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Previous issue date: 2009 / CHAPTER I: “Characterization of 16 microsatellite loci for the south-american rodents Cavia magna and C. aperea” - Based on the recently published genome draft of Cavia porcellus and five other loci described for C. aperea, we present 16 microsatellite loci applicable for C. magna and C. aperea. We designed the primers to be used in a multiplex fluorescence array. The average number of alleles for each locus was 7. 4 and the mean expected heterozygosity was 0. 67. The combination of some or all of these markers may give a good framework for population genetics, molecular ecology and other evolutionary studies in these species. CHAPTER II:"Depauperated genetic diversity of the Moleques do Sul cavy (Cavia intermedia), the naturally rarest mammal in the World" - Islands have been calling the attention of evolutionary biologists for centuries for their high level of endemic species fostered by isolation and limited population size. Cavia intermedia is a recently described cavy species endemic to a small island in the southern Brazilian coast, that seems to be the naturally rarest known mammal, having a stable population around 40 individuals. Although previous demographic simulations estimated its probability of extinction in 100 years as 100%, given the island history, it is unlikely that its population size could have been much larger in the recent past. Using mitochondrial and microsatellite markers, we have found that this insular cavy presents an extremely reduced genetic diversity with an estimated historical and present effective population size matching its present census size, with no evidence of recent population reduction. Considering C. intermedia long divergence from its sister continental species, we concluded that it keeps this extremely reduced population size since at least the most recent separation of the island from the continent around 8,000 years ago. C. intermedia may therefore be the best and most extreme case so far of a mammal species that survived for thousands of years with an extremely reduced population size. This species then poses new challenges to understanding the role of population reduction and genetic diversity to species extinction. Finally, we emphasize the need for special care in the maintenance of the pristine conditions of C. intermedia’s habitat. / CAPÍTULO I:"Caracterização de 16 loci de microssatélites para os roedores sul-americanos Cavia magna e C. aperea" - Baseando-nos no recentemente publicado genoma de Cavia porcellus e em outros cinco loci já descritos para C. aperea, nós aqui apresentamos 16 loci de microssatélites empregáveis em C. magna e C. aperea. Os primers foram projetados para serem usáveis em um arranjo de fluorescência múltipla (multiplex). O número médio de alelos para cada locus foi de 7,4 e a média da heterozigosidade esperada foi de 0,67. A combinação de alguns ou todos estes marcadores pode possibilitar trabalhos em genética populacional, ecologia molecular e outros estudos evolutivos nas espécies aqui avaliadas. CAPÍTULO II:"Baixíssima diversidade genética do preá de Moleques do Sul (Cavia intermedia), o mamífero naturalmente mais raro do Mundo" - Ilhas têm chamado a atenção de biólogos evolucionistas há séculos pelos seus altos níveis de endemismos promovidos, tanto pelo isolamento, quanto pelo tamanho limitado a que estas populações estão sujeitas. Cavia intermedia é uma espécie recentemente descrita como endêmica de uma pequena ilha na costa meridional do Brasil que parece ser o mamífero naturalmente mais raro conhecido, apresentando uma população estável de aproximadamente 40 indivíduos. Apesar de algumas simulações demográficas terem estimado sua chance de extinção em 100 anos como 100%, dado a história da ilha, torna-se improvável que a população possa ter sido muito maior no passado recente. Utilizando marcadores mitocondriais e microssatélites, nós descobrimos que este preá insular apresenta uma diversidade genética extremamente reduzida com estimativas de tamanhos efetivos populacionais histórico e atual compatíveis com seu tamanho de censo atual, sem sinal de redução de tamanho populacional. Considerando a antiga divergência de C. intermedia em relação ao seu grupo-irmão continental, concluímos que a espécie mantém esse tamanho extremamente reduzido desde, pelo menos, a separação da ilha em relação ao continente há cerca de 8. 000 anos. Portanto, C. intermedia pode ser o melhor e mais extremo exemplo até agora conhecido de uma espécie de mamífero que sobreviveu por centenas de anos com um tamanho populacional tão extremamente reduzido. Essa espécie, então, estabelece novos desafios ao entendimento do papel da redução populacional e da diversidade genética na extinção de espécies. Finalmente, é importante enfatizar a necessidade de um cuidado especial na manutenção das boas condições do hábitat para a sobrevivência de C. intermedia em seu ambiente natural.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/urn:repox.ist.utl.pt:RI_PUC_RS:oai:meriva.pucrs.br:10923/5300 |
| Date | January 2009 |
| Creators | Kanitz, Ricardo |
| Contributors | Bonatto, Sandro Luis |
| Publisher | Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Porto Alegre |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da PUC_RS, instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, instacron:PUC_RS |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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