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Análise da variabilidade e estruturação genética do tubarão azul, Prionace glauca (Chondrichthyes, Carcharhinidae) no Oceano Atlântico Sul Ocidental utilizando marcador molecular do DNA mitocondrial /

Teixeira, Aline Freire. January 2011 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: Otto Bismarck Gadig / Banca: Paulo Guilherme Vasconcelos de Oliveira / Banca: Claudio Oliveira / Resumo: O tubarão azul, Prionace glauca, é considerado a espécie de elasmobrânquio encontrada em maior abundância, com ampla distribuição geográfica, alta taxa de natalidade e de rápido crescimento. Entretanto, também é a espécie mais explorada na pesca oceânica em nível mundial, o que tem levado a desequilíbrios estruturais das populações e aumentado as possibilidades de risco para a espécie. Em avaliações sobre o estado de conservação da espécie, realizadas no Brasil e também de maneira global, P. glauca foi classificada como "quase ameaçada". Para o setor pesqueiro, a identificação de estoques diferenciados constitui informação fundamental pela sua relação direta com a produtividade total e uso sustentável dos recursos. A diferença nas freqüências de haplótipos de DNA entre amostras geográficas pode ser usada para estimar indiretamente padrões de diferenciação e de fluxo gênico e, portanto, a estrutura genética das amostras. Este trabalho utilizou amostras de tecidos musculares e epiteliais de tubarões azuis capturados pela frota pesqueira brasileira no Rio Grande do Sul (n = 38), São Paulo (n = 28) e Rio Grande do Norte (n = 31). Os níveis de variabilidade e estruturação genética nas regiões amostradas foram determinados a partir do sequenciamento da região controle do DNA mitocondrial (D-loop). Para P. glauca, este marcador apresentou 16 sítios polimórficos e 32 haplótipos. Os valores encontrados para diversidade haplotípica e nucleotídica foram, respectivamente, Hd =0,89±0,020 e π=0,00258±0,00013. O teste AMOVA detectou uma moderada estruturação populacional entre as regiões amostradas, com o maior valor de Fst = 0,103. Assim, considera-se para os efeitos de manejo pesqueiro, um único estoque da espécie na costa brasileira. Os níveis de estruturação genética demonstrados... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The blue shark, Prionace glauca, is the most abundant elasmobranch, with widest distribution, high birth rates and faster growth. However, it is also the most exploited species in the ocean fisheries worldwide, which has led to structural imbalances of their population and increased potential risk to the specie. In assessments of the state of conservation of the species, carried out in Brazil and globally, P. glauca was classified as "near threatened" according to IUCN categories. In fisheries, the stock identification are considered very important information due the direct relation with the total productivity and sustainable use of resources. The difference in the frequencies of haplotypes of DNA among geographic samples can be used to indirectly estimate patterns of differentiation and gene flow and thus the genetic structure of stocks. In the present study samples of muscle and epithelial tissues of blue sharks caught by the fishing fleet in Rio Grande do Sul (n = 38), São Paulo (n = 28) and Rio Grande do Norte (n = 31) estates were used. The levels of variability and genetic structure of the sampled regions were determined from the sequencing of mitochondrial DNA control region (D-loop). The use of this marker in P. glauca resulted in 16 polymorphic sites and 32 haplotypes. The nucleotide and haplotype diversity was, respectively, Hd = 0.89 ± 0.020 and π = 0.00258 ± 0.00013. The AMOVA test detected a moderate population subdivision among the sampled regions, with highest value of Fst = 0,103. Similarly, it is considered for the effects of fisheries management, a single stock in the Brazilian coast. The levels of genetic structure demonstrated in the present study, combined with data from fisheries exploitation of the blue shark, indicate the need for greater attention to the preservation of the species in Brazil... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Análise da variabilidade e estruturação genética do tubarão azul, Prionace glauca (Chondrichthyes, Carcharhinidae) no Oceano Atlântico Sul Ocidental utilizando marcador molecular do DNA mitocondrial

Teixeira, Aline Freire [UNESP] 22 July 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-07-22Bitstream added on 2014-06-13T20:00:07Z : No. of bitstreams: 1 teixeira_af_me_botib.pdf: 246482 bytes, checksum: f600cfeeac47a49d85d69a991ad9d920 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O tubarão azul, Prionace glauca, é considerado a espécie de elasmobrânquio encontrada em maior abundância, com ampla distribuição geográfica, alta taxa de natalidade e de rápido crescimento. Entretanto, também é a espécie mais explorada na pesca oceânica em nível mundial, o que tem levado a desequilíbrios estruturais das populações e aumentado as possibilidades de risco para a espécie. Em avaliações sobre o estado de conservação da espécie, realizadas no Brasil e também de maneira global, P. glauca foi classificada como “quase ameaçada”. Para o setor pesqueiro, a identificação de estoques diferenciados constitui informação fundamental pela sua relação direta com a produtividade total e uso sustentável dos recursos. A diferença nas freqüências de haplótipos de DNA entre amostras geográficas pode ser usada para estimar indiretamente padrões de diferenciação e de fluxo gênico e, portanto, a estrutura genética das amostras. Este trabalho utilizou amostras de tecidos musculares e epiteliais de tubarões azuis capturados pela frota pesqueira brasileira no Rio Grande do Sul (n = 38), São Paulo (n = 28) e Rio Grande do Norte (n = 31). Os níveis de variabilidade e estruturação genética nas regiões amostradas foram determinados a partir do sequenciamento da região controle do DNA mitocondrial (D-loop). Para P. glauca, este marcador apresentou 16 sítios polimórficos e 32 haplótipos. Os valores encontrados para diversidade haplotípica e nucleotídica foram, respectivamente, Hd =0,89±0,020 e π=0,00258±0,00013. O teste AMOVA detectou uma moderada estruturação populacional entre as regiões amostradas, com o maior valor de Fst = 0,103. Assim, considera-se para os efeitos de manejo pesqueiro, um único estoque da espécie na costa brasileira. Os níveis de estruturação genética demonstrados... / The blue shark, Prionace glauca, is the most abundant elasmobranch, with widest distribution, high birth rates and faster growth. However, it is also the most exploited species in the ocean fisheries worldwide, which has led to structural imbalances of their population and increased potential risk to the specie. In assessments of the state of conservation of the species, carried out in Brazil and globally, P. glauca was classified as near threatened according to IUCN categories. In fisheries, the stock identification are considered very important information due the direct relation with the total productivity and sustainable use of resources. The difference in the frequencies of haplotypes of DNA among geographic samples can be used to indirectly estimate patterns of differentiation and gene flow and thus the genetic structure of stocks. In the present study samples of muscle and epithelial tissues of blue sharks caught by the fishing fleet in Rio Grande do Sul (n = 38), São Paulo (n = 28) and Rio Grande do Norte (n = 31) estates were used. The levels of variability and genetic structure of the sampled regions were determined from the sequencing of mitochondrial DNA control region (D-loop). The use of this marker in P. glauca resulted in 16 polymorphic sites and 32 haplotypes. The nucleotide and haplotype diversity was, respectively, Hd = 0.89 ± 0.020 and π = 0.00258 ± 0.00013. The AMOVA test detected a moderate population subdivision among the sampled regions, with highest value of Fst = 0,103. Similarly, it is considered for the effects of fisheries management, a single stock in the Brazilian coast. The levels of genetic structure demonstrated in the present study, combined with data from fisheries exploitation of the blue shark, indicate the need for greater attention to the preservation of the species in Brazil... (Complete abstract click electronic access below)
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Crescimento relativo e idade de embriões do Tubarão-Azul, Prionace glauca (Linnaeus, 1758) no Sudeste-Sul do Brasil. / Age and relative growth of the blue shark embryos, Prionace glauca (Linnaeus, 1758) in the southwestern Atlantic.

Caltabellotta, Fabio Prior 06 November 2009 (has links)
O tubarão-azul, Prionace glauca, é uma das espécies de elasmobrânquios pelágicos, mais capturadas pela frota de espinhel-de-superfície. No presente estudo analisou-se o crescimento relativo e a idade de 83 embriões, provenientes de fêmeas grávidas capturadas em 1998, durante o Programa Avaliação do Potencial Sustentável de Recursos Vivos da Zona Econômica Exclusiva REVIZEE, na região Sudeste-Sul do Brasil. Foram analisados 48 caracteres morfométricos, verificando-se que entre as variáveis morfométricas mais expressivas, o comprimento furcal, o comprimento pré-caudal, o comprimento inicial da segunda nadadeira dorsal, o comprimento pré-anal e o comprimento pré-pélvico contribuíram com valores acima de 50% na composição do corpo do embrião. Por meio de regressões lineares de variáveis logaritmizadas, constatou-se alometria negativa em (53,2%), positiva em (36,1%) e isometria em (10,7%) dos caracteres morfométricos analisados. A idade de cada embrião foi estimada por meio da utilização do método da proporção direta modificada de Dahl-Lea, e os parâmetros de crescimento foram ajustados através das curvas de crescimento logística, de von Bertalanffy e de Gompertz. De acordo com os critérios de seleção de Akaike (AICmin, i e wi) e da soma dos quadrados dos erros (SQE), o modelo de Gompertz foi escolhido como o melhor representante do crescimento embrionário de P.glauca. / The blue shark, Prionace glauca, is a pelagic elasmobranchs, mainly captured by the Brazilian pelagic longline fleet. In this study we analyzed both the relative growth and the age of 83 of pregnant females captured in 1998 during the Program \"Evaluation of the Sustainable Potential of Living Resources of the Exclusive Economic Zone\" - REVIZEE in the Brazilian Southeast-South region. We analyzed 48 morphometric characters, showing that among the most expressive, fork length, the length pre-flow, the initial length of the second dorsal fin, the length pre-anal and the length pre-pelvic represented above 50% of the composition of the embryos bodies. By means of linear regressions of logarithmic morphometric variables values, we found negative allometry (53.2%), positive allometry (36.1%) and isometry in (10.7%). The age of each embryo was estimated applying the direct proportion of Dahl-Lea method modified, and the parameters of growth were adjusted to logistic growth curves of von Bertalanffy and Gompertz. According to the selection criteria of Akaike (AICmin, i and wi) and the sum of the squares of errors (SSE), the Gompertz model was chosen as the most representative of the growth of P.glauca embryos.
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Crescimento relativo e idade de embriões do Tubarão-Azul, Prionace glauca (Linnaeus, 1758) no Sudeste-Sul do Brasil. / Age and relative growth of the blue shark embryos, Prionace glauca (Linnaeus, 1758) in the southwestern Atlantic.

Fabio Prior Caltabellotta 06 November 2009 (has links)
O tubarão-azul, Prionace glauca, é uma das espécies de elasmobrânquios pelágicos, mais capturadas pela frota de espinhel-de-superfície. No presente estudo analisou-se o crescimento relativo e a idade de 83 embriões, provenientes de fêmeas grávidas capturadas em 1998, durante o Programa Avaliação do Potencial Sustentável de Recursos Vivos da Zona Econômica Exclusiva REVIZEE, na região Sudeste-Sul do Brasil. Foram analisados 48 caracteres morfométricos, verificando-se que entre as variáveis morfométricas mais expressivas, o comprimento furcal, o comprimento pré-caudal, o comprimento inicial da segunda nadadeira dorsal, o comprimento pré-anal e o comprimento pré-pélvico contribuíram com valores acima de 50% na composição do corpo do embrião. Por meio de regressões lineares de variáveis logaritmizadas, constatou-se alometria negativa em (53,2%), positiva em (36,1%) e isometria em (10,7%) dos caracteres morfométricos analisados. A idade de cada embrião foi estimada por meio da utilização do método da proporção direta modificada de Dahl-Lea, e os parâmetros de crescimento foram ajustados através das curvas de crescimento logística, de von Bertalanffy e de Gompertz. De acordo com os critérios de seleção de Akaike (AICmin, i e wi) e da soma dos quadrados dos erros (SQE), o modelo de Gompertz foi escolhido como o melhor representante do crescimento embrionário de P.glauca. / The blue shark, Prionace glauca, is a pelagic elasmobranchs, mainly captured by the Brazilian pelagic longline fleet. In this study we analyzed both the relative growth and the age of 83 of pregnant females captured in 1998 during the Program \"Evaluation of the Sustainable Potential of Living Resources of the Exclusive Economic Zone\" - REVIZEE in the Brazilian Southeast-South region. We analyzed 48 morphometric characters, showing that among the most expressive, fork length, the length pre-flow, the initial length of the second dorsal fin, the length pre-anal and the length pre-pelvic represented above 50% of the composition of the embryos bodies. By means of linear regressions of logarithmic morphometric variables values, we found negative allometry (53.2%), positive allometry (36.1%) and isometry in (10.7%). The age of each embryo was estimated applying the direct proportion of Dahl-Lea method modified, and the parameters of growth were adjusted to logistic growth curves of von Bertalanffy and Gompertz. According to the selection criteria of Akaike (AICmin, i and wi) and the sum of the squares of errors (SSE), the Gompertz model was chosen as the most representative of the growth of P.glauca embryos.
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Presença da proteína Indoleamina 2, 3-dioxigenase (IDO) na interface materno-fetal de Prionace glauca (Linnaeus, 1758) / Presence of the protein Indoleamine 2,3- dioxigenase on the materno-fetal interface of Prionace glauca

Salmon, Thierry 09 September 2015 (has links)
O tubarão-azul (Prionace glauca) é uma espécie que apresenta desenvolvimento vivíparo placentário em que o saco vitelino se desenvolve ao longo da gestação tornando-se uma placenta que executa função matrotrófica. A Indoleamina 2,3-dioxigenase (IDO) é uma proteína encontrada em mamíferos nos quais participa, além de outras funções, da tolerância materno-fetal, sendo também encontrada em peixes ósseos. Assim, a proposta deste trabalho foi verificar a expressão da IDO na interface materno-fetal de Prionace glauca e descrever sua localização. Para tanto, material placentário/uterino e embriológico de três fases distintas da gestação (pré-placenta, meia gestação e fim da gestação) de fêmeas de P. glauca foram coletados e processados para a imuno-histoquímica. Os resultados mostraram a presença da IDO ao longo do desenvolvimento do saco vitelino/placenta, na ectoderme nas três fases e na endoderme apenas nas duas primeiras fases. No epitélio uterino observou-se a marcação da IDO nas duas últimas fases. Esses tecidos de interface seriam locais de maior contato entre a mãe e o concepto, fato que poderia levar à indução de uma resposta imunológica contra o concepto semi-alogenêico. A soma destes fatores poderia contribuir como um indício de uma possível atuação da IDO como mecanismo da tolerância materno-fetal na interface placentária de Chondrichtyes, como relatado em mamíferos eutérios / The blue shark (Prionace glauca) is a viviparous placentary species in which the yolk sac develops along pregnancy turning into a placenta with a matrotrofic role. The indoleamine 2 3-dioxygenase (IDO) is a protein usually described in mammals, which, among other functions, participates on the maternal-fetal tolerance process. Although it has also been reported in bony fish, no information is available regarding its function. Therefore, the purpose of this study was to investigate the expression of IDO in blue shark maternal-fetal interface and describe its distribution. Thus, placental / uterine and embryonic materials from three different stages (pre-placenta, middle and late gestation) of pregnant P. glauca females were processed for immunohistochemistry. The results showed IDO labelling during the yolk sac / placenta development in ectoderm along the three development phases and at endoderm only at phases I and II. In uterine epithelium, IDO was observed in the last two phases. These interface tissues are major contact areas between the mother ant the conceptus, that would induce an immunological response against the semialogeneic conceptus.The sum of these factors may contribute as an indication to the possible IDO role as a mechanism of maternal-fetal tolerance in Chondrichtyes placentary interface, as described in eutherian mammals
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Presença da proteína Indoleamina 2, 3-dioxigenase (IDO) na interface materno-fetal de Prionace glauca (Linnaeus, 1758) / Presence of the protein Indoleamine 2,3- dioxigenase on the materno-fetal interface of Prionace glauca

Thierry Salmon 09 September 2015 (has links)
O tubarão-azul (Prionace glauca) é uma espécie que apresenta desenvolvimento vivíparo placentário em que o saco vitelino se desenvolve ao longo da gestação tornando-se uma placenta que executa função matrotrófica. A Indoleamina 2,3-dioxigenase (IDO) é uma proteína encontrada em mamíferos nos quais participa, além de outras funções, da tolerância materno-fetal, sendo também encontrada em peixes ósseos. Assim, a proposta deste trabalho foi verificar a expressão da IDO na interface materno-fetal de Prionace glauca e descrever sua localização. Para tanto, material placentário/uterino e embriológico de três fases distintas da gestação (pré-placenta, meia gestação e fim da gestação) de fêmeas de P. glauca foram coletados e processados para a imuno-histoquímica. Os resultados mostraram a presença da IDO ao longo do desenvolvimento do saco vitelino/placenta, na ectoderme nas três fases e na endoderme apenas nas duas primeiras fases. No epitélio uterino observou-se a marcação da IDO nas duas últimas fases. Esses tecidos de interface seriam locais de maior contato entre a mãe e o concepto, fato que poderia levar à indução de uma resposta imunológica contra o concepto semi-alogenêico. A soma destes fatores poderia contribuir como um indício de uma possível atuação da IDO como mecanismo da tolerância materno-fetal na interface placentária de Chondrichtyes, como relatado em mamíferos eutérios / The blue shark (Prionace glauca) is a viviparous placentary species in which the yolk sac develops along pregnancy turning into a placenta with a matrotrofic role. The indoleamine 2 3-dioxygenase (IDO) is a protein usually described in mammals, which, among other functions, participates on the maternal-fetal tolerance process. Although it has also been reported in bony fish, no information is available regarding its function. Therefore, the purpose of this study was to investigate the expression of IDO in blue shark maternal-fetal interface and describe its distribution. Thus, placental / uterine and embryonic materials from three different stages (pre-placenta, middle and late gestation) of pregnant P. glauca females were processed for immunohistochemistry. The results showed IDO labelling during the yolk sac / placenta development in ectoderm along the three development phases and at endoderm only at phases I and II. In uterine epithelium, IDO was observed in the last two phases. These interface tissues are major contact areas between the mother ant the conceptus, that would induce an immunological response against the semialogeneic conceptus.The sum of these factors may contribute as an indication to the possible IDO role as a mechanism of maternal-fetal tolerance in Chondrichtyes placentary interface, as described in eutherian mammals

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