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Previous issue date: 2015-09-29 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O câncer gástrico é uma das principais causas de mortalidade por câncer no mundo. Seu
desenvolvimento está associado a fatores relacionados ao estilo de vida e a alterações
genéticas que podem modificar genes e/ou vias biossintéticas e metabólicas importantes para
a manutenção da integridade celular e tecidual. Pesquisas envolvendo câncer têm sido
realizadas com o intuito de identificar genes e mutações que possam ser utilizados como
marcadores genéticos e possíveis alvos terapêuticos. Estudos realizados com genes
codificantes de proteínas da via dos hormônios esteroides já identificaram polimorfismos
que podem estar relacionadas ao risco de câncer. Por tratar-se de uma via importante para
processos fisiológicos e patológicos, estudos de identificação de polimorfismos genéticos
nesta via, e na via de biossíntese do colesterol poderão contribuir com o entendimento da
carcinogênese gástrica. Diante disso, foi realizada uma análise bioinformática em
transcriptomas de tecidos gástricos com câncer e sem câncer, com o objetivo de identificar
SNPs em genes codificantes de enzimas das vias de biossíntese dos hormônios esteroides,
do colesterol e do receptor de progesterona que possam estar relacionadas ao
desenvolvimento do câncer gástrico. A análise foi realizada por meio da Plataforma Galaxy,
da ferramenta de alinhamento BOWTIE e do software de análise funcional de variações
PROVEAN Genome Variants. SNPs deletérios foram identificadas nos genes CYP51A1,
DHCR24 e SQLE da via de biossíntese de hormônios esteroides e nos genes CYP3A5,
HSD17B12, UGT1A1, UGT1A5, UGT1A6 e AKR1C3 da via biossintética do colesterol. O
gene CYP3A5 apresentou o maior número de SNPs deletérios. Estes resultados indicam uma
possível participação dos genes analisados nos mecanismos moleculares envolvido no
desenvolvimento do câncer gástrico. / Gastric cancer is one of the leading causes of cancer mortality in the world. Its development
is associated with factors related to lifestyle and genetic alterations that can modify genes
and important biosynthetic and metabolic pathways that help maintaining cellular and tissue
integrity. One of the main cancer research objectives is identify genes and mutations that
may be used as genetic markers and potential therapeutic targets. Studies with genes related
to the pathway of steroid hormones proteins have already identified polymorphisms that may
be related to the risk of cancer. Because it is an important route for physiological and
pathological processes identification of genetic polymorphisms in this and cholesterol
biosynthesis pathway may contribute to the understanding of gastric carcinogenesis.
Therefore, we performed a comprehensive bioinformatics analysis of transcriptome datasets
from gastric tissues with and without cancer, in order to identify SNPs in genes associated
to enzymes of biosynthetic pathways of steroid hormones, cholesterol and progesterone
receptor that may be related to gastric cancer. The analysis was performed using the Galaxy
Platform, the Bowtie alignment tool and the Provean software for functional analysis of
variations. Deleterious mutations have been identified in CYP51A1, DHCR24 and SQLE
genes in the steroid hormone biosynthesis pathway, and in CYP3A5, HSD17B12, UGT1A1,
UGT1A5, UGT1A6 and AKR1C3 genes in the cholesterol biosynthetic pathway. The
CYP3A5 gene had the highest number of deleterious SNPs. These results indicate a possible
participation of genes analyzed in the molecular mechanisms involved in the development
of gastric cancer.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpa.br:2011/7446 |
| Date | 29 September 2015 |
| Creators | SILVA, Viviane Santos da |
| Contributors | DARNET, Sylvain Henri |
| Publisher | Universidade Federal do Pará, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, UFPA, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPA, instname:Universidade Federal do Pará, instacron:UFPA |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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