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Previous issue date: 2011-05-26 / Oats (Avena sativa L.) are a winter cereal used for both humans and livestock, giving
a great importance on the world stage. In the post-genomic era new sequenced
genomes can be used to derive functions of organisms from the knowledge of these
systems. In this work were apply this approach to the analysis of gene family of
aquaporins in oats. The aquaporins are major intrinsic proteins (MIP) that have been
characterized as facilitating the water flow. They are also known as water channels,
glycerol facilitators and aquaglyceroporins, recent data suggest that they facilitate the
movement of other molecular low weight metabolites. The presence of these genes is
importance for the development and adaptation of plants, however, until now there
are not studies reporting the identification of aquaporins in the oat genome. In this
report we identified two sequences identified as potential aquaporins present in the
genome of oat. Considering the number of aquaporin genes present in genome of
rice, Arabidopsis, maize and wheat and the complexity of its polyploid genome, it is
estimated that oats may have around 20 or more copies of these genes in each
genome. Given the growing problems of flooding and drought, the need for cultivation
in areas affected by salinity and the proven role of MIPs on plant response to
stresses related to water availability, the investigations of these genes are essential
in oats too. However a greater number of these genes can be identified in the future,
this study was an important step in its characterization. / A aveia (Avena sativa L.) é um cereal de inverno utilizado tanto para a alimentação
humana quanto animal, apresentando uma grande importância no cenário mundial.
Na era pós-genômica novos genomas sequenciados podem ser utilizados para
inferir funções de organismos a partir do conhecimento de outros sistemas. Neste
trabalho foi aplicada essa abordagem à análise de genes da familia das aquaporinas
em aveia. As aquaporinas são proteínas intrínsecas de membrana (MIP) que têm
sido caracterizadas como facilitadoras do fluxo de água. São também conhecidas
como canais de água, glicerol facilitadores e aquagliceroporinas. Dados recentes
sugerem que elas facilitam a circulação de outros metabólitos de baixo peso
molecular. A presença dos genes que codificam essas proteínas é de suma
importância para o desenvolvimento e adaptação das plantas, contudo, até hoje não
existiam estudos relatando a identificação de genes de aquaporinas no genoma da
aveia. O sequenciamento e caracterização in silico das sequências obtidas neste
trabalho propõem a presença de genes que codificam prováveis aquaporinas. Foram
identificadas duas sequências como prováveis aquaporinas presentes no genoma da
aveia. Considerando o número de genes de aquaporinas presentes no genoma do
arroz, Arabidopsis, milho e trigo e a complexidade de seu genoma poliplóide, estimase
que a aveia possua mais cópias desses genes. Tendo em vista os crescentes
problemas de alagamento e/ou seca, a necessidade de cultivo em áreas afetadas
pela salinidade, e o comprovado papel das MIPs na resposta das plantas a
estresses relacionados com a disponibilidade de água, as investigações desses
genes em aveia são essenciais. Contudo um número maior desses genes poderão
ser identificados e caracterizados, esse estudo representa uma etapa importante
para sua caracterização.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpel.edu.br:123456789/1294 |
| Date | 26 May 2011 |
| Creators | Silveira, Carla Ferreira |
| Contributors | CPF:43725678049, http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780819H4, Chaves, Ana Lúcia Soares, Oliveira, Antonio Costa de |
| Publisher | Universidade Federal de Pelotas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, UFPel, BR, Biotecnologia |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPEL, instname:Universidade Federal de Pelotas, instacron:UFPEL |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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