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Previous issue date: 2012-05-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The involvement of Clostridium estertheticum as agents of deterioration of chilled beef
packaged under vacuum from slaughterhouse brazilian, has been reported since 2007. Once
detected, and presents the main sources of contamination in slaughter establishments, there
was the need to advance the search for new knowledge about this Clostridia, however, the
classical microbiological methods for their detection are considered difficult to implement
because they require hard work and take a long time. PCR can be a quick and efficient
detection of clostridia incriminated in the deterioration of beef chilled vacuum packaged and
refrigerated environments slaughterhouses, without isolation of pure cultures. The objective of
this study was to develop a test for realtime PCR for detection of Clostridium estertheticum in
bovine meat and environments of slaughterhouse brazilian, as well as the molecular
identification of isolates of Clostridium estertheticum by means of AFLP and RFLP techniques -
PCR. The analytical results were compared with conventional PCR and confirmed by isolation.
The Real-Time PCR assay for detection of Clostridium estertheticum in bovine meat and
environments of slaughterhouse brazilian, was efficient. Evidence for the presence and
distribution of C. estertheticum the sources studied and the technique of RT-PCR provided the
highest percentage of positive samples from slaughterhouses that refrigerators Conventional
PCR, and this is confirmed by isolation, which has become an important alternative for the
detection of C. estertheticum in bovine meat and environments of slaughterhouse without
isolation. The isolates used showed general similarity of 42.4%, suggesting high genetic
diversity. In addition, the isolates obtained from samples of ambient and refrigerated meat
tufted not show significant similarity, greater than 80%, used with any typical strain. The
similarity found between the isolates may be indicative of possible similarity between those
from meats and puffed from between those environments and equipment. The study revealed
that additional steps necessary x for the characterization of Brazilian isolates, especially
sequencing of other regions of the DNA so as to determine their taxonomic position. / O envolvimento de Clostridium estertheticum como agente de deterioração de carnes bovinas
refrigeradas embaladas a vácuo provenientes de ambientes de frigoríficos no Brasil, vem
sendo relatado desde 2007. Uma vez detectados, bem como apontadas as principais fontes de
contaminação nos estabelecimentos de abate, surgiu à necessidade de avançar na busca de
novos conhecimentos sobre esses clostrídios. No entanto, os métodos microbiológicos
clássicos para sua detecção são considerados de difícil execução, pois exigem muito trabalho
e demandam muito tempo. A PCR pode ser uma alternativa rápida e eficiente para detecção
de clostrídios incriminados na deterioração de carnes bovinas refrigeradas embaladas a vácuo
e ambientes de matadouros-frigoríficos, sem a necessidade de isolamento em culturas puras.
Objetivou-se com o presente estudo desenvolver um ensaio de PCR em Tempo Real para
detecção de Clostridium estertheticum em carnes bovinas e superfícies diversas de
matadouros-frigoríficos brasileiros, assim como a identificação molecular de isolados de
Clostridium estertheticum, por meio das técnicas RFLP e AFLP – PCR. Os resultados analíticos
foram comparados com PCR Convencional e confirmados pelo isolamento. O ensaio PCR em
Tempo Real desenvolvido para detecção de Clostridium estertheticum em carnes bovinas e
superfícies diversas de matadouros-frigoríficos brasileiros, mostrou-se eficiente. Evidencia-se
a presença e disseminação de C. estertheticum nas fontes estudadas e a técnica de PCR em
Tempo Real proporcionou maior percentual de positividade para amostras de matadouros-
frigoríficos que a técnica de PCR Convencional, sendo este confirmado pelo isolamento, o que
demonstra ser uma alternativa importante na detecção de C. estertheticum de carnes bovinas
e superfícies diversas de matadouros-frigoríficos sem a necessidade de isolamento. Os
isolados utilizados revelaram similaridade geral de 42,4%, sugerindo alta diversidade
genética. Além viii disso, os isolados obtidos a partir de amostras de ambientes frigoríficos e
carnes tufadas não apresentaram similaridade significativa, maior que 80%, com nenhuma
cepa padrão utilizada. A similaridade encontrada entre os isolados pode ser indicativa de
possível semelhança entre aqueles provenientes de carnes tufadas e entre aqueles
provenientes de ambientes e equipamentos. O estudo mostrou serem necessárias etapas
complementares de caracterização dos isolados brasileiros, principalmente sequenciamento de
outras regiões do DNA para assim determinar sua posição taxonômica.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/6639 |
| Date | 09 May 2012 |
| Creators | Marra, Kelly Nobre |
| Contributors | Mesquita, Albenones Jose de, Mesquita, Albenones Jose de, André, Maria Claudia Dantas Porfírio Borges, Bataus, Luiz Artur Mendes, Mazzoni, Rolando Alfredo, Soares, Renata de Bastos Ascenço |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Ciência Animal (EVZ), UFG, Brasil, Escola de Veterinária e Zootecnia - EVZ (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 4581960685150189167, 600, 600, 600, 600, -6217552114249094582, -7636512811479495338, 2075167498588264571 |
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