Made available in DSpace on 2016-06-02T19:30:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tesJMFP.pdf: 1392326 bytes, checksum: 651fca3092831dc60ee6543fbe2bcc81 (MD5) Previous issue date: 2003-02-04 / Financiadora de Estudos e Projetos / The fishery is an important economic activity at Pantanal. This study describe and analyse the age, the individual growth, the structure, the exploitation and the management alternatives for the two pimelodidae catfish stocks fished in region. The Porthole Shovelnose Catfish, Ilemisorubim platyrhynchos , and the Duckbill Catfish, Sorubim lima, are, respectively, the sixth and the seventh bigger Pantanal pimelodidae catfish. The fishes were caught by comercial and experimental fisheries with hook and line in Cuiabá river, Pantanal. The age and the individual growth were studied from the (a partir dos) pectoral fin-spines. The estimates fo growth parameters were used to obtain estimate of instantaneous mortality rates for the stocks. The consequences of different managemtn actions for the fishes and the fisheries were assessed with (através) the Beverton and Holt relative yield per recruit model. The results indicate that Il. platyrhynchos and S. lima show slow growth and intermediate natural mortality coeficient. The longevity of Il. platyrhynchos is of 11,4 years, and of S. lima is of 9,6 years. The fisheries catches several fishes cohorts and, in general, individuals abovemean lenght of first maturation. Because historical data are not available it is hard to assess the effects of arising (crescente) fisheries pressure on the stocks. Nevertheless, the results of relative yield per recruit model simulations indicate that presente fisheries effort is below of a conservative biological reference point - the P 0,1. So, the two species stocks are underexploited . However, an arising of presente fisheries effort must be seen with caution because (uma vez que) the raltion between stocks size and recruitment for the two species is not knew / A pesca é uma importante atividade econômica no Pantanal Mato-grossense. Este estudo descreve e analisa a idade, o crecimento dos indivíduos, a estrutura, o estado de explotação e as opções de manejo para os estoques de duas espécies de bagres pescados na região. O Jurupoca Ilemisorubim platyrhynchos e o Jurupensén Sorubim Lima são, respectivamente, o sexto e o sétimo maiores bagres do Pantanal. Os exemplares provieram da pesca comercial e experimental realizadas com linha e anzol no rio Cuiabá, Pantanal Mato-grossense. A idade e o crescimento dos indivíduos das espécies foram estudados a partir dos espinhos de nadadeiras peitorais. As estimativas dos parâmetros de crescimento foram posteriormente utilizadas na obtenção de estimativas dos coeficientes instântaneos de mortalidade para os estoques. As consequências da adoção de diferentes medidas de manejo para os estoques e a pesca foram avaliadas através do modelo de rendimento relativo por recruta. Os resultados indicam que Il. platyrhynchos e S. lima apresentam crescimento lento e coeficiente de mortalidade natural intermediário. A longevidade do Il. platyrhynchos é de 11,4 anos e a do S. lima de 9,6 anos. A pesca se concentra na captura de várias coortes de peixes, em geral, sobre indivíduos acima do comprimento médio de primeira maturação. A inexistência de dados históricos dificulta qualquer avaliação dos efeitos da crescente pressão de pesca sobre os estoques. Porém, os resultados das simulações do modelo de rendimento relativo por recruta indicam que o esforço de pesca atual está abaixo de um ponto de referência biológico conservador - o P 0,1. Assim pode-se concluir que o estado atual de explotação dos estoques das duas espécies está aquém do que o estoque teoricamente suportaria, portanto subexplotados. Contudo, um aumento no esforço de pesca atual deve ser visto com cautela uma vez que não se conhece a relação entre o tamanho do estoque e o recrutamento para as espécies

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-11-16T14:11:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Antonio Saulo Cunha Machado.pdf: 1630078 bytes, checksum: 9018338e35f4ebb5375871ef5c348e75 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-11-16T14:11:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Antonio Saulo Cunha Machado.pdf: 1630078 bytes, checksum: 9018338e35f4ebb5375871ef5c348e75 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-16T14:11:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Antonio Saulo Cunha Machado.pdf: 1630078 bytes, checksum: 9018338e35f4ebb5375871ef5c348e75 (MD5) Previous issue date: 2013-12-06 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The great catfish Pseudoplatystoma punchier (surubim) is among the five species of catfish of the Amazon basin with greater commercial value. It plays important role as top predator in freshwater ecosystems of the Amazon. The movement of aquatic species, in watersheds, can be interrupted by natural biogeographic barriers, formed by rapids and waterfalls that produce distinct biota.There are clear differences between the biota (assemblies) of fish in the area that is upstream and downstream of the falls of the Madeira Rive. The waterfalls of Madeira River delimit two distinct regions: upstream the sub-basins of the Mamore/Guapore (which will be called the Mamore/Guapore sub-basin) and downstream the sub-basin of the Madeira River.The knowledge of how the life cycle of P. punchier is influenced by the Madeira River rapids and waterfall, taking into account their migratory route and how much genetic variation occurs in this species, within and between sub-basins, is very important for the conservation and for possible management measures. Molecular analyzes were performed by sequencing the COI gene of mtDNA and 10 microsatellite loci. Our objective was to determine whether P. punchier constitutes a parunitic population or if there is some kind of genetic segregation, associated with space and time, which can be related to the waterfalls of the river Madeira or the homing behavior. Were analyzed 96 specimens with the COI gene and 99 with microsatellite loci from six localities, being two in the the Mamore/Guapore sub-basin and four in the sub-basin of the Madeira River, both in the Amazon basin. With the COI marker were observed 11 haplotypes, a haplotype diversity of 0.600 and a nucleotide diversity of 0.00157. All analyzed microsatellite loci were highly polymorphic, the number of alleles per locus ranging from two (Ppu8) to 22 (Ppu4), on average 10.4 alleles per locus. The total number of observed alleles was 104, with 27 unique alleles. Based on the results of the analysis of molecular variance (AMOVA) and gene flow (Nm) observed between the sub-basins to the microsatellite (PST = 0.067; Nm= 6.883) and for the gene COI ((DST = 0.391; Able 0.643), we cannot reject the hypothesis of panmixia for Pseudoplatystoma punchier. However, it was evidenced that the specimens of P. punchier of Madeira River and Mamore/Guapore sub-basins feature a large genetic differentiation and intermediate for the gene COI and microsatellites, respectively. Genetic differentiation observed in Bayesian analysis of BAPS, with the COI data clearly showed the existence of two maternal lines, an in each sub-basin. This result may be related to: sedentary females; the different environmental conditions; the water regime of the Madeira River and Mamore/Guapoth sub-basins and with rapids and waterfalls and of the Madeira River, which partially disrupt the gene flow. We propose a model of migration of males on the basis of the results of the analysis of microsatellite loci and prior studies of ecology. Our results indicated the occurrence of two fishing stocks, which require separate management or priority for conservation. However, anthropogenic actions in the area of study, such as: the construction of dams, deforestation and the fishing exploitation, make the complex conservation and management measures. / O grande bagre Pseudoplatystoma punctifer (surubim) está entre as cinco espécies de bagres da bacia Amazônica com maior valor comercial. Desempenha importante papel como predador de topo nos ecossistemas de água doce da Amazônia. O movimento das espécies aquáticas, nas bacias hidrográficas, pode ser interrompido por barreiras biogeográficas naturais formadas por comedeiras e cachoeiras que produzem biotas distintas. Existem diferenças claras entre as biotas (assembléias) de peixes da área que fica à montante e à jusante das cachoeiras do rio Madeira. As cachoeiras do rio Madeira delimitam duas regiões distintas: à montante, a sub-bacia dos rios Mamoré/Guaporé (que será chamada de sub-bacia do Mamoré/Guaporé) e à jusante, a sub-bacia do rio Madeira. O conhecimento de como o ciclo de vida de P. punctifer é influenciado pelas corredeiras e cachoeiras rio Madeira, levando em consideração a sua rota migratória e o quanto de variação genética ocorre nesta espécie, dentro e entre as sub-bacias, é muito importante para a conservação e para possíveis medidas de manejo. Foram realizadas análises moleculares através do sequenciamento do gene CO1 do DNA mitocondrial e de 10 !ocos microssatélites. O objetivo foi verificar se P. punctifer constitui uma população panmítica ou se existe algum tipo de segregação genética que possa ser relacionada com as cachoeiras do rio Madeira. Foram analisados 96 espécimes com o gene CO1 e 99 com os locos microssatélites, de seis localidades, sendo duas na sub-bacia do Mamoré/Guaporé e quatro na sub-bacia do rio Madeira, ambas na bacia Amazônica. Com o marcador CO1 foram observados 11 haplótipos, uma diversidade haplotípica de 0,600 e uma diversidade nucicotídica de 0,00157. Todos os !ocos microssatélites analisados foram altamente polimórficos, com o número de alclos por loco variando de dois (Ppu8) a 22 (Ppu4), em média 10,4 alclos por loco. O número total de alclos observados foi de 104, com 27 alclos exclusivos. Com base nos resultados da análise de variância molecular (AMOVA) c de fluxo gênico (Nm) observados entre das sub-bacias, para os microssatélites (FsT = 0,067; Nm= 6,883) e para o gene CO1 (0sT= 0,391; Nm= 0,643), não podemos rejeitar totalmente a hipótese de panmixia para Pseudoplatystoma punctifer. No entanto, foi evidenciada que os espécimes de P. punctifer das sub-bacias do rio Madeira e do Mamore/Guaporé apresentam uma diferenciação genética grande e intermediária para o gene CO1 e microssatélites, respectivamente. A diferenciação genética observada na análise baycsiana do programa BAPS, com os dados de CO1, mostrou claramente a existência de duas linhagens maternas, uma em cada sub-bacia. Este resultado pode estar relacionado com: o sedentarismo das fêmeas; as diferentes condições ambientais; o regime hídrico das sub-bacias do rio Madeira e do Mamoré/Guaporé e às corredeiras e cachoeiras do rio Madeira, que interrompem parcialmente o fluxo gênico. Propomos um modelo de migração dos machos, tendo como base os resultados da análise dos locos microssatélites e estudos prévios de ecologia. Nossos resultados indicaram a ocorrência de dois estoques pesqueiros, que precisam gestão separada ou prioridade para conservação. No entanto, as ações antropogênicas na área de estudo, tais como: a construção das hidrelétricas, o desmatamento e a exploração pesqueira, tomam as medidas de conservação e manejo complexas.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-16T14:19:27Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Larissa . N. Brasil.pdf: 3133236 bytes, checksum: 3fa9d7cfdcdd28f5ab6d5893e09e4714 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-16T14:19:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Larissa . N. Brasil.pdf: 3133236 bytes, checksum: 3fa9d7cfdcdd28f5ab6d5893e09e4714 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-16T14:19:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Larissa . N. Brasil.pdf: 3133236 bytes, checksum: 3fa9d7cfdcdd28f5ab6d5893e09e4714 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-16T14:19:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Larissa . N. Brasil.pdf: 3133236 bytes, checksum: 3fa9d7cfdcdd28f5ab6d5893e09e4714 (MD5) Previous issue date: 2016-03-16 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Piraíba- Brachyplatystoma filamentosum, Is the largest among the migratory Amazonian catfish. Its distribution covers the entire Amazon basin, from the rivers of Amapá to the Andes, living both in white water, black and clear, as well as in tributaries and floodplains and igapó lakes. Until 2005 the information about this species were treated in common with Brachyplatystoma capapretum, which was described based on osteological features. In this context, it is necessary studies on the biology of the species, being the genetics the promising science to elucidate issues such as life cycle, accurate distribution in the Amazonian environment, variability and genetic stock. Genetic studies using mitochondrial DNA sequences contributed revealing that on average B. filamentosum is more abundant than B. capapretum in white water rivers in the Amazon basin. This study aims, through microsatellite markers, check if B. filamentosum presents population structure and can compose more than one genetic stock, if it has genetic segregation and if it is associated with the type of water where is its natural environment. Seventeen microsatellite markers were isolated and characterized in 35 individuals of B. filamentosum coming from the Belem - PA, Brazil. There were obtained 78 alleles that ranged from 1 to 15 alleles per locus, with an average of 6.00%. The observed heterozygosity (Ho) and expected (He) ranged from 0.100 to 0.875 (mean 0.569) and 0.136 to 0.837 (mean 0.558), respectively. The heterologous amplification resulted in 3 to 12 locos of six species of the genus Brachyplatystoma B. capapretum (black piraíba), B. vaillantii (piramutaba), B. rousseauxii (dourada) B. platynemum (Babão), B. tigrinum (dourada zebra ) and B. juruense (Flamengo). The microsatellite markers obtained will contribute to future genetic studies of natural populations of B. filamentosum and will be available for other species of the genus Brachyplatystoma. Ten microsatellite loci were used for population genetic analyzes of 178 individuals of B. filamentosum sampled in six regions of the Amazon basin, representatives of three different types of water. A total of 80 alleles was obtained with average of 8 alleles, the average of heterozygosity observed and expected from 0.548 to 0.598 per locus. The results of AMOVA showed moderate genetic flow between locations and significant values of FST. It is not possible accept the null hypothesis of panmixia, from single stock for the species, because the analyzes indicate structure between some locations, especially between Araguaia River with Branco River (FST = 0.113) and Negro River (FST = 0.219). The Negro River also presented the Madeira River (FST = 0.101). The Nm values were also below 4 between these locations. Thus, it is suggested that B. filamentosum be considered as a single genetic stock, especially in Negro River, Araguaia River and Branco River. However, it is not possible to say that this segregation is fully associated with the type of water. / Amazônicos. Sua distribuição abrange toda a bacia amazônica, desde os rios do Amapá até a cordilheira dos Andes, habitando tanto em água branca, preta e clara, como também em tributários e lagos de várzea e igapó. Até 2005 as informações a respeito desta espécie eram tratadas em comum com a Brachyplatystoma capapretum, que foi descrita com base em características osteológicas. Nesse contexto, faz-se necessário estudos sobre a biologia dessas espécies, sendo a genética a ciência promissora para elucidar questões como o ciclo biológico, distribuição exata no ambiente amazônico, variabilidade e estoque genético. Estudos genéticos utilizando sequencias de DNA mitocondrial contribuíram revelando que em média B. filamentosum é mais abundante que B. capapretum em rios de águas branca na bacia amazônica. O presente estudo se propôs, através de marcadores moleculares microssatélites, verificar se o e B. filamentosum apresenta estrutura populacional, podendo compor mais de que um estoque genético e se possui segregação genética e se está associada ao tipo de água onde ocorrem. Dezessete marcadores microssatélites foram isolados e caracterizados em 35 indivíduos de B. filamentosum oriundas da região de Belém – PA, Brasil. Foram obtidos 78 alelos, variando entre 1 a 15 alelos por loco, com uma média de 6,00. A heterozigosidade observada (Ho) e esperada (He) variou entre 0,100 à 0,875 (média 0,569) e 0,136 à 0,837 (média 0,558), respectivamente. A amplificação heteróloga resultou em 3 a 12 locos entre seis espécies do gênero Brachyplatystoma: B. capapretum (filhote capapreta), B. vaillantii (piramutaba), B. rousseauxii (dourada) B. platynemum (babão), B. tigrinum (dourada zebra) e B. juruense (flamengo). Os marcadores microssatélites obtidos irão contribuir para futuros estudos genéticos de populações naturais de B. filamentosum e estarão disponíveis para outras espécies do gênero Brachyplatystoma. Dez locos microssatélites foram utilizados para as análises de genética populacional de 178 indivíduos de B. filamentosum amostrados em seis regiões da bacia amazônica, representantes de três diferentes tipos de água. Foi obtido um total de 80 alelos, com uma média de 8 alelos, média das heterozigosidades observada de 0,548 e esperada de 0,598 por loco. Os resultados da AMOVA indicaram moderado fluxo gênico entre as localidades e valores significativos de FST. Não é possível aceitar a hipótese nula de panmixia, de um único estoque para a espécie, pois as análises, de forma geral, indicam estrutura entre algumas localidades, principalmente entre rio Araguaia com os rios rio Branco (FST = 0,113) e Negro (FST = 0,219). O rio Negro também apresentou o rio Madeira (FST =0,101). Os valores de Nm também foram abaixo de 4 entre essas localidades. Desta forma, sugere-se que B. filamentosum seja maneja considerando mais de que um estoque genético, principalmente no rio Negro, Araguaia e Branco. Todavia, não se pode afirmar que essa segregação esteja totalmente associada ao tipo de água.