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Dissertação Jessica Lais Almeida dos Santos _ PMBqBM-UFBA.pdf: 11654727 bytes, checksum: 40a04bbf070f4574fe0b83ce9f4ac22b (MD5) / FAPESB / O HTLV-1 (Human T-Cell Lymphotropic Virus) foi o primeiro retrovírus humano a ser
descrito. As principais complicações clínicas associadas ao HTLV-1 são: doenças
malignas como a ATLL; síndromes inflamatórias, como a TSP/HAM; e complicações
infecciosas, como a dermatite infecciosa. Estima-se que aproximadamente 15 a 20
milhões de pessoas estejam infectadas pelo HTLV em todo o mundo. Algumas áreas
são, conhecidamente, endêmicas para esta infecção, sendo elas: sudoeste do Japão,
África sub-Saara, regiões do Caribe, áreas localizadas no Irã e Melanésia. No Brasil,
existem cerca de dois milhões de portadores do vírus. Na Bahia, estimativas indicam
que a prevalência global da infecção pelo HTLV-1 na população geral de Salvador é
de 1,8%. No entanto, ainda existe uma escassez de informações sobre a história
evolutiva do HTLV-1 no Estado da Bahia, e a maioria dos dados sobre a epidemiologia
molecular do HTLV-1 dizem respeito à isolados virais originados da cidade de
Salvador, ou região metropolitana (RMS) e mais outras duas mesorregiões do estado,
regiões Sul (S) e Vale do São Francisco (VSF). Em outras quatro mesorregiões
nenhum outro isolado viral já foi identificado e caracterizado. Portanto, o principal
objetivo deste trabalho foi investigar a origem e a disseminação do HTLV-1 na Bahia.
Este estudo, de corte transversal, foi desenvolvido a partir de uma amostra de
conveniência, composta por 50 amostras de indivíduos, de ambos os sexos,
infectados pelo HTLV-1 que nasceram e residem no estado da Bahia, separadas por
mesorregiões. Outras sequências LTR do vírus já disponíveis no GenBank foram
utilizadas para, perfazer o maior número possível de mesorregiões a serem
investigadas. Deste modo, 78 sequências LTR do HTLV-1 foram analisadas neste
estudo. Inicialmente, o DNA genômico foi extraído utilizando kit de extração e
submetido à nested-PCR para a região LTR. Os produtos da PCR foram purificados e
sequenciados. Das 50 amostras selecionadas para a busca pelo HTLV-1, apenas foi
possível gerar 11 sequências LTR do HTLV-1, e portanto, foi possível identificar a
infecção em outras duas mesorregiões: nordeste (N) e centro-sul (CS). Os cálculos de
diversidade genética foram feitos utilizando o modelo de distância Tamura Nei, com
suporte estatístico. Três diferentes inferências filogenéticas foram realizadas: uma
análise de subtipagem das novas sequências LTR do HTLV-1, uma análise
filogenética apenas com sequências de isolados virais do Subtipo a, e uma última
inferência filogenética, apenas com sequências de isolados virais do Subtipo a
Subgrupo Transcontinental (A). Para essas inferências utilizamos de programas de
bioinformática que possibilitaram alinhamento, edição e análise das sequências
geradas, bem como inferir árvores filogenéticas e predizer a taxa evolutiva destes
isolados. Foi possível identificar que a mesorregião que apresenta maior diversidade
genética, entre suas sequências, foi a (CS), seguida da região N, enquanto as regiões
S e RMS apesentaram resultados semelhantes. A análise filogenética, para
subtipagem, das novas 11 sequências LTR do HTLV-1, geradas neste trabalho,
demonstrou que todas elas pertencem ao subgrupo Transcontinental (A), do subtipo
Cosmopolita (a). As sequências LTR do HTLV-1 originadas da mesorregião VSF
apresentaram diferentes características filogenéticas, e as sequências originadas de
casos de infecção RMS tiveram uma distribuição difusa no subgrupo Transcontinental,
formando grupamentos com sequências originadas de diferentes regiões do país. No
entanto, 32 (74,4%) sequências, se posicionaram em clados mais ancestrais do
subgrupo. Fenômeno semelhante foi observado com a distribuição das sequências
originadas de casos de infecção do Sul do estado. Também, a partir desta análise, é
possível observar que houve a formação de cluster único com as sequências do N e
CS (Boostrap entre 50% e 74%). Todas as sequências originadas do CS mostraram
proximidade filogenética com sequências do Sul do estado. O valor encontrado para a
taxa evolutiva foi de 1.0 x 10-4 substituição/sítio/ano (95% IC: 4.2752E-6, 2.7948E-4).
Por isso, as principais conclusões são: identificação de 11 novos isolados virais,
originados de casos de infecção pelo HTLV-1 em diferentes mesorregiões do Estado da Bahia; com a caracterização filogenética, percebemos que todos pertencem ao
subtipo a, subgrupo A; sendo possível identificação da presença do Subtipo
a/Subgrupo A nas mesorregiões N e CS; as sequências LTR do HTLV-1, originadas de
casos de infecção na mesorregião RMS, revelam características de ancestralidade
destas sequências em comparação com as de outras mesorregiões, sugerindo a
introdução do HTLV-1 a partir dessa mesorregião; As sequências LTR do HTLV-1,
originadas de casos de infecção na mesorregião S, apresentaram características
semelhantes as sequências da RMS, o que pode sugerir origem dessas sequências na
RMS, ou até introduções semelhantes nestas duas mesorregiões;- proximidade
filogenética das sequências LTR do HTLV-1, originadas de casos de infecção das
mesorregiões N, CS e S, sugere rotas migratórias populacionais entre elas.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:192.168.11:11:ri/23484 |
| Date | 29 April 2016 |
| Creators | Santos, Jéssica Laís dos |
| Contributors | Mascarenhas, Aline Cristina Andrade Mota Miranda, Nader, Helena, Franco, Glória Regina, Rego, Filipe Ferreira de almeida |
| Publisher | Instituto de Ciências da Saúde, Programa Multicêntrico de Pós-Graduação em Bioquímica e Biologia Molecular, PMBqBM, brasil |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFBA, instname:Universidade Federal da Bahia, instacron:UFBA |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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