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Estudo da comunidade de bact?rias diazotr?ficas do g?nero Burkholderia em associa??o com cana-de-a??car e descri??o de Burkholderia silvatlantica / Community study of the of Burkholderia diazotrophic bacteria in association with sugarcane and description of Burkholderia silvatlantica

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Previous issue date: 2007-02-15 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / The sugarcane crop in Brazil occupies almost six million hectares and it is economically
important for the generation of jobs and energy production. Among the Poaceas species, it is
the crop that receives more contributions from the biological nitrogen fixation, however until
this moment it is unknown what organisms are responsible for the best results observed.
Innumerable genuses of diazotrophic bacteria were found in association with sugarcane,
among them the genus Burkholderia. However little is known about this genus in association
with sugarcane. The objective of this study was to isolate and to characterize diazotrophic
Burkholderia bacteria in association with sugarcane, and to describe a new species of
diazotrophic Burkholderia bacteria. For that, samples of plants were collected in four crop
areas, in different Brazilian states, for counting and isolating the bacteria community using the
culture medias LGI and JMV. The isolates were characterized physiological, morphologically
and molecularly. Sixty-four Burkholderia diazotrophic isolates were gotten that presented
versatile metabolism, and the majority differing from the analyzed species patterns. Only five
isolates were identified by the ARDRA technique, two belonging to B. tropica species and
three to B. unamae. A big group, with 32 isolates, presented the same restriction profile by the
ARDRA technique and differed from the analyzed species. The sequencing of the 16S rDNA
region of two of these isolates showed that they don t belong to the already described species.
This group, from sugarcane plants together with similar maize and pineapple isolates, was
described as a new species named B. silvatlantica. The characterization of this new
Burkholderia specie was confirmed by the hybridization DNA: DNA technique, presenting
only 30% of similarity with the closest species, and the sequencing of the 16S rDNA region.
B. Silvatlantica fixed nitrogen in microaerophilic conditions, and it had no capacity of
inorganic phosphate solubilization, it did not produce vegetal hormones and had no
nodulation capacity in leguminous. These results confirmed that Burkholderia is a rich genus
in diazotrophics species and colonize different habitats. / A cultura da cana-de-a??car no Brasil ocupa mais de seis milh?es de hectares sendo
importante economicamente pela gera??o de empregos e bastante promissora para a produ??o
de energia. Dentre as Poaceas (gram?neas), ? a cultura que mais recebe contribui??es da
fixa??o biol?gica de nitrog?nio, por?m ainda n?o se sabe ou n?o se conhece qual ou quais
organismos s?o respons?veis pelos melhores resultados observados. In?meros g?neros de
bact?rias diazotr?ficas foram encontrados em associa??o com cana-de-a??car, dentre eles o
g?nero Burkholderia, at? o momento pouco estudado em associa??o com esta cultura. O
objetivo deste estudo foi isolar e caracterizar bact?rias diazotr?ficas do g?nero Burkholderia
em associa??o com cana-de-a??car e descrever uma nova esp?cie de bact?ria diazotr?fica do
g?nero Burkholderia. Para tal, foram coletadas amostras de plantas em canaviais de quatro
estados brasileiros para contagem e isolamento da comunidade de bact?rias utilizando os
meios de cultura LGI e JMV. Os isolados foram caracterizados fisiologicamente,
morfologicamente e molecularmente. Foram obtidos 64 isolados diazotr?ficos do g?nero
Burkholderia, que apresentaram metabolismo vers?til e diferiram dos padr?es das esp?cies
analisadas. Apenas cinco isolados foram identificados pela t?cnica de ARDRA, dois
pertenceram a esp?cie B. tropica e tr?s a B. unamae. Um grande grupo, com 32 isolados,
apresentou mesmo perfil de restri??o pela t?cnica de ARDRA e diferiu das esp?cies
analisadas. O sequ?nciamento da regi?o 16S rDNA de dois destes isolados mostrou que eles
n?o pertencem ?s esp?cies j? descritas. Este grupo obtido de plantas de cana-de-a??car,
juntamente com isolados similares, obtidos de milho e abacaxi, foi descrito como uma nova
esp?cie de nome B. silvatlantica. A nova esp?cie de Burkholderia foi confirmada pelos
experimentos de hibridiza??o DNA:DNA, com apenas 30% de similaridade com a esp?cie
mais pr?xima. B. silvatlantica fixou nitrog?nio em condi??es microaerof?licas, n?o apresentou
capacidade de solubiliza??o de fosfato inorg?nico, n?o produziu horm?nios vegetais e n?o
apresentou capacidade de nodula??o em leguminosas. Estes resultados confirmaram que o
g?nero Burkholderia ? rico em esp?cies diazotr?ficas e est?o presentes em diferentes habitats.

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Date15 February 2007
CreatorsPerin, Liamara
ContributorsReis, Veronica Massena, Ara?jo, Jean Luiz Sim?es de, Baldani, Jos? Ivo
PublisherUniversidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Curso de P?s-Gradua??o em Agronomia - Ci?ncia do Solo, UFRRJ, Brasil, Ci?ncias Agr?rias
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRRJ, instname:Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, instacron:UFRRJ
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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