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Isolamento e caracterização de locos microssatélites e sua aplicação na identificação de estoque pesqueiro da piraíba - Brachyplatystoma filamentosum – Pimelodidae-Siluriformes

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Previous issue date: 2016-03-16 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Piraíba- Brachyplatystoma filamentosum, Is the largest among the migratory Amazonian
catfish. Its distribution covers the entire Amazon basin, from the rivers of Amapá to the
Andes, living both in white water, black and clear, as well as in tributaries and floodplains and
igapó lakes. Until 2005 the information about this species were treated in common with
Brachyplatystoma capapretum, which was described based on osteological features. In this
context, it is necessary studies on the biology of the species, being the genetics the promising
science to elucidate issues such as life cycle, accurate distribution in the Amazonian
environment, variability and genetic stock. Genetic studies using mitochondrial DNA
sequences contributed revealing that on average B. filamentosum is more abundant than B.
capapretum in white water rivers in the Amazon basin. This study aims, through
microsatellite markers, check if B. filamentosum presents population structure and can
compose more than one genetic stock, if it has genetic segregation and if it is associated with
the type of water where is its natural environment. Seventeen microsatellite markers were
isolated and characterized in 35 individuals of B. filamentosum coming from the Belem - PA,
Brazil. There were obtained 78 alleles that ranged from 1 to 15 alleles per locus, with an
average of 6.00%. The observed heterozygosity (Ho) and expected (He) ranged from 0.100 to
0.875 (mean 0.569) and 0.136 to 0.837 (mean 0.558), respectively. The heterologous
amplification resulted in 3 to 12 locos of six species of the genus Brachyplatystoma B.
capapretum (black piraíba), B. vaillantii (piramutaba), B. rousseauxii (dourada) B.
platynemum (Babão), B. tigrinum (dourada zebra ) and B. juruense (Flamengo). The
microsatellite markers obtained will contribute to future genetic studies of natural populations
of B. filamentosum and will be available for other species of the genus Brachyplatystoma. Ten
microsatellite loci were used for population genetic analyzes of 178 individuals of B.
filamentosum sampled in six regions of the Amazon basin, representatives of three different
types of water. A total of 80 alleles was obtained with average of 8 alleles, the average of
heterozygosity observed and expected from 0.548 to 0.598 per locus. The results of AMOVA
showed moderate genetic flow between locations and significant values of FST. It is not
possible accept the null hypothesis of panmixia, from single stock for the species, because the
analyzes indicate structure between some locations, especially between Araguaia River with
Branco River (FST = 0.113) and Negro River (FST = 0.219). The Negro River also presented
the Madeira River (FST = 0.101). The Nm values were also below 4 between these locations.
Thus, it is suggested that B. filamentosum be considered as a single genetic stock, especially
in Negro River, Araguaia River and Branco River. However, it is not possible to say that this
segregation is fully associated with the type of water. / Amazônicos. Sua distribuição abrange toda a bacia amazônica, desde os rios do Amapá até a
cordilheira dos Andes, habitando tanto em água branca, preta e clara, como também em
tributários e lagos de várzea e igapó. Até 2005 as informações a respeito desta espécie eram
tratadas em comum com a Brachyplatystoma capapretum, que foi descrita com base em
características osteológicas. Nesse contexto, faz-se necessário estudos sobre a biologia dessas
espécies, sendo a genética a ciência promissora para elucidar questões como o ciclo biológico,
distribuição exata no ambiente amazônico, variabilidade e estoque genético. Estudos
genéticos utilizando sequencias de DNA mitocondrial contribuíram revelando que em média
B. filamentosum é mais abundante que B. capapretum em rios de águas branca na bacia
amazônica. O presente estudo se propôs, através de marcadores moleculares microssatélites,
verificar se o e B. filamentosum apresenta estrutura populacional, podendo compor mais de
que um estoque genético e se possui segregação genética e se está associada ao tipo de água
onde ocorrem. Dezessete marcadores microssatélites foram isolados e caracterizados em 35
indivíduos de B. filamentosum oriundas da região de Belém – PA, Brasil. Foram obtidos 78
alelos, variando entre 1 a 15 alelos por loco, com uma média de 6,00. A heterozigosidade
observada (Ho) e esperada (He) variou entre 0,100 à 0,875 (média 0,569) e 0,136 à 0,837
(média 0,558), respectivamente. A amplificação heteróloga resultou em 3 a 12 locos entre seis
espécies do gênero Brachyplatystoma: B. capapretum (filhote capapreta), B. vaillantii
(piramutaba), B. rousseauxii (dourada) B. platynemum (babão), B. tigrinum (dourada zebra) e
B. juruense (flamengo). Os marcadores microssatélites obtidos irão contribuir para futuros
estudos genéticos de populações naturais de B. filamentosum e estarão disponíveis para outras
espécies do gênero Brachyplatystoma. Dez locos microssatélites foram utilizados para as
análises de genética populacional de 178 indivíduos de B. filamentosum amostrados em seis
regiões da bacia amazônica, representantes de três diferentes tipos de água. Foi obtido um
total de 80 alelos, com uma média de 8 alelos, média das heterozigosidades observada de
0,548 e esperada de 0,598 por loco. Os resultados da AMOVA indicaram moderado fluxo
gênico entre as localidades e valores significativos de FST. Não é possível aceitar a hipótese
nula de panmixia, de um único estoque para a espécie, pois as análises, de forma geral,
indicam estrutura entre algumas localidades, principalmente entre rio Araguaia com os rios rio
Branco (FST = 0,113) e Negro (FST = 0,219). O rio Negro também apresentou o rio Madeira
(FST =0,101). Os valores de Nm também foram abaixo de 4 entre essas localidades. Desta
forma, sugere-se que B. filamentosum seja maneja considerando mais de que um estoque
genético, principalmente no rio Negro, Araguaia e Branco. Todavia, não se pode afirmar que
essa segregação esteja totalmente associada ao tipo de água.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:http://localhost:tede/5399
Date16 March 2016
CreatorsBrasil, Larissa melo das Neves
ContributorsBatista, Jacqueline da Silva
PublisherUniversidade Federal do Amazonas, Programa de Pós-graduação em Ciências Pesqueiras nos Trópicos, UFAM, Brasil, Faculdade de Ciências Agrárias
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM, instname:Universidade Federal do Amazonas, instacron:UFAM
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
Relation-5055329395362212028, 600, 500, -7597927524659854503

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