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Systematics and phylogeography of the genus Tigriopus (Copepoda, Harpacticoida, Harpacticidae) in the basin of the Mediterranean Sea

Tesis por compendio / [ES] El género de copépodos Tigriopus Norman, 1869 se distribuye en todo el mundo en piscinas costeras de rocas y actualmente se considera que incluye 15 especies válidas. Tigriopus fulvus (Fischer, 1860), con su subespecie Tigriopus fulvus adriaticus Van Douwe 1913 y Tigriopus fulvus algiricus Monard 1935, actualmente se informa que ocurren en el área mediterránea, pero actualmente se desconoce la diversidad real del género. Nuestro objetivo fue evaluar la identidad real de las poblaciones mediterráneas de Tigriopus y dilucidar su taxonomía y patrón de diversidad genética. Para alcanzar estos objetivos, utilizamos dos enfoques diferentes. El primero, basado en la morfología, donde las posibles diferencias morfológicas entre muestras topotípicas de Tigriopus fulvus s.s. y muestras topotípicas de las dos subespecies fueron investigadas. Un segundo, sobre una base molecular, donde se secuenciaron fragmentos de dos genes de ADN mitocondrial (subunidad I de citocromo c oxidasa, COI y subunidad de ARN ribosómico pequeño, 12S) y un gen de ADN nuclear (28S) para ser usados como marcador de referencia. En este marco, se utilizaron enfoques taxonómicos moleculares, como el descubrimiento automático de brechas de código de barras (ABGD), bPTP (procesos de árbol de Poisson bayesianos) y la relación K / ¿, para investigar la existencia de las supuestas subespecies de Tigriopus a través de la identificación de Operacional Unidades Taxonómicas (OTU).
Nuestros datos sugieren la presencia de una sola especie caracterizada por una notable estructura genética basada en la geografía en toda el área de estudio. El patrón de diversidad observado se atribuye tentativamente aquí a una fuerte monopolización de los estanques de rocas por parte de los primeros inmigrantes que los alcanzan. Sin embargo, tal monopolización se ve interrumpida periódicamente por los eventos de extinción locales, que son frecuentes en los hábitats intrínsecamente inestables de las piscinas de rocas Aquí proponemos para este patrón el nombre de "monopolización periódica" ("Clockwork monopolization"). / [CA] El género de copépodos Tigriopus Norman, 1869 se distribuix en tot el mon en piscines costeres de roques i actualment se considera que inclou 15 especies valides. Tigriopus fulvus (Fischer, 1860), en la seua subespecie Tigriopus fulvus adriaticus Van Douwe 1913 i Tigriopus fulvus algiricus Monard 1935, actualment s'informa que ocorren en l'area mediterranea, pero actualment se desconeix la diversitat real del género. Nostre objectiu fon evaluar l'identitat real de les poblacions mediterranees de Tigriopus i dilucidar la seua taxonomia i patrón de diversitat genetica. Per a alcançar estos objectius, utilisem dos enfocaments diferents. El primer, basat en la morfologia, a on les possibles diferencies morfologiques entre mostres topotípicas de Tigriopus fulvus s.s. i mostres topotípicas dels dos subespecies foren investigades. Un segon, sobre una base molecular, a on se secuenciaron fragments de dos gens d'adn mitocondrial (subunidad i de citocromo c oxidasa, coi i subunidad d'arn ribosómico menut, 12s) i un gen d'adn nuclear (28s) per a ser amprats com marcador de referencia. En este marc, s'utilisaren enfocaments taxonomics moleculars, com el descobriment automatic de breches de codic de barres (ABGD), bPTP (processos d'arbre de poisson bayesianos) i la relacio K/¿, per a investigar l'existencia de les supostes subespecies de Tigriopus a través de l'identificacio d'operacional unitats taxonomiques (OTU).
Nostres senyes sugerixen la presencia d'una sola especie caracterisada per una notable estructura genetica basada en la geografia en tota l'area d'estudi. El patrón de diversitat observat s'atribuix tentativament aci a una forta monopolisacio dels safarejos de roques per part dels primers immigrants que els alcancen. No obstant, tal monopolisacio se veu interrompuda periodicament pels events d'extincio locals, que son freqüents en els hábitats intrinsecament inestables de les piscines de roques aci proponem per a este patrón el nom de "Monopolisacio Periodica" ("Clockwork Monopolization"). / [EN] The copepod genus Tigriopus Norman, 1869 is distributed worldwide in coastal rock-pools and it is currently considered to include 15 valid species. Tigriopus fulvus (Fischer, 1860), with its subspecies Tigriopus fulvus adriaticus Van Douwe, 1913 and Tigriopus fulvus algiricus Monard, 1935, are currently reported to occur in the Mediterranean area, but the actual diversity of the genus is currently unknown. We aimed to assess the actual identity of Mediterranean Tigriopus populations and to elucidate their taxonomy and pattern of genetic diversity. In order to reach these goals, we use two different approaches. The first, based on morphology, where the possible morphological differences among topotypical samples of Tigriopus fulvus s.s. and topotypical samples of the two subspecies were investigated. A second, on a molecular basis, where fragments of two mitochondrial DNA genes (cytochrome c oxidase subunit I, COI and small ribosomal RNA subunit, 12S) and a nuclear DNA gene (28S) were sequenced to be used as a reference marker. In this frame, molecular taxonomical approaches, such as Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD), bPTP (bayesian Poisson Tree Processes) and K/¿ ratio, were used in order to investigate the existences of the alleged subspecies of Tigriopus through the identification of Operational Taxonomic Units (OTUs).
Our data suggest the presence of a single species characterized by a noteworthy geographically-based genetic structure in the whole study area. The observed diversity pattern is tentatively ascribed here to a strong monopolization of the rock pools by the first immigrants that reach them. However, such a monopolization is periodically disrupted by local extinction events, which are frequent in the intrinsically unstable rock pool habitats. We propose the name "clockwork monopolization" for this pattern. / Vecchioni, L. (2020). Systematics and phylogeography of the genus Tigriopus (Copepoda, Harpacticoida, Harpacticidae) in the basin of the Mediterranean Sea [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/144122 / Compendio

Identiferoai:union.ndltd.org:upv.es/oai:riunet.upv.es:10251/144122
Date23 March 2021
CreatorsVecchioni, Luca
ContributorsArculeo, Marco, Belda Pérez, Eduardo Jorge, Rodilla Alamá, Miguel, Universitat Politècnica de València. Departamento de Ciencia Animal - Departament de Ciència Animal
PublisherUniversitat Politècnica de València
Source SetsUniversitat Politècnica de València
LanguageEnglish
Detected LanguageSpanish
Typeinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis, info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
Coverageeast=18.0480105; north=34.5531284; name=Mar Mediterráneo, east=-9.0486794; north=42.75765959999999; name=Océano Atlántico, AC-550, 37, 15291 Muros, La Coruña, Espanya, east=-8.811359099999999; north=42.40330029999999; name=Sanxenxo, Rúa Ourense, 24, 36960 Sanxenxo, Pontevedra, Espanya, east=10.3950528; north=63.4305149; name=Trondheim, Noruega
Rightshttp://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess

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