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Previous issue date: 2008-07-11 / Soybean is one of the main world commodities and the seed is the key for
high yields in this culture. Nevertheless, the soybean seed coat is the main modulator
of seed quality, so, in this structure we could find answers for high seed quality
production. The study goal is to identify structural contrasting traits, to obtain cDNA
and to draw primers related to lignin synthesis and wax deposition in seed coat from
two soybean genotypes. Plants were grown in greenhouse, flowers were identified
and dated to follow the development after flowering until legumes were harvested
(25, 30, 35, 40, 45, 50, 55 and 60 days). Seed coats were then analyzed in electronic
microscopy and used to build a soybean seed coat cDNA library for permeability
traits (lignin synthesis and wax deposition). In silico, analyzes were performed to
obtain specific primers to detect soybean seed coat lignin and wax biosynthesis
genes. According to the seed coat traits, we identified differences in the palisade cell
thickness between genotypes. The protocol based on litio chloride was efficient to
extract total RNA from both genotypes in all phases. The unidirectional cDNA
multiplication was efficient for the generation of enough cDNA quantity for future
projects. In silico analyzes allowed the development of 16 primers related to lignin
and wax deposition biosynthesis in soybean seed coat. / A soja é uma das principais commodities mundiais e a semente o principal
insumo para sua produção. O tegumento das sementes é o principal modulador da
qualidade, podendo ser encontrado, nessa estrutura a resposta para a produção de
sementes com caracteres superiores para vigor e viabilidade. O estudo teve como
objetivo identificar características estruturais contrastantes, obter cDNA e desenhar
primers relacionados à síntese de lignina e deposição de cera em tegumentos de
sementes de soja de genótipos contrastantes em relação à permeabilidade CD 202
(permeável) e IAC Santa Maria 702 (semipermeável). As plantas foram cultivadas
em casa de vegetação e a partir da primeira floração as flores foram marcadas para
que o tempo de desenvolvimento de cada legume fosse identificado. Legumes com
25, 30, 35, 40, 45, 50, 55 e 60 dias de desenvolvimento foram coletados e os
tegumentos extraídos e armazenados para extração de RNA. Tegumentos com 25,
40, 55 e 70 dias de desenvolvimento dos genótipos de soja CD 202 e IAC Santa
Maria 702 também foram submetidos a Microscopia Eletrônica. Após a extração do
RNA total, foram obtidos os RNAm, seguido do cDNA. Em paralelo foi realizada
análise in silico para desenho de primers específicos de genes envolvidos na rota
metabólica da lignina e na deposição de cera nas sementes. Foram detectadas
diferenças na espessura da camada paliçádica dos tegumentos de sementes de soja
dos genótipos CD 202 e IAC Santa Maria 702. O protocolo a base de cloreto de lítio
foi eficiente para extrair RNA total de ambos os genótipos em todas as fases de
coleta. A estratégia de multiplicação unidirecional do cDNA foi eficiente para geração
de um volume considerável para o desenvolvimento de estudos futuros de
expressão diferencial de genes. A análise in silico permitiu o desenvolvimento de 16
primers relacionados aos genes da lignina e da elongase.
Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpel.edu.br:123456789/1495 |
Date | 11 July 2008 |
Creators | Miranda, Helen Lúcia da Cruz |
Contributors | CPF:61465771972, http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4790093Y9, Barros, Antônio Carlos Souza Albuquerque, CPF:11861347049, http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781024Z1, Mattei, Vilmar Luciano, CPF:24256927034, http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799742T3, Lopes, Nei Fernandes, CPF:00731137000, http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788217T1, Zimmer, Paulo Dejalma |
Publisher | Universidade Federal de Pelotas, Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia de Sementes, UFPel, BR, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel |
Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
Language | Portuguese |
Detected Language | Portuguese |
Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
Format | application/pdf |
Source | reponame:Repositório Institucional da UFPEL, instname:Universidade Federal de Pelotas, instacron:UFPEL |
Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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