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Previous issue date: 2011-05-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Knowledge of the native prokaryotes in hazardous locations favors the application of
biotechnology for bioremediation. Independent strategies for cultivation and
metagenomics contribute to further microbiological knowledge, enabling studies with
non-cultivable about the "native microbiological status and its potential role in
bioremediation, for example, of polycyclic aromatic hydrocarbons (HPA's).
Considering the biome mangrove interface fragile and critical bordering the ocean,
this study characterizes the native microbiota mangrove potential biodegradability of
HPA's using a biomarker for molecular detection and assessment of bacterial
diversity by PCR in areas under the influence of oil companies in the Basin
Petroleum Geology Potiguar (BPP). We chose PcaF, a metabolic enzyme, to be the
molecular biomarker in a PCR-DGGE detection of prokaryotes that degrade HPA s.
The PCR-DGGE fingerprints obtained from Paracuru-CE, Fortim-CE and Areia
Branca-RN samples revealed the occurrence of fluctuations of microbial communities
according to the sampling periods and in response to the impact of oil. In the analysis
of microbial communities interference of the oil industry, in Areia Branca-RN and
Paracuru-CE was observed that oil is a determinant of microbial diversity. Fortim-CE
probably has no direct influence with the oil activity. In order to obtain data for better
understanding the transport and biodegradation of HPA's, there were conducted in
silico studies with modeling and simulation from obtaining 3-D models of proteins
involved in the degradation of phenanthrene in the transport of HPA's and also
getting the 3-D model of the enzyme PcaF used as molecular marker in this study.
Were realized docking studies with substrates and products to a better understanding
about the transport mechanism and catalysis of HPA s / O conhecimento sobre os procariotos nativos em locais de risco favorece a aplica??o
de biotecnologias para biorremedia??o. Estrat?gias independentes de cultivo, como
metagen?mica, contribuem para aprofundar o conhecimento microbiol?gico,
possibilitando estudos com organismos n?o cultiv?veis acerca do status
microbiol?gico nativo e seu potencial papel na biodegrada??o de, por exemplo,
Hidrocarbonetos Arom?ticos Polic?clicos (HAP s). Considerando o bioma de mangue
uma interface fr?gil e cr?tica de fronteira com o oceano, este trabalho caracteriza a
microbiota nativa de mangue com potencial biodegradador de HAP s utilizando um
biomarcador molecular para detec??o e avalia??o da diversidade bacteriana em
?reas sob influ?ncia de ind?strias petrol?feras atrav?s da PCR-DGGE na Bacia
Petrol?fera Potiguar (BPP). Foi escolhido um biomarcador molecular metab?lico,
enzima PcaF, para detec??o de procariotos degradadores de HAP s. Com o
biomarcador, fingerprints foram obtidos de amostras de Paracuru-CE, Fortim-CE e
Areia Branca-RN, revelando a ocorr?ncia de flutua??es das comunidades
microbianas de acordo com os per?odos de amostragem e em resposta ao impacto
por petr?leo. Atrav?s da an?lise das comunidades microbianas frente ? interfer?ncia
da ind?stria do petr?leo, em Areia Branca-RN e Paracuru-CE foi observado que o
petr?leo ? determinante para a diversidade microbiana. Fortim-CE provavelmente
n?o tem influ?ncia direta da atividade petrol?fera. No intuito de obter dados para o
melhor entendimento do transporte e biodegrada??o de HAP s, foram desenvolvidos
estudos in silico de modelagem e simula??o computacional a partir da obten??o de
modelos 3-D de prote?nas envolvidas na degrada??o do fenantreno, no transporte de
HAP s e tamb?m a obten??o do modelo 3-D da enzima PcaF. Estudos de dockings
com substratos e produtos forneceram dados para o melhor entendimento sobre o
mecanismo de transporte e cat?lise de HAP s
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufrn.br:123456789/13068 |
| Date | 23 May 2011 |
| Creators | Sousa, Bruno Gomes de |
| Contributors | CPF:67196675487, http://lattes.cnpq.br/9579151361576173, Albuquerque, Eudenilson Lins de, CPF:05011124487, http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783172H5, Almeida, Paulo Fernando de, CPF:13121502549, http://lattes.cnpq.br/8972128111026703, Blaha, Carlos Alfredo Galindo, Fulco, Umberto Laino |
| Publisher | Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncias Biol?gicas, UFRN, BR, Biodiversidade; Biologia Estrutural e Funcional. |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFRN, instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte, instacron:UFRN |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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