Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / O tÃxon genÃrico Burkholderia apresenta grande diversidade metabÃlica, possibilitando
que estas proteobactÃrias vivam numa variedade de habitats, dentre os quais
destacamos o solo, Ãgua (incluindo Ãgua do mar), plantas, fungos, animais e atà mesmo
seres humanos. Uma das aplicaÃÃes biotecnolÃgicas mais marcantes à a capacidade
de promover a biodegradaÃÃo de poluentes. Assim, este estudo visou a identificaÃÃo do
isolado de Burkholderia SMF 090, bem como a avaliaÃÃo do potencial na utilizaÃÃo da
gasolina como fonte de carbono e a identificaÃÃo de vias metabÃlicas possivelmente
envolvidas na degradaÃÃo dos componentes da gasolina atravÃs da realizaÃÃo de
anÃlises proteÃmicas. A identificaÃÃo do isolado SMF 090 e anÃlise da filogenia
molecular foi realizada pelo sequenciamento do gene 16S rRNA. Posteriormente, foram
realizadas anÃlises de filogenia molecular e reconstruÃÃo de Ãrvores filogenÃticas com
outras bactÃrias do gÃnero. Para a caracterizaÃÃo do perfil de crescimento do isolado
SMF 090 foram realizadas curvas de crescimento em meio nutritivo (TY), meio sem
fonte de carbono (BH), BH suplementado com gasolina comercial e BH suplementado
com D-glicose. O estudo das proteÃnas diferencialmente expressas ocorreu atravÃs de
eletroforese bidimensional, de espectrometria de massa e anÃlises de bioinfomÃtica.
AtravÃs da anÃlise do 16S rDNA, sugeriu-se que SMF 090 està relacionada
à Burkholderia sabiae Br3407 e ambos descendem de um ancestral comum recente. A
bactÃria estudada foi capaz de crescer em meio mineral contendo gasolina como Ãnica
fonte de carbono. Foi possÃvel observar proteÃnas diferencialmente expressas entre os
grupos testados, as quais podem estar associadas ao metabolismo de degradaÃÃo de
hidrocarbonetos. As anÃlises dos gÃis de 2DE e os dados de espectrometria de massas
permitiram a identificaÃÃo de vÃrias proteÃnas das vias de catabolismo dos
hidrocarbonetos aromÃticos monocÃclios e policÃclicos. Portanto, o estudo apresentou
informaÃÃes relevantes sobre o metabolismo de Burkholdeiras como potenciais
biodegradadoras de gasolina. / The generic taxon Burkholderia presents a high metabolic diversity that allows these
protobacteria live in a wide range of habitats, among these are the soil, water (including
sea water), plants, fungi, animals and even humans. A remarkable biotechnological
application is the capacity to promote the pollutants biodegradation. Thus, this study
aimed the identification of Burkhoderia SMF 090 isolate, as well the evaluation of its
potential on the utilization of gasoline as a carbon source and the identification of
metabolic pathways possibly involved in the degradation of gasoline on its components
through realization of proteomic analysis. The identification of the SMF 090 isolate and
the analysis of molecular phylogeny were carried out by 16S rRNA gene sequencing. In
addition, the molecular phylogeny was analyzed and phylogenetic trees were
reconstructed using other bacteria from the same genus. In order to characterize the
growth pattern of SMF 090, bacterial growth curves were assessed using the media TY
(a nutritive media), BH (a medium without carbon), BH plus commercial gasoline and
BH plus D-glucose. The study of differentially expressed proteins was performed using
bidimensional electrophoresis, mass spectrometry and bioinformatics analysis. After the
16S rRNA analysis was suggested that SMF 090 is related to Burkholderia
sabiae Br3407 and both descended from a recent common ancestral. The strain grown
in mineral media containing gasoline as the unique carbon source. Differentially
expressed proteins were observed between the tested groups and these proteins may be
associated to the metabolic degradation of hydrocarbons. The analysis of data provided
by 2DE electrophoresis and mass spectrometry allowed the identification of various
proteins related to the monocyclic and polycyclic aromatic hydrocarbons catabolism
pathway. Therefore, this study showed relevant results about the growth of
Burkholderia as a potential gasoline biodegradant.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.teses.ufc.br:6664 |
| Date | 29 May 2012 |
| Creators | Daniel de Brito |
| Contributors | Rodrigo Maranguape Silva da Cunha, Victor Alves Carneiro, Raquel Oliveira dos Santos Fontenelle |
| Publisher | Universidade Federal do CearÃ, Programa de PÃs-GraduaÃÃo em Biotecnologia (Campus da UFC em Sobral-CE), UFC, BR |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC, instname:Universidade Federal do Ceará, instacron:UFC |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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