FAUSTINO, Symonara Karina Medeiros. Prevalência dos subtipos do vírus da imunodeficiência humana do tipo 1 (HIV-1) no Estado do Piauí - Brasil e o perfil de resistência das cepas identificadas. 2011. 124 f. Dissertação (Mestrado em Farmacologia) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2011. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-05-15T16:29:40Z No. of bitstreams: 1 2011_dis_skmfaustino.pdf: 1675532 bytes, checksum: 7046ea7c86ed7c0ae4844ab2a29e06bb (MD5) / Approved for entry into archive by Eliene Nascimento(elienegvn@hotmail.com) on 2012-05-15T16:29:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_dis_skmfaustino.pdf: 1675532 bytes, checksum: 7046ea7c86ed7c0ae4844ab2a29e06bb (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-15T16:29:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_dis_skmfaustino.pdf: 1675532 bytes, checksum: 7046ea7c86ed7c0ae4844ab2a29e06bb (MD5) Previous issue date: 2010 / HIV-1 genetic variability is a wellkown problem that makes diagnosis and treatment difficult to manage. Also, this variability is a problem for trasmission, disease progression and for the development of vaccines, being important to know the subtypes presented in each population worldwilde and in Brazil to provide more effective treatment. The present study have the aim to describe the subtype prevalent in Piauí state, the resistance profile of thouse to antiviral treatment, laboratory exams and the epidemiologic point of view of HIV-1 in Piauí. Samples of blood from 60 patients (HIV-1 positive) were colect at Central Public Laboratory in Teresina/PI, from maio to april 2009. Proviral DNA were isolated and Nested PCR were performed for two genomic regions (pro e tr), being sequenced 37 samples. Analysis to the segment for gene pro, 32 (86,5%) were subtype B and 2 (5,4%) subtype D. For tr segment all samples were subtype B (20). Statistics analysis found a significant association between vírus subtype and drug users, blood transfusion and STD (p < 0,05). Furthermore, the study reveal that even with two subtypes of HIV-1 detected (B e D), a low prevalence of drug resistance was observed to the protease inhibitors (PI) (2,9%; 1/34), nucleosidic reverse transcriptase inhibitor (NRTI) (15%; 3/20) and non nucleosidic (NNRTI) (10%; 2/20). / A variabilidade genética do HIV-1 é reconhecida como um problema em potencial para o diagnóstico e tratamento do HIV/AIDS, assim como para a transmissão, progressão da doença e desenvolvimento de vacinas globalmente efetivas, o que torna importante o monitoramento da distribuição global dos diferentes subtipos de HIV-1 e formas recombinantes circulantes (CRFs) no Brasil. O presente trabalho teve como objetivo descrever a prevalência dos subtipos do HIV-1 circulantes no Estado do Piauí e o perfil de resistência das cepas identificadas aos ARV, assim como verificar possíveis associações entre os subtipos virais e as informações epidemiológicas e laboratoriais da população estudada. As amostras de sangue de 60 pacientes portadores do HIV-1/AIDS foram coletadas no Laboratório Central de Saúde Pública da cidade de Teresina/PI, no período de maio a abril de 2009. Após a extração do DNA proviral, foi realizada a técnica de Nested PCR, para amplificação de duas regiões genômicas (pro e tr), sendo 37 amostras seqüenciadas posteriormente. Em relação à análise do segmento do gene pro, 32 (86,5%) foram do subtipo B e 2 (5,4%) do subtipo D, já em relação ao segmento do gene da tr, todas amostras pertenceram ao subtipo B (20). Na análise estatística foram encontradas associações significantes (p < 0,05) entre os subtipos virais com usuários de drogas endovenosas, transfusão sanguínea e DST. Além disso, verificou-se uma baixa prevalência de cepas com mutações resistentes aos inibidores de protease (IP) (2,9%; 1/34), inibidores de transcriptase reversa nucleosídicos (ITRN) (15%; 3/20) e não nucleosídicos (ITRNN) (10%; 2/20), sugerindo que há baixa circulação de cepas do HIV-1 resistentes aos ARV no estado do Piauí.

Orientador: Clarice Weis Arns / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-11T07:43:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_LucianaHelenaAntoniassida_M.pdf: 1949067 bytes, checksum: 9e01c84eac5d3921b2a96a2cb7cceb31 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: Os membros da família Paramyxoviridae, subfamília Pneumovirinae são vírus envelopados, não-segmentados dotados de genoma de RNA de fita simples com sentido negativo. O vírus Respiratório sincicial humano (hRSV) é o agente viral melhor caracterizado neste grupo, associado à doença do trato respiratório inferior. Recentemente foi identificado um novo patógeno humano pertencente à subfamília Pneumovirinae, o metapneumovírus humano (hMPV), o qual possui similaridades com o hRSV, na sua organização genômica, estrutura viral, antigenicidade e sintomas clínicos. Na primeira parte do presente trabalho o objetivo foi analisar a variabilidade genética dos isolados de hRSV circulantes na região de Campinas, no período de Abril a Setembro de 2004, comparando as seqüências previamente obtidas do gene que codifica as proteínas F e G do vírus com seqüências parciais e completas de gene homólogo de isolados identificados em outros países. A análise filogenética permitiu classificar os isolados de hRSV como pertencentes aos subgrupos A e B. Os isolados pertencentes ao subgrupo A se distribuíram em três genótipos: GA2, GA5 e SSA1. O genótipo SSA1 foi identificado pela primeira vez no sul da África, e existem poucos relatos do mesmo na literatura. As seqüências analisadas dos isolados do subgrupo B foram identificadas em 3 genótipos distintos dentro desse subgrupo, notadamente GB3 (SAB3) e BA (BAIII). Das amostras analisadas no presente estudo, duas foram identificadas como pertencentes ao genótipo BA, os isolados apresentaram a duplicação dos 60nt na posição 781-840 do gene. Na segunda parte da tese o objetivo foi identificar a presença e caracterizar molecularmente o hMPV por seqüenciamento parcial do gene que codifica para a proteína F de amostras coletadas de crianças em dois hospitais universitários na região de Campinas, São Paulo, Brasil. Com base nas seqüências de nucleotídeos do gene F do hMPV, foi identificada a presença do subgrupo B/genótipo B1 em nosso trabalho, semelhante ao que foi relatado em 2004 na Austrália. Nossas amostras apresentaram duas amostras variantes neste mesmo genótipo, com base nas seqüências de nucleotídeos / Abstract: The members of the Paramyxoviridae are enveloped, non-segmented viruses, with negative-sense single stranded genomes. Respiratory syncytial virus (hRSV) is the best characterized agent viral of this group, associated with respiratory diseases in lower respiratory tract. Recently, a new human pathogen belonging to the subfamily Pneumovirinae was identified, the human metapneumovirus (hMPV), which is structurally similar to the hRSV, in genomic organization, viral structure, antigenicity and clinical symptoms. In the first part of the present work the objective is to analyze the genetic variability hRSV isolates circulating in the region of Campinas, in the period April and September 2004, comparing previously obtained sequences from the F and G protein gene of such strains with other partial and complete gene sequences from the homologous genes from isolates identified in other countries. The phylogenetic analysis conducted here allowed us to allocate the isolates belonging to groups A and B. The isolates belonging to the group A showed three clusters, GA2, GA5 and SAA1. The genotype SSA1 was previously identified in South Africa, and there are few reports of such genotype it in the literature. Analyzed sequences belonging to group B were identified in three distinct clusters, GB3 (SAB3) and BA (BAIII). Of the analyzed sequences in the present study, two were identified as belonging to genotype BA the isolates showed 60 nucleotide (nt) duplication at positions 781-840 the gene. In the second part of the thesis the objective was to identify the presence and molecular characterization of hMPV by partially sequencing of the F protein gene in samples collected from children of two university hospitals in the region of Campinas, São Paulo state, Brazil. Based on nucleotide sequences of hMPV F gene, we identified the presence of subgroup B/genotype B1 in our work, similarly to reports in 2004 in Australia. Our samples showed to variants in the same genotype, based on nucleotides sequences / Mestrado / Ciencias Basicas / Mestre em Clinica Medica

Orientador: Danillo Pinhal / Coorientador: Flávia Tores Presti / Banca: Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Alexandra Sanches / Resumo: A arara-azul-grande (Anodorhynchus hyacinthinus), maior psitacídeo do mundo, é uma espécie considerada em vulnerabilidade de extinção (IUCN) principalmente devido à perda de habitat e ao tráfico ilegal. Para estabelecer estratégias que visem a conservação da espécie considerar a composição genética de suas populações é muito importante. Comumente para o estudo da diversidade genética e estrutura genética populacional são utilizados marcadores moleculares que podem ser prospectados no genoma, dentre os quais destacam-se os locos microssatélites. Atualmente, entretanto, não há locos microssatélites polimórficos espécie-específícos identificados em A. hyacinthinus. Esta espécie pode ser encontrada em três regiões possivelmente isoladas, o que evidencia a necessidade de medidas de manejo integradas para a preservação do pool gênico da espécie. Assim, os objetivos principais desse trabalho foram: (i) desenvolver primers para locos microssatélites em A. hyacinthinus, e (ii) analisar a diversidade e a estrutura genética populacional da espécie. Como resultado seis locos espécie-específicos foram prospectados (AnH6, AnH10, AnH17, AnH33, AnH23 e AnH34), dos quais cinco mostraram-se polimórficos em A. hyacinthinus. Além disso, os seis pares de primers mostraram potencial aplicabilidade para estudos populacionais em outras sete espécies de psitacídeos neotropicais. Nas análises populacionais, A. hyacinthinus apresentou um baixo índice de variabilidade genética em comparação à reportada para outros psítacídeos. Esse resultado indica que a baixa variabilidade encontrada não deve ter relação com a utilização restrita de locos heterólogos em trabalhos anteriores, pois foram utilizados tanto locos espécie-específicos quanto locos heterólogos nas análises do presente estudo, sugerindo que esta é uma característica intrínseca da espécie. Além disso, considerando-se a análise de estruturação ... / Abstract: Hyacinth macaw (Anodorhynchus hyacinthinus), the largest parrot in the world, is considered vulnerable to extinction (IUCN) mainly due to habitat loss and illegal trade. To establish strategies for the conservation of the species must be regarded the genetic makeup of their populations. Commonly for the study of genetic diversity and population genetic structure are used molecular markers, highlighting specially the microsatellite loci, which in turn need to be isolated for population studies. However, currently there is no polymorphic microsatellite loci identified in A. hyacinthinus. Additionally, the species is distributed in three apparently isolated areas, thus requiring integrated management in order to preserve the gene pool of the species. Thus, the main objectives of this study were: (i) the development of primers for microsatellite loci in Anodorhyncus hyacinthinus, and (ii) the analysis of the diversity and population genetic structure of all areas of occurrence of the species. Six loci species-specific prospected were obtained (AnH6, AnH10, AnH17, AnH23, AnH33 and AnH34) and five of these primers proved to be polymorphic. In addition, these six pairs of primers showed potential applicability for population studies after they were tested in seven Neotropical parrot species. Regarding the population analyzes using both specific and heterologous loci, A. hyacinthinus presented a low level of genetic variability compared to other parrots, thereby indicating that the low variability found should not be related to the use of only heterologous loci in previous studies, suggesting that this is an intrinsic characteristic of this species. Moreover, considering in the analysis of genetic structure by Bayesian clustering of microsatellite data it could not be found genetic structure between subpopulations of four regions [North Pantanal (NP), South Pantanal (SP), Para (PA) and northeast (NE)]. In contrast, Rst indices indicated ... / Doutor

Orientador: Rosangela Zacarias Machado / Resumo: Anaplasma marginale é uma bactéria, Gram negativa, intracelular obrigatória parasita de eritrócitos e o principal agente da Anaplasmose bovina. Esta doença causa anemia severa, provocando a redução do ganho de peso e da produção de leite e gerando grandes perdas econômicas na pecuária mundial. A diversidade genética desta bactéria vem sendo caracterizada com base na sequência das proteínas de superfície (MSPs), principalmente, na proteína MSP1α, sendo possível identificar as diferentes estirpes geográficas de acordo com as diferenças nas sequências de aminoácidos. O presente estudo teve como objetivo investigar a diversidade genética de A. marginale em bovinos de corte da raça Angus naturalmente infectados durante um surto da enfermidade. Vinte bovinos, com idades entre 6 e 9 meses, oriundos de uma fazenda no município de Itú, estado de São Paulo foram acompanhados por quatro meses e quatro colheitas de sangue foram realizadas. Amostras de soro foram submetidas à Ensaio Imunoenzimático Indireto (iELISA) para detecção de anticorpos IgG anti-A. marginale. As oitenta amostras de sangue total obtidas, foram submetidas à extração de DNA, PCR em tempo real quantitativa (qPCR) para o gene msp1β, semi-nested PCR (snPCR) para o gene msp1α, clonagem do fragmento alvo e sequenciamento pelo método de Sanger. As sequências obtidas foram submetidas à analises de diversidade genética pelo software RepeatAnalyzer. O ensaio Imunoenzimático Indireto (iELISA), utilizando Ag total, revelou baixa... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Anaplasma marginale is a Gram-negative, obligatory intracellular erythrocyte parasite and the main agent of bovine Anaplasmosis. This disease causes severe anemia, causing a reduction in weight gain and milk production and generating major economic losses in livestock worldwide. The genetic diversity of this bacterium has been characterized based on the sequence of surface proteins (MSPs), mainly in the protein MSP1α, making it possible to identify the different geographical strains according to the differences in the amino acid sequences. The present study aimed to investigate the genetic diversity of A. marginale in Angus beef cattle naturally infected during an outbreak of the disease. Twenty cattle, aged 6 to 9 months, from a farm in the city of Itú, state of São Paulo, were followed for four months and four blood samples were taken. Serum samples were subjected to the Indirect Immunoenzymatic Assay (iELISA) to detect antibodies IgG anti-A. marginale. The eighty whole blood samples obtained were subjected to DNA extraction, quantitative real-time PCR (qPCR) for the msp1β gene, semi-nested PCR (snPCR) for the msp1α gene, cloning of the target fragment and sequencing by the Sanger method. The obtained sequences were subjected to genetic diversity analysis using the RepeatAnalyzer software. The Indirect Immunoenzymatic assay (iELISA) revealed low seroprevalence in the sampled animals despite 100% positivity in the qPCR, with quantification between 103 and 107 number of DNA c... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é uma espécie amplamente cultivada no Brasil, possuindo grande variabilidade para caracteres morfológicos, e elevada adaptação a climas e solos diferentes. A avaliação da variabilidade genética através da técnica de eletroforese de isoenzimas é bastante empregada em espécies vegetais. Os acessos mantidos em bancos de germplasma constituem um importante recurso genético para futuros trabalhos de melhoramento, porém é necessário conhecer-se as características peculiares de cada acesso. O estudo da variabilidade genética em bancos de germoplasma contribui para o conhecimento do genótipo de cada acesso, além de identificar materiais duplicados, o que reduz o custo com a manutenção do germoplasma. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de 200 acessos de mandioca através de oito sistemas isoenzimáticos [fosfatase ácida (ACP), leucina aminopeptidase (LAP), glucose-6-fosfato desidrogenase (G6PDH), malato desidrogenase (MDH), xiquimato desidrogenase (SKDH), enzima málica (ME), glutamato desidrogenase (GDH) e isocitrato desidrogenase (IDH)] e verificar a existência de possíveis acessos duplicados. Para a avaliação isoenzimática dos acessos de mandioca utilizou-se folhas tenras (recém-expandidas) e, como meio de suporte, gel de amido de milho a 12% de concentração. Os acessos foram agrupados de acordo com o local de origem, obtendo-se desta forma sete grupos: 1-Amazonas, 2-Amapá, 3-Bahia, 4-Pará, 5-Rondônia, 6-Diversos, incluindo-se neste grupo os acessos que apresentavam-se em pequena quantidade por local de origem (um ou no máximo dois indivíduos), e 7- Acessos sem origem, incluindo-se neste grupo os acessos que não apresentavam local de origem definida. Cada sistema apresentou um loco polimórfico. O número médio de alelos por loco variou de 2,3 a 2,5. A heterozigosidade média observada variou de 0,381 a 0,615 e a esperada de 0,479 a 0,559. A variabilidade genética dentro dos grupos foi maior que a variabilidade entre os grupos para todos os oito locos analisados, com valores médios entre grupos (GST) de 0,049 e dentro de grupos (HS) de 0,482. Através da análise de similaridade genética, utilizando-se o índice de Jaccard, foi confeccionado um dendrograma para cada grupo de acessos, observando-se grande variabilidade genética entre os acessos avaliados. Os dendrogramas foram comparados a uma planilha contendo os 200 acessos agrupados de acordo com a semelhança de seus genótipos para os oito locos avaliados, com a finalidade de verificar a existência de possíveis acessos duplicados. Os dendrogramas mostraram a presença de 11 pares de acessos repetidos. Destes, somente três pares de acessos apresentaram similaridade para os oito locos analisados, os quais podem ser considerados como possíveis materiais duplicados / not available

Made available in DSpace on 2015-11-04T13:39:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 marcelle_silva_ioc_dout_2014.pdf: 10537387 bytes, checksum: 2d26a95e51c9f156abba0ee948b14523 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-10-29 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Os rotavírus da espécie A (RVA) são os principais agentes etiológicos causadores de gastroenterite aguda (GA) em crianças \2264 5 anos e, anualmente, são responsáveis por aproximadamente 196.000 casos de óbito infantil em todo o mundo. Diferentes mecanismos genéticos (mutações pontuais, rearranjos genéticos, reestruturação de segmentos genômicos (reassortment) e recombinação genética) estão envolvidos na geração de variabilidade genética destes vírus. As combinações genotípicas mais encontradas mundialmente são: G1P[8], G2P[4], G3P[8], G4P[8] e G9P[8], entretanto, os países em desenvolvimento apresentam uma maior variabilidade genotípica entre as cepas circulantes. No intuito de se compreender a diversidade dos RVA, em 2011 foi proposto um novo sistema de classificação para os RVA baseado no sequenciamento nucleotídico dos onze segmentos gênicos destes vírus. No presente estudo foram realizadas análises filogenéticas dos onze genes de 28 cepas brasileiras de RVA de genótipo G5P[8] coletadas entre 1986 e 2005, 90 cepas de RVA de genótipo G1P[8] em diferentes regiões brasileiras entre 1986 e 2013, além do perfil de flutuação do genótipo P[8] no Brasil durante as últimas 3 décadas Os resultados demonstraram que as cepas brasileiras de genótipo G5P[8] e G1P[8] possuem uma constelação gênica do genótipo Wa-like (I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1), com exceção de duas cepas G1P[8], que apresentaram o genótipo T3 (genótipo AU-1-like), comumente detectado em felinos. Foi proposta a classificação do genótipo G5 em 3 linhagens diferentes (I, II e III), de modo que a linhagem I circulou no Brasil entre 1986 e 2005 e a linhagem que está circulando atualmente entre países dos continentes Africano e Asiático pertencem à linhagem III. Os resultados permitiram demonstrar que a prevalência do genótipo G1P[8] variou anualmente no Brasil e que o genótipo G1 circulou em associação com as linhagens P[8]-1, P[8]-2 e P[8]-3 no país. A vacina RV1 apresenta especificidade P[8]-1, enquanto as cepas que estão circulando atualmente são P[8]-3. A análise do perfil de P[8] no Brasil demonstrou que no país circularam as linhagens P[8]-1, P[8]-2 e P[8]-3 e a variabilidade verificada para a linhagem P[8]-3 permitiu a sua classificação em 6 sublinhagens (P[8]-3.1 \2013 P[8]-3.6). Portanto, a melhoria dos programas de vigilância de RVA através de estudos que incluam a análise dos 11 segmentos gênicos das cepas circulantes no país contribuirá para entender melhor alguns pontos ainda não esclarecidos a respeito da biologia dos RVA, como de que maneira a introdução de um esquema de vacinação em massa pode influenciar na circulação de RVA em humanos e animais e a real frequência de detecção de eventos de reassortment entre cepas de espécies diferentes ou entre cepas selvagem e vacinal na população / Specie A rotaviruses (RVA) are the main etiological agent of acute gastroenteritis (AG) in children ≤ 5 years old and, annually, are responsible for about death of 196.000 children worldwide. Different genetic mechanisms (pontual mutation, genetic rearrangement, reassortment and genetic combination) are involved in the generation of variability of this viruses. The most detected combinations worldwide are: G1P[8], G2P[4], G3P[8], G4P[8] and G9P[8], however developing countries have strains with a greater genotypic variability. In order to unsderstand the RVA diversity, in 2011, was proposed a new classification system for RVA based on the nucleotide sequencing of the 11 gene segments. In the present study were conducted Phylogenetic analyses of the 11 gene segments from 28 brazilian RVA strains genotype G5P[8] collected between 1986 and 2005, 90 RVA strains genotype G1P[8] collected between 1986 and 2013 in different regions of the country, besides the analysis of the fluctuation profile from genotype P[8] during the last 3 decades in Brazil. The results showed that brazilian RVA strains genotypes G5P[8] and G1P[8] have a genectic constellation characteristic of the genotype Wa-like (I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1), except for 2 G1P[8] strains, which showed genotype T3 (AU-1-Like), generally detected in felines. Was proposed the classification of genotype G5 in 3 different lineages (I, II and III), lineage I circulated in Brazil between 1986 and 2005, while the lineage actually circulating in African and Asiatic continents is lineage III. The results demonstrated that the G1P[8] prevalence in Brazil changed annually and genotype G1 circulated in Brazil in association to P[8]-1, P[8]-2 and P[8]-3 lineages. RV1 vaccine shows P[8]-1 specificity, whilst the actually circulating strains have P[8]-3 specificity. The analysis of the P[8] genotype profile demonstrated that P[8]-1, P[8]-2 and P[8]-3 lineages circulated in Brazil and the P[8]-3 variability enabled the classification into 6 sublineages (P[8]-3.1 – P[8]-3.6). Therefore, the enhancement of surveillance RVA programs through studies that include analysis of the 11 gene segments of strains circulating in the country contribute to better understand some points that remain unclear about the RVA biology, such as how the introduction of a mass vaccination scheme can influence the circulation of RVA in humans and animals and the actual frequency of reassortment events between strains of different species or between wild and vaccine strains in the population.

A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é uma espécie amplamente cultivada no Brasil, possuindo grande variabilidade para caracteres morfológicos, e elevada adaptação a climas e solos diferentes. A avaliação da variabilidade genética através da técnica de eletroforese de isoenzimas é bastante empregada em espécies vegetais. Os acessos mantidos em bancos de germplasma constituem um importante recurso genético para futuros trabalhos de melhoramento, porém é necessário conhecer-se as características peculiares de cada acesso. O estudo da variabilidade genética em bancos de germoplasma contribui para o conhecimento do genótipo de cada acesso, além de identificar materiais duplicados, o que reduz o custo com a manutenção do germoplasma. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de 200 acessos de mandioca através de oito sistemas isoenzimáticos [fosfatase ácida (ACP), leucina aminopeptidase (LAP), glucose-6-fosfato desidrogenase (G6PDH), malato desidrogenase (MDH), xiquimato desidrogenase (SKDH), enzima málica (ME), glutamato desidrogenase (GDH) e isocitrato desidrogenase (IDH)] e verificar a existência de possíveis acessos duplicados. Para a avaliação isoenzimática dos acessos de mandioca utilizou-se folhas tenras (recém-expandidas) e, como meio de suporte, gel de amido de milho a 12% de concentração. Os acessos foram agrupados de acordo com o local de origem, obtendo-se desta forma sete grupos: 1-Amazonas, 2-Amapá, 3-Bahia, 4-Pará, 5-Rondônia, 6-Diversos, incluindo-se neste grupo os acessos que apresentavam-se em pequena quantidade por local de origem (um ou no máximo dois indivíduos), e 7- Acessos sem origem, incluindo-se neste grupo os acessos que não apresentavam local de origem definida. Cada sistema apresentou um loco polimórfico. O número médio de alelos por loco variou de 2,3 a 2,5. A heterozigosidade média observada variou de 0,381 a 0,615 e a esperada de 0,479 a 0,559. A variabilidade genética dentro dos grupos foi maior que a variabilidade entre os grupos para todos os oito locos analisados, com valores médios entre grupos (GST) de 0,049 e dentro de grupos (HS) de 0,482. Através da análise de similaridade genética, utilizando-se o índice de Jaccard, foi confeccionado um dendrograma para cada grupo de acessos, observando-se grande variabilidade genética entre os acessos avaliados. Os dendrogramas foram comparados a uma planilha contendo os 200 acessos agrupados de acordo com a semelhança de seus genótipos para os oito locos avaliados, com a finalidade de verificar a existência de possíveis acessos duplicados. Os dendrogramas mostraram a presença de 11 pares de acessos repetidos. Destes, somente três pares de acessos apresentaram similaridade para os oito locos analisados, os quais podem ser considerados como possíveis materiais duplicados / not available

Foram isoladas 169 colônias de bactérias endofíticas de folhas de diferentes genótipos de plantas de milho sadias, pertencentes às populações BR-105, BR-106 e população de híbridos simples entre essas, em duas localidades e coletas distintas. Trinta isolados foram identificados por não de testes morfológicos e bioquímicos clássicos, definindo-se a ocorrência e porcentagem relativa dos gêneros: Bacillus (55%), Corynebacterium (15%), Micrococcus (12%), Listeria (9%), Pseudomonas (6%) e Erwinia (3%). A técnica de RAPD foi aplicada a treze isolados do gênero Bacillus, o mais ocorrente, para medir o grau de similaridade genética entre esses e linhagens de referência, não endofíticas de Bacillus megaterium e Bacillus subtilis, e relacionar a origem dos isolados com o local de coleta e número da coleta. A análise de RAPD permitiu a diferenciação de quatro grupos entre Bacillus sp. endofíticos e as linhagens de referência, com aproximadamente de 32% de similaridade entre si. Revelou-se grande variabilidade dentro do grupo, havendo relação dentro de dois grupos com o local de coleta e o número de coleta. Foi realizado um ensaio in vitro de antagonismo fungo-bactéria endofítica, entre dez isolados de bactérias, sendo os principais gêneros testados, Bacillus e Micrococcus e os fungos endofíticos Penicillium purpurogenum, P. spinulosum e Fusarium moniliforme, todos isolados de milho, e duas linhagens produtoras de antibióticos não endofíticas de P. chrysogenum IFO-4626 e IZ1671. Este ensaio revelou não haver inibição do crescimento das bactérias pelos fungos endofíticos. Entretanto dois isolados endofíticos foram inibidos pelas linhagens de P. chrysogenum, indicando um tipo de associação diferente da que ocorreu entre os endofíticos, caracterizada por uma antibiose / Endophytic bacteria were isolated in healthy maize leaves from different genotypes of BR-105 and BR-106 populations and from their simple hybrids population. Isolation was performed on two experimental areas by two distinct harvests. The total number of isolated bacteria colonies was 169. Thirty isolates were identified by classic morphologic and biochemical tests, and defined the genus occurence and relative percentage: Bacillus (55%), Corynebacterium (15%), Micrococcus (12%), Listeria (9%), Pseudomonas (6%) and Erwinia (3%). RAPD technique was performed to measure the genetic similarities among the thirteen main occurring Bacillus endophytes, and the reference strains not endophytes Bacillus megaterium and Bacillus subtilis, also relating the endophyte origins with the harvest area and harvest number. RAPD analysis allowed to differentiate four groups among Bacillus endophytes and Bacillus reference strains, presenting nearly 32% of similarity themselves. High variability was detected within the group, being detected within two groups relationships with harvest area and harvest number. It was performed an in vitro endophyte bacteria- fungi antagonism assay, with ten bacteria isolates, being the major genus assayed Bacillus and Micrococcus, and the endophytes Penicillium purpurogenum, P. spinulosum and Fusarium moniliforme, all of them isolated from maize, and two antibiotic producers, not endophytes, P. chrysogenum IF04626 and IZ1671. Such assay has shown that endophytic fungi was not able to inhibit endophytic bacteria growth. Althoug, two endophytes were inhibited by antibiotic producers lineages P. chrysogenum, indicating a different kind of association from that occuring among endophytes, characterized by antibiosis

O presente estudo foi desenvolvido em dois solos com diferentes fertilidades caracterizados como Podzólico Vermelho Escuro ( P V E ) e Areia Quartzosa Álica (AQ), localizados na região de Lençois Paulista - SP em áreas da DURATEX FLORESTAL S.A. Os dois locais apresentam semelhanças quanto às características climáticas. O estudo objetivou: a) observar a variação genética entre clones de E. grandis propagados por estaquia; b) verificar a interação e clones x solos com diferentes fertilidades; c) comparar o comportamento silvicultural de clones e material propagado por sementes com diferentes graus de melhoria genética; d) avaliar o efeito da competição entre árvores em parcelas monoclonais e misturas de clones. Foram testados 16 tratamentos, distribuídos em blocos ao acaso com três repetições, em parcelas de 36 plantas e espaçamento de 3,0 m x 3,0 m. Os tratamentos estudados foram: - Parcelas monoclonais de oito clones constituídos por plantas propagadas por estaquia (8 tratamentos). Parcelas multiclonais constituídas por plantas dos oito clones, propagados por estaquia. Os oito clones foram distribuídos ao acaso na parcela (3 tratamentos). - Parcelas constituídas por plantas produzidas por sementes de pomar clonal propagado por enxertia (2 tratamentos). - Parcelas constituídas por plantas produzidas por sementes das oito árvores selecionadas (matrizes), de cujas touças retiraram-se as estacas (2 tratamentos).- Parcelas constituídas por plantas originárias de sementes de E. grandis , ex África do Sul, e colhidas em povoamentos comerciais da DURATEX FLORESTAL S.A. em Lençóis Paulista - SP. Os resultados e conclusões da avaliação aos 24 meses foram: a) a produtividade média no PVE (126,29 m3 sólidos /ha), foi 57,32 m3 /ha superior (83%) à media de produtividade da AQ (68,97m3 /ha); b) os materiais propagados via semente apresentaram melhores resultados para pomar clonal, vindo a seguir as sementes de matrizes e por último as sementes comerciais. O material propagado por estaquia não correspondeu à expectativa teórica; c) As parcelas multiclonais apresentaram desenvolvimento superior as parcelas monoclonais, principalmente no PVE, onde a superioridade foi de 8,1% em volume; d) houve variação genética entre clones nos dois solos testados; e) a interação dos dois materiais genéticos com os dois solos mostrou-se pouco expressiva, com comportamento semelhante dos mesmos nos dois solos; f) as estimativas de ganhos genéticos reais foram inferiores as teoricamente esperadas; g) os materiais genéticos mostraram variações nas concentrações de nutrientes em suas folhas / The objectives of this work were: a) to observe the genetic variation among clones of Eucalyptus grandis produced by cutting; b) to verify the interaction of clones x soils with different fertility leveIs; c) to compare the silvicultural performance of clones produced by cutting and trees produced from seeds with different genetic improvement leveIs; and d) to evaluate the compettional effect among trees in monoclonal and multiclonal plots. The trials were established in two soils with different fertility levels and characterized as dark red podzolic (PVE) and aluminous quartzous sand (AQ) under similar climatic conditions in the region of Lençóis Paulista - SP. The trials were set up in a randomized block design with 16 trataments and three replications uti1izing 36 trees in spacings of 3,0 x 3,0 m plots. The treatments were as floows: 1. Eight treatments with different monoclonal plots consisting of trees propagated by cutting; 2. Three treatments with multiclonal plots. Each plot consisted of a misture of the 8 clónes propagated by cutting; 3. Two treatments with plots consisting of trees propagated by seeds from a cIonaI seed orchad established by grafting; 4. Two treatments with plots consisting of trees propagated by seeds from 8 selected trees that gave origin to the 8 clones; 5. One treatment with plots consisting of trees propagated by seeds collected from commercial stands of E. grandis (ex South Afríca) in Lençóis Paulista - SP. The analysis of the results from evaluations made at 24 months of age allowed the following conclusions: a) The mean production for the PVE soil (126,29 m3/ha) was 83% (57,32 m3/ha) higher than that for the QA soil (68,97 m3/ha). b) Trees propagated by seeds showed higher productions than those propagated by cutting. In this case, the highest production was obtained by trees propagated by seeds from the clonal seed orchard, followed by those from selected trees and the last, those from commercial stands; c) The treatments with multiclonal plots showed a higher production than those with monoclonal plots. In the PVE soil, the production in volume for the multiclonal plots was 8,1% higher than that for the monoclonal plots; d) Genetic variations among clones were detected in the two soils tested; e) The interaction of the two types of genetic material (clones and seeds) with the two soils showed little expression with similar performance in both soils; f) The estimates for the observed genetic gains were lower to those theotetically expected; g) The genetic material utilized showed variation in the leaf mineral nutrient content

Com o objetivo de caracterizar os órgãos e detectar variações durante o desenvolvimento foram comparados os perfis eletroforéticos de proteínas desnaturadas (SDS-PAGE) de folhas, colmo, pendão, espiga e grãos em sete genótipos de milho. Cada órgão apresentou um perfil eletroforético característico exibindo diferenças no número e concentração proteica das bandas; o mesmo acontecendo em dado órgão nos diferentes genótipos. Essas diferenças foram maiores entre órgãos do mesmo genótipo, que aquelas observadas entre genótipos diferentes considerando o mesmo órgão e estágio de desenvolvimento. As folhas, colmos e grãos apresentaram variações nas concentrações de grande número de bandas com comportamento similar nos vários genótipos durante o desenvolvimento da planta. Verificou-se alto valor percentual de bandas com concentração maior ou igual às bandas de maior concentração de suas linhas parentais, especialmente em folhas e colmo. A presença de bandas no híbrido não existentes nos parentais; e a ausência de bandas no híbrido, existentes em ambas as linhagens parentais sugerem sistemas regulatórios envolvendo mais de um fator trans, agindo na expressão de alguns polipeptídeos. As estimativas de distâncias genéticas entre linhagens e híbridos, demonstram que os valores de distância são influenciados pela escolha do órgão e estágio / Electrophoretic patterns of denatured proteins (SDS-PAGE) of leaves, stalks, tassels, ears and grains, were used to characterize and search for protein during the development of strains and hybrids of maize. Each organ showed a characteristic band pattern, in respect to number and concentration as measured by densitometry, the same observed for every genotype wich was also possible to characterize this way. However the differences among organs were greater than those observed among genotypes for a specific organ and stage of development. The leaves, stalks and grains showed similar variations in the concentration of the bands in the genotypes, and for the ears and tassels most of the variations in the concentration of the bands seemed be related to the genotype. In the simple crosses, most bands presented higher concentration, specially in leaves and stalks, than in respective parental lines. In some cases, in the hybrid, the bands resembled the parental line with high band concentration. The presence of the bands in the hybrid that are absent in their parent lines; and absence of the bands in the hybrids, although present in both parent lines, suggest regulatory systems involving more than one trans factor acting in some polypeptides expression. It was proceded the evaluation of genetic distances among lines and hybris through of the multivariate analysis. The results led to te conclusion that it is possible to obtain genetic distance values consistents with the parental relationships, but influenced by the types and stages of the organs