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CNViewer : aplicativo baseado em navegador web para análise de variações de número de cópias (CNV) do genoma humano / Cnviewer:Browser-Based AppicationFor The Analysis Of Dna Copy Number Variation In The Human Genome

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Previous issue date: 2010-07-12 / Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior / O uso de ferramentas de análise e visualização de dados é essencial para a pesquisa de CNVs, porém nem sempre está ao alcance de todo o meio científico devido a restrições de acesso ou por requerer conhecimento avançado de informática. Portanto o desenvolvimento de interfaces amigáveis e acessíveis é essencial para a pesquisa.
Esta dissertação visou explorar o ambiente dos navegadores Web para desenvolver soluções para os problemas de acessibilidade, portabilidade e visualização, comumente encontrados nas ferramentas de bioinformática.

Foi desenvolvido um aplicativo para análise exploratória, denominado CNViewer, o qual oferece recursos para comparação de perfis moleculares, além de representar graficamente diversas amostras simultaneamente. Através de uma interface dinâmica, o usuário pode delimitar quaisquer regiões genômicas para a análise, e pode também exibir dados complementares às CNVs. Foi também disponibilizado acesso direto a anotações genômicas, tornando o CNViewer um ambiente para estudo de CNVs e dados correlacionados.

Utilizando somente os recursos oferecidos pelos navegadores Web (JavaScript e HTML), o CNViewer é capaz de processar dados e executar tarefas rapidamente, com independência de servidor, pois mantêm os dados em memória durante seu uso, aperfeiçoando a interatividade com o usuário. Foi também criado um módulo de exportação, que permite ao usuário salvar e recuperar suas análises, servindo também para compartilhamento de dados. O CNViewer é um aplicativo que supera os limites dos programas baseados em Web clássicos, comportando-se como um aplicativo desktop, mas com a vantagem de ser acessado diretamente, sem requerer instalação ou atualização. O crescente uso dos navegadores Web como ambiente de trabalho, e mais recentemente até mesmo como sistema operativo, sugere que aplicativos nativos a esse ambiente poderão tornar-se a norma em informática biomédica.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:tede-server.lncc.br:tede/28
Date12 July 2010
CreatorsPalu, Cintia Cristina
ContributorsVasconcelos, Ana Tereza Ribeiro, Almeida, Jonas, Moraes, Milton Ozório, Oliveira, Jauvane Cavalcante de
PublisherLaboratório Nacional de Computação Científica, Programa de Pós-Graduação em Modelagem Computacional, LNCC, BR, Serviço de Análise e Apoio a Formação de Recursos Humanos
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do LNCC, instname:Laboratório Nacional de Computação Científica, instacron:LNCC
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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