, DGGE group actinomycetes, and it was evaluated the presence of
nifH genes. The 16s gene analysis by DGGE revealed a microbial diversity conditioned by the
diet offered to 45 days. After this period, this effect was no longer visible. The community
associated with coprolites and the type of litter was distributed in separate clusters of samples
from the intestinal tract. This effect was not observed in the community assessment of
actinomycetes, where the big difference for division of groups was the diet. The animals fed
on grass litter showed a diverse community, and they were not influenced by time or
compartmentalization. The samples associated with litter and coprolites were 80% similar to
samples from the intestinal tract. In millipedes fed with material form Mimosa caesalpinifolia,
the result was different, the samples of litter and coprolites where 50% similar to the intestinal
tract. All samples had nifH genes detected by polymerase chain reaction. Samples collected at
45 days were also inoculated in mineral minimum medium of Busnell-Hass added carboxymethyl-cellulose (CMC) as sole carbon source. Colonies were evaluated for their ability to
breakdown cellulose enzyme and 15 had an index greater than 1. The isolate that showed the
highest rate (3.65) was subjected to further analysis. The microscope observation suggested
that this was not an isolated but a complex of microorganisms acting on the degradation of
cellulose. There is evidence of BNF in the intestinal tract of the millipede and microorganisms
proliferated in CMC through the proper amplification of nifH genes and proliferation in
medium within nitrogen. The community of prokaryotes was influenced by the diet offered to
the community up to 45 days, and the actinomycetes community was conditioned by the diet.
It was possible to isolate microorganisms and complexes of microorganisms with cellulolytic
capacity, with great potential in the search for environmentally friendly technologies in
generating agrobioenergy. / A crescente demanda por processos biol?gicos alternativos, ambientalmente favor?veis e
eficientes na transforma??o de material ligninocelul?sico, ampliando seu potencial de
aplica??o agroindustrial, estimula pesquisas em todo o mundo. Assim, microrganismos
isolados na natureza, em ecossistemas espec?ficos, tornam-se cada vez mais importantes pela
sua diversidade metab?lica e fisiol?gica, que lhes confere grande potencialidade no
desenvolvimento de processos biotecnol?gicos de interesse ? sociedade. O objetivo deste
trabalho foi avaliar a comunidade microbiana associada ao trato intestinal do dipl?pode
Trigoniulus corallinus e a bioprospec??o de microrganismos com capacidade celulol?tica. Os
dipl?podes foram coletados e incubados em dietas com serrapilheira de grama batatais
(Paspalum notatum) e sabi? (Mimosa caesalpinifolia). As amostragens aconteceram aos 15,
30, 45 e 75 dias de incuba??o. O trato intestinal de cinco indiv?duos foi removido e
seccionado o ter?o posterior tratado em ultrasom e estocado. Procedeu-se a extra??o de DNA
da microbiota associada ao trato intestinal, serrapilheira e copr?lito, com an?lise por DGGE
utilizando o gene 16S rDNA, DGGE para grupo actinomicetos e avalia??o da presen?a de
genes nifH. A an?lise do gene 16s por DGGE revelou diversidade microbiana condicionada
pela dieta oferecida at? os 45 dias. Ap?s este per?odo o efeito n?o foi mais vis?vel. A
comunidade associada aos copr?litos e ao tipo de serrapilheira distribui-se em grupamentos
separados das amostras oriundas do trato intestinal. O mesmo n?o foi observado na avalia??o
da comunidade de actinomicetos, onde o grande diferencial para divis?o de grupos foi a dieta.
Os animais alimentados com serrapilheira de grama mostraram uma comunidade diversa e
n?o influenciada pelo tempo ou compartimentaliza??o. As amostras associadas ? serrapilheira
e aos copr?litos foram 80% similares ?s do trato intestinal. Nos dipl?podes alimentados com
sabi?, o resultado foi diferente, sendo as amostras de serrapilheira e copr?litos 50% similares
?s do trato intestinal. Todas as amostragens tiveram genes nifH detectados via PCR. Amostras
coletadas aos 45 dias foram tamb?m inoculadas em meio mineral m?nimo de Busnell-Hass
adicionado de carboxi-metil-celulose (CMC) como ?nica fonte de carbono. Os microrganismos isolados foram avaliados quanto ? capacidade de degrada??o de celulose e 15
apresentaram ?ndice enzim?tico maior que 1. O isolado com o maior ?ndice (3,65) foi alvo de
outras an?lises. A visualiza??o em microsc?pio sugeriu que n?o se tratava de um isolado e
sim de um complexo de microrganismos atuando na degrada??o da celulose. H? evidencias de
FBN no trato intestinal do dipl?pode e microrganismos proliferados em meio CMC pela boa
amplifica??o de genes nifH e prolifera??o em meio com aus?ncia de nitrog?nio. A
comunidade de procariotos foi influenciada pela dieta oferecida at? os 45 dias e a comunidade
de actinomicetos foi condicionada em fun??o da dieta. Foram isolados microrganismos e
complexos de microrganismos com capacidade celulol?tica, com grande potencial para a
busca de tecnologias ambientalmente sustent?veis na gera??o de agrobioenergia.
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Gluconato de Sódio e fontes de metionina sobre o desempenho, morfometria intestinal e excreção de nitrogênio de poedeiras comerciaisMarchizeli, Patrícia de Cassia Andrade [UNESP] 22 May 2009 (has links) (PDF)
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marchizeli_pca_me_jabo.pdf: 379771 bytes, checksum: 4ab368a5eecf24097fb6ff931d682d28 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O presente estudo teve por objetivo avaliar o efeito do uso do gluconato de sódio e duas fontes de metionina em rações com diferentes níveis de metionina + cistina sobre o desempenho, qualidade dos ovos, integridade da mucosa intestinal e a excreção de nitrogênio de poedeiras comerciais. Foram utilizadas 480 poedeiras da linhagem Isa Brown, distribuídas em um delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial 5 x 2 (5 níveis de metionina+cistina com 2 níveis de gluconato de sódio), e para estudar o efeito do gluconato de sódio sobre as duas fontes de metionina estudadas, optou-se por um esquema fatorial 2 x 2 (dois níveis de gluconato de sódio e duas fontes de metionina), com 5 repetições de 8 aves cada. As variáveis foram submetidas à análise de variância e posteriormente (em caso de significância estatística <0,001) realizadas análises de regressão pelo modelo polinomial linear e quadrático (SAS, 2002). A exigência de metionina+cistina para o melhor desempenho das poedeiras foram de 0,753% para consumo de ração, 0,738% para a produção de ovos, 0,758% para massa de ovos e 0,703% para conversão alimentar. As fontes de metionina não revelaram diferenças estatísticas. Conclui-se que o uso do gluconato de sódio não expressou resultado significativo estatisticamente nas variáveis analisadas, no entanto, a produção e massa de ovos, a conversão alimentar e a integridade intestinal mostraram-se com tendência de melhora. / One experiment was conducted to evaluate the effect of sodium gluconate and two sources of methionine and different levels of methionine + cistyne in laying hens diets, one egg quality, intestinal mucosal integrity and nitrogen excretion. It was used 480 Isa Brown laying hens, distributed at range in a factorial design 5 x 2 (5 levels of methinine + cistyne with 2 levels of sodium gluconate), and to study the effect of sodium gluconate on two sources of methionine, it was chosen a factorial design 2 x 2 (two levels of sodium gluconate and two sources of methionine), with 5 repetitions of 8 hens each. Variables was submitted to analyses of variance and subsequent (when the test had significant effect < 0,001) related regression analyses by linear and quadratic polynomial model (SAS, 2002). The requirement of methionine + cistyne for better performance of laying hens were 0,753% for feed intake, 0,738% for eggs production, 0,758% for egg mass and 0,703% for feed conversion. The sources of methionine did not show statistical difference. It was concluded that the use of sodium gluconate did not expressed significant statistical result in variables analyzed, however, egg production and mass, feed conversion and intestinal mucosal integrity tended to be better.
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Estrutura da comunidade de Bacteria do trato intestinal de frangos suplementados com promotores de crescimento. / Bacteria community structure of the intestinal tract of chickens supplemented of growth promoters.Pedroso, Adriana Ayres 28 July 2003 (has links)
O trabalho objetivou avaliar o efeito de probióticos e antibióticos utilizados como promotores do crescimento sobre o desempenho de frangos de corte e a capacidade dos agentes de alterar o ecossistema intestinal de aves criadas em baterias e sobre piso. Adicionalmente foi estudado o efeito dos probióticos sobre a presença de oocistos na cama das aves. Os antibióticos tiveram sua eficácia, como promotores de crescimento, comprovada para aves criadas sobre piso, mas não em bateria. Foram observadas alterações na estrutura da comunidade de Bacteria no trato intestinal de frangos criados em baterias e sobre piso e suplementados com antibióticos. Não houve evidência de efeito favorável dos probióticos sobre o desempenho e incidência de oocisto na cama das aves. Os probióticos não tiveram a capacidade de colonizar o epitélio intestinal de frangos de corte. Foram observadas discretas modificações na estrutura da comunidade de Bacteria de frangos criados em bateria e sobre piso e suplementados com dietas contendo probióticos. A estrutura da comunidade de Bacteria do intestino delgado de frangos foi modificada em função do ambiente no qual frangos, suplementados com probióticos e antibióticos, foram criados. Frangos isentos de qualquer tipo de promotor de crescimento apresentaram 15 unidades taxonômicas operacionais distintas na microbiota intestinal aderida ao epitélio, predominantemente Lactobacillus e Pseudomonas. / This study was conducted to evaluated the effects of growth promoter probiotic and antibiotics on the perfomance and organ morphometry of broiler chickens raised in floor pens and in batteries and the ability of the additive to promote changes in the intestinal ecosystem. Additionally, the effect of probiotics on the presence of coccidia oocysts in the litter was evaluated. The efficacy of antibiotics as growth promoters was observed when the chickens were raised in floor pens but not in batteries. Antibiotic supplementation caused changes in the structure of Bacteria community of the intestinal tract of chicken raised in floor pens or in batteries. The probiotic additives tested did not result in improvement in performance in both environmental or in oocyst incidence in the litter. Also, the probiotic did not have the ability to colonize the intestinal epithelium of the birds. Discrete changes in the structure of Bacteria community were observed when probiotics were supplemented to chickens raised in floor pens or in batteries. Bacteria community structure in the small intestine of chicken was modified as a function of the environmental in which the birds were raised. Chicken fed diets devoid of growth promoters had 15 distinct phylogenetic groups in the microbiota adhered to the intestinal epithelium.
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Estrutura da comunidade de Bacteria do trato intestinal de frangos suplementados com promotores de crescimento. / Bacteria community structure of the intestinal tract of chickens supplemented of growth promoters.Adriana Ayres Pedroso 28 July 2003 (has links)
O trabalho objetivou avaliar o efeito de probióticos e antibióticos utilizados como promotores do crescimento sobre o desempenho de frangos de corte e a capacidade dos agentes de alterar o ecossistema intestinal de aves criadas em baterias e sobre piso. Adicionalmente foi estudado o efeito dos probióticos sobre a presença de oocistos na cama das aves. Os antibióticos tiveram sua eficácia, como promotores de crescimento, comprovada para aves criadas sobre piso, mas não em bateria. Foram observadas alterações na estrutura da comunidade de Bacteria no trato intestinal de frangos criados em baterias e sobre piso e suplementados com antibióticos. Não houve evidência de efeito favorável dos probióticos sobre o desempenho e incidência de oocisto na cama das aves. Os probióticos não tiveram a capacidade de colonizar o epitélio intestinal de frangos de corte. Foram observadas discretas modificações na estrutura da comunidade de Bacteria de frangos criados em bateria e sobre piso e suplementados com dietas contendo probióticos. A estrutura da comunidade de Bacteria do intestino delgado de frangos foi modificada em função do ambiente no qual frangos, suplementados com probióticos e antibióticos, foram criados. Frangos isentos de qualquer tipo de promotor de crescimento apresentaram 15 unidades taxonômicas operacionais distintas na microbiota intestinal aderida ao epitélio, predominantemente Lactobacillus e Pseudomonas. / This study was conducted to evaluated the effects of growth promoter probiotic and antibiotics on the perfomance and organ morphometry of broiler chickens raised in floor pens and in batteries and the ability of the additive to promote changes in the intestinal ecosystem. Additionally, the effect of probiotics on the presence of coccidia oocysts in the litter was evaluated. The efficacy of antibiotics as growth promoters was observed when the chickens were raised in floor pens but not in batteries. Antibiotic supplementation caused changes in the structure of Bacteria community of the intestinal tract of chicken raised in floor pens or in batteries. The probiotic additives tested did not result in improvement in performance in both environmental or in oocyst incidence in the litter. Also, the probiotic did not have the ability to colonize the intestinal epithelium of the birds. Discrete changes in the structure of Bacteria community were observed when probiotics were supplemented to chickens raised in floor pens or in batteries. Bacteria community structure in the small intestine of chicken was modified as a function of the environmental in which the birds were raised. Chicken fed diets devoid of growth promoters had 15 distinct phylogenetic groups in the microbiota adhered to the intestinal epithelium.
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