Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Resumo: As características de qualidade de carne, por serem de difícil mensuração, raramente são contempladas em programas de melhoramento genético. Porém, é necessário conhecer sobre os genes e os mecanismos moleculares que controlam essas características, isso poderá auxiliar na avaliação de animais de forma precoce. Objetivo desse estudo foi identificar e analisar genes e isoformas de mRNA diferencialmente expressos no tecido do músculo Longissimus thoracis de bovinos da raça Nelore, fenotipicamente divergentes para características cor da carne, marmoreio e maciez da carne (avaliada através das metodologias de WBSF e MFI) usando dados de RNA-Seq. Além disso, esse estudo visa a identificação dos efeitos de variantes estruturais em “splice sites” de transcriptos diferencialmente expressos em animais fenotipicamente divergentes para as características de color e marmoreio da carne. Uma média de 37 mil transcritos foram detectados sendo expressos no músculo de bovinos Nelore. Foram identificados 40 e 28 isoformas de mRNA (p-valor < 0,001) diferencialmente expressas para os fenótipos de WBSF e MFI, respectivamente. Além disso, foram identificados sendo diferencialmente expressos os mRNAs [WBSF (SYNPO-201) e MFI (ANKRD23-202)], e entre outras isoformas de mRNA relacionadas a genes que afetam a velocidade de degradação das fibras musculares durante o processo de envelhecimento da carne, como e.g. [para WBSF (MYOT, CASQ1, TPM2, MB e SYNM) e para MFI (FGFRL1 e NEB)]. Na análise de enriquec... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The measurement of meat quality traits are costly, because of that it is rarely included in breeding programs. However, it is necessary to know about the genes and the molecular mechanisms that control these traits, this may help in the evaluation of animals at an early stage.Thus, the identification of mRNA isoforms and the associated splice variants affecting meat quality traits in Nellore cattle could allow to better understanding the genetic architecture of these complex traits. The objective of this study was to identify and analyze genes and mRNA isoforms differentially expressed in the Longissimus thoracis muscle tissue of Nellore cattle, phenotypically divergent for meat color, marbling and meat tenderness (evaluated using WBSF and MFI methodologies) traits, using RNA-Seq data. In addition, to identify structural variants affecting splice sites of differencially expressed mRNA isoforms for marbling and meat color traits. An average of 37 thousand transcripts were detected in the Nellore muscle transcriptomic analysis. A total of 40 and 28 mRNA isoforms (p-value |<| 0.001) were differentially expressed between divergent groups for WBSF and MFI phenotypes, respectively. The differentially expressed mRNA isoforms [WBSF(MYL1, MYL3, MYH1 and MYBPC2) and MFI (MYL6) traits], which are myosin encoders, was the family with most abundantly number of mRNA isoforms detected as diferencially expressed. In addition, we identified as DE [WBSF (SYNPO-201 isoform) and for MFI (ANKRD23... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
| Identifer | oai:union.ndltd.org:UNESP/oai:www.athena.biblioteca.unesp.br:UEP01-000931606 |
| Date | January 2020 |
| Creators | Muniz, Maria Malane Magalhães |
| Contributors | Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. |
| Publisher | Jaboticabal, |
| Source Sets | Universidade Estadual Paulista |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | text |
| Format | f. |
| Relation | Sistema requerido: Adobe Acrobat Reader |
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