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Escolha de descritores mínimos e estabelecimento de coleções nucleares em Capsicum spp. / Choice of minimum descriptors and establishment of Capsicum spp. core collections

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Previous issue date: 2008-03-05 / The plant genetic diversity is a valuable guarantee for possible adversities that
can be risking the survival of biological species. Brazil is one of the richest countries in
biodiversity of plants, with about 20% of all the existing biodiversity on Earth and around
19% of the agricultural lands in the world. Genetic resources are studied in well-defined
stages, such as collecting or introduction, multiplication, preservation/conservation,
evaluation/characterization and use. In Brazil, the Empresa Brasileira de Pesquisa
Agropecuária manages a national system of curatorship of genetic resources in which more
than 250 thousand samples of plants, animals and microorganisms are preserved. The
plants of the genus Capsicum (chilli and sweet peppers) are found throughout the national
territory, presenting countless kinds, with a great phenotypic and genotypic diversity.
Practically all the brazilian states have their own cultivars, but some of them, can be in
fact, considered a mere duplicate because, sometimes, the same cultivar is known under
different names. Thus, the morphological characterization is a task of great importance to
this plant genus so, it is possible to avoid the conservation and maintenance of accessions
of similar genomic patterns in germplasm banks. Embrapa Hortaliças has a collection of
germplasm of sweet and chilli peppers (Capsicum spp.), which amounts to about 2,500
accessions. These mainly belong to the species C. annuum, C. baccatum, C. chinense and
C. frutescens. The morphological characterization of most of these acessions (893) have
been carried out in recent years for a series of characters (descriptors) which allow the
investigation of the structure of their genetic variability and, from then the proposition of
strategies to handle the collection. Considering the need of studies aiming to know, value
and use the accessions of the Capsicum spp. Embrapa Hortaliças collection, this research
was developed with the objective of describing the accessions and the descriptors available
in this collection, in order to search for minimum descriptors and propose core collections
for this germplasm bank. The study demonstrated that it is possible to reduce around 50%
the number of descriptors currently used in the characterization of the accessions, without
significant harm to the representation of the genetic variability of the collection. The
factorial correspondence analysis showed to be appropriate for the selection of minimum
descriptors, as well as to the proposition of core collections from germplasm banks,
characterized, predominantly, by qualitative data. Variables related to the fruit showed
great variability in all the germplasm collection, demonstrating that these attributes are
important in the genetic discrimination among the accessions. The study also showed that
the geographical origin, regardless of the species, is directly associated with the genetic
divergence among the accessions in Capsicum spp. / A diversidade genética vegetal representa uma inestimável garantia às
possíveis adversidades que estejam colocando em risco a sobrevivência das espécies
biológicas. O Brasil é um dos países mais ricos em diversidade biológica de plantas,
possuindo cerca de 20% de toda a biodiversidade existente no planeta e cerca de 19% dos
solos agricultáveis do mundo. Os recursos genéticos são estudados em etapas bem
definidas, tais como, coleta ou introdução, multiplicação, preservação/conservação,
avaliação/caracterização e uso. No Brasil, a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária
gerencia um sistema nacional de curadoria de recursos genéticos, em que mais de 250 mil
amostras de plantas, animais e microrganismos são conservadas. As plantas do gênero
Capsicum (pimentas e pimentões) são encontradas em todo território nacional,
apresentando uma infinidade de formas, com grande diversidade fenotípica e genotípica.
Praticamente todos os estados brasileiros possuem cultivares próprias, porém, muito
provavelmente, parte do que se conhece pode tratar-se de mera duplicata, visto ocorrerem
diversas cultivares iguais com nomes diferentes. Dessa forma, a caracterização
morfológica constitui uma tarefa de grande importância para esse gênero vegetal, para
evitar a conservação e manutenção de acessos de formas genômicas semelhantes em
bancos de germoplasma. A Embrapa Hortaliças possui uma coleção de germoplasma de
pimentas e pimentões (Capsicum spp.) que conta, atualmente, com cerca de dois mil e
quinhentos acessos. Estes pertencem principalmente às espécies C. annuum, C. baccatum,
C. chinense e C. frutescens. A caracterização morfológica de grande parte desses acessos
(893 acessos) tem sido feita ao longo dos últimos anos, para uma série de caracteres
(descritores) que permitem investigar a estrutura de sua variabilidade genética e, a partir
daí, propor estratégias de manejo da coleção. Considerando-se a necessidade de estudos
visando conhecer, valorizar e utilizar os acessos da coleção de Capsicum spp. da Embrapa
Hortaliças, desenvolveu-se este trabalho com o objetivo de descrever os acessos e os
descritores disponíveis nessa coleção, de forma a buscar descritores mínimos e propor
coleções nucleares para o banco de germoplasma. O estudo demonstrou que é possível
reduzir, em cerca de 50%, o número de descritores atualmente utilizados na caracterização
dos acessos, sem prejuízo significativo à representação da variabilidade genética da
coleção. A análise fatorial de correspondência demonstrou ser apropriada para a seleção de
descritores mínimos, bem como para a proposição de coleções nucleares a partir de bancos
de germoplasma que se encontram caracterizados, predominantemente, com dados de
natureza qualitativa. As variáveis relacionadas ao fruto apresentaram grande variabilidade
em toda a coleção de germoplasma, demonstrando-se que esses atributos são importantes
na discriminação genética entre os acessos. O estudo revelou, também, que a origem
geográfica, independentemente da espécie, tem associação direta com a divergência
genética entre os acessos em Capsicum spp.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tde/435
Date05 March 2008
CreatorsSILVA, Waldir Camargos Júnior e
ContributorsDUARTE, João Batista
PublisherUniversidade Federal de Goiás, Doutorado em Agronomia, UFG, BR, Ciências Agrárias
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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