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Previous issue date: 2011-01-27 / A natureza como fonte de inspira??o provou ter grande impacto ben?fico no desenvolvimento de novas metodologias computacionais. Neste cen?rio, an?lises de intera??es entre uma prote?na alvo e um ligante podem ser simuladas por algoritmos inspirados biologicamente (BIA). Neste trabalho, os algoritmos inspirados biologicamente, especialmente algoritmos evolutivos, s?o aplicados a simula??es de docking molecular, que podem ser usadas na busca de novos f?rmacos. Estes algoritmos de docking foram aplicados a sirtu?nas, que comp?em uma importante fam?lia de prote?nas - desacetilases dependentes de NAD - que regulam o silenciamento gen?tico, inibi??o transcricional, estabilidade cromoss?mica, ciclo de divis?o celular e apopt?tico e resposta c?lular a agentes causadores de danos no DNA. Essas prote?nas tem sido alvos moleculares emergentes no desenvolvimento farmac?utico de medicamentos para o tratamento de doen?as humanas. Em fun??o da import?ncia estrutural das prote?nas, neste trabalho foi realizada a modelagem por homologia molecular de SIRT1 humana, utilizando-se a estrutura cristalogr?fica de Sir2 de Thermotoga maritima como modelo. Al?m disso, foi aplicado o procedimento de virtual screening para a SIRT1 modelada contra duas bases de dados. Uma foi baseada em estruturas derivadas da nicotinamida e outra composta por mol?culas da Sigma-Aldrich. Com base nos resultados obtidos no virtual screening, foram utilizados os acoplamentos com valores mais baixos de energia livre de liga??o (Plant Score) para a sele??o das melhores mol?culas. Foi empregada a Similarity Ensemble Approach Tool (SEA), uma abordagem estrat?gica para analisar as rela??es entre as estruturas e a atividade farmacol?gica. Os resultados indicam que algumas mol?culas apresentaram alta afinidade com a SIRT1, sugerindo novos inibidores de SIRT1, e essas mol?culas mostram um elevado n?mero de refer?ncias de atividades farmacol?gicas. Nossos resultados sugerem novos compostos inibidores de SIRT1 que apresentam potencial aplica??o terap?utica
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:tede2.pucrs.br:tede/5387 |
| Date | 27 January 2011 |
| Creators | Heberl?, Graziela |
| Contributors | Azevedo Junior, Walter Filgueira de |
| Publisher | Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul, Programa de P?s-Gradua??o em Biologia Celular e Molecular, PUCRS, BR, Faculdade de Bioci?ncias |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS, instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, instacron:PUC_RS |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 8198246930096637360, 600, 600, 36528317262667714 |
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