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Estudos da estabilidade, flexibilidade e atividade enzimática da B-mananase da bactéria hipertermofílica Thermotoga petrophila

Orientador: Prof. Dr. Wanius José Garcia da Silva / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biotecnociência, 2014. / A proteina endo-B-1,4-mananase da bacteria Thermotoga petrophila (TpMan) e uma enzima hipertermoestavel que catalisa a hidrolise de ligacoes B-1,4-manosidicas em varios polissacarideos contendo manana. Um recente estudo mostrou que a enzima TpMan e composta de um dominio catalitico GH5 e um dominio de ligacao ao carboidrato CBM27 conectados atraves de um linker, entretanto, ate o momento, a estrutura tridimensional cristalografica nao foi determinada para a enzima completa. Pouco se sabe sobre a conformacao da enzima TpMan intacta como tambem o papel do comprimento e flexibilidade do linker sobre o arranjo espacial dos dominio constitutivos. Neste estudo, nos reportamos a primeira caracterizacao estrutural da enzima TpMan completa utilizando a tecnica de espalhamento de raios-X a baixos angulos (SAXS) combinada com a estrutura tridimensional dos dominios individuais para elucidar o modelo de baixa resolucao, as dimensoes globais, e a flexibilidade desta enzima modular em diferentes temperaturas. Nossos resultados sao consistentes com um linker que apresenta uma estrutura compacta e que ocupa um pequeno volume quando comparado com seu grande numero de residuos de aminoacidos (102 residuos de aminoacidos). Alem disso, a 20 oC os resultados sao consistentes com um modelo onde a enzima TpMan e um monomero composto de tres dominios e que apresenta nivel de flexibilidade molecular em solucao. Mesmo a enzima intacta apresentando algum grau de flexibilidade, existe uma conformacao preferivel, a qual pode ser descrita pelo procedimento de modelagem de corpo rigido. Finalmente, os resultados indicam que a enzima TpMan sofre uma transicao dependente da temperatura entre estados conformacionais de sua estrutura secundaria regular. Nossos resultados sugerem que o linker pode otimizar a geometria entre os outros dois dominios com respeito ao substrato a altas temperaturas. Os estudos apresentados aqui devem proporcionar uma base util para futuros estudos biofisicos da enzima TpMan intacta.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:BDTD:77289
Date January 2014
CreatorsSilva, Viviam Moura da
ContributorsSilva, Wanius José Garcia da, Puzer, Luciano, Muniz, João Renato Carvalho
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf, 79 f. : il.
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFABC, instname:Universidade Federal do ABC, instacron:UFABC
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
Relationhttp://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=77289&midiaext=70661, http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=77289&midiaext=70662, Cover: http://biblioteca.ufabc.edu.brphp/capa.php?obra=77289

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