Orientador: Sandra Aidar de Queiroz / Coorientador: Haroldo Henrique de Rezende Neves / Banca: Danisio Prado Munari / Banca: Lenira El Faro / Banca: Patrícia Tholon / Resumo: Características longitudinais são de grande importância para aprodução animal, no entanto, quando se trata de seleção genômica vários métodosestão sendo avaliados para características pontuais, como produção de leite emidades específicas ou produção total. Dessa forma, a aplicação destes métodos atrajetórias completas do fenótipo de interesse ao longo do tempo pode ser umaferramenta importante para a tomada de decisão do melhor momento para seleçãodos animais. No presente estudo foram utilizados dados de produção de leite,porcentagem de gordura, porcentagem de proteína e escore de células somáticas debovinos leiteiros da raça Holandesa em uma metodologia de dois estágios: i) osmodelos não lineares de Wood (1967), Cobby & Le Du (1978) e Wilmink (1987)foram ajustados aos dados de cada característica; ii) as estimativas de parâmetrosobtidas para as curvas individuais no modelo que proporcionou melhor ajuste aosdados (Wilmink) foram utilizadas como fenótipos nas análises genômicas. Além dosmodelos não lineares, também foi utilizado um modelo de regressão aleatória(RRM), considerando polinômios de Legendre quadráticos para a modelagem dosefeitos genético aditivo e de ambiente permanente. No segundo estágio foramtestados diferentes métodos para estimação dos valores genéticos genômicos(GEBV): RR-BLUP e LASSO, que consideraram como fenótipos as estimativas dosparâmetros obtidas anteriormente e os coeficientes de regressão estimados viaRRM. A cor... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Longitudinal traits are of great importance for animal production, however, when it comes to genomic selection several methods are being evaluated for specific traits, such as milk yield in specific ages or total yield. Thus, applying these methods to complete trajectories of the phenotype of interest over time can be an important tool for helping to decide the best time to select the animals. In this study, milk yield, fat and protein percentage, and somatic cell score data of dairy cattle were used, in a two-stage procedure: i) where the nonlinear Wood (1967), Cobby & Le Du (1978) and Wilmink (1987) were adjusted; ii) the model that provided the best fit was the Wilmink model (1987), whose parameter estimates were used as phenotypes later. In addition to the non-linear models, it was also used a random regression model, considering quadratic Legendre polynomials to model the additive genetic and permanent environment effects. In the second stage different methods for estimation of genomic breeding values (GEBV) were applied: RR-BLUP and LASSO, which considered as phenotypes the estimated parameters previously obtained and the random regression coefficients. The correspondence between phenotypes and GEBV was verified by through cross validation using the k-fold method. For all traits, the genomic prediction accuracies of Wilmink's model parameters were low when RR-BLUP was used. Furthermore, the accuracies for parameter c showed values close to zero for most traits. The pred... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
| Identifer | oai:union.ndltd.org:UNESP/oai:www.athena.biblioteca.unesp.br:UEP01-000872008 |
| Date | January 2016 |
| Creators | Scalez, Daiane Cristina Becker. |
| Contributors | Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. |
| Publisher | Jaboticabal, |
| Source Sets | Universidade Estadual Paulista |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | text |
| Format | xi, 52 p. |
| Relation | Sistema requerido: Adobe Acrobat Reader |
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