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Previous issue date: 2012-07-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The genus Paracoccidioides comprises a complex of phylogenetic species of dimorphic
pathogenic fungi, the etiologic agents of paracoccidioidomycosis (PCM), a disease confined to
Latin America and of marked relevance in its endemic areas due to its high frequency and
severity. The members of the Paracoccidioides genus are distributed in distinct phylogenetic
species (S1, PS2, PS3 and 01-like) that potentially differ in their biochemical and molecular
characteristics. In this work, we performed the proteomic characterization of different members
of the genus Paracoccidioides. We compared the proteomic profiles of Pb01 (01-like), Pb2
(PS2), Pb339 (S1) and PbEPM83 (PS3) using 2D electrophoresis and mass spectrometry. The
proteins/isoforms were selected based on the staining intensity of the spots as determined by
image analysis. The proteins/isoforms were in-gel digested and identified by peptide mass
fingerprinting and ion fragmentation. A total of 714 spots were detected, of which 343 were
analyzed. From these spots, 301 represented differentially expressed proteins/isoforms among
the four analyzed isolates, as determined by ANOVA. After applying the FDR correction, a
total of 267 spots were determined to be differentially expressed. From the total, 193
proteins/isoforms were identified by PMF and confirmed by ion fragmentation. Comparing the
expression profiles of the isolates, the proteins/isoforms that were related to
glycolysis/gluconeogenesis and to alcohol fermentation were more abundant in Pb01 than in
other representatives of the genus Paracoccidioides, indicating a higher use of anaerobic
pathways for energy production. Those enzymes related to the oxidative stress response were
more abundant in Pb01, Pb2 and Pb339, indicating a better response to ROS in these members
of the Paracoccidioides complex. The enzymes of the pentose phosphate pathway were
abundant in Pb2. Antigenic proteins, such as GP43 and a 27-kDa antigenic protein, were less
abundant in Pb01 and Pb2. The proteomic profile indicates metabolic differences among the
analyzed members of the Paracoccidioides genus. / O gênero Paracoccidioides compreende um complexo de espécies filogenéticas do fungo
patogênico dimórfico, agente etiológico da paracoccidioidomicose (PCM), uma doença restrita à
América Latina e de relevância acentuada em suas áreas endêmicas, devido à sua alta frequência
e gravidade. Os membros do gênero Paracoccidioides são distribuídos em espécies filogenéticas
distintas (S1, PS2, PS3 e 01-like) que diferem potencialmente nas suas características
bioquímicas e moleculares. Neste trabalho, foi realizada a caracterização proteômica de
diferentes membros do gênero Paracoccidioides. Foram comparados os perfis proteômicos de
Pb01 (01-like), Pb2 (PS2), Pb339 (S1) e PbEPM83 (PS3) utilizando eletroforese 2D e
espectrometria de massa. As proteínas / isoformas foram selecionados com base na intensidade
de coloração dos spots conforme determinado por análise de imagem. As proteínas / isoformas
foram excisadas do gel, digeridas e identificadas por PMF (Peptide mass fingerprinting) e
fragmentação iônica. Um total de 714 spots foi detectado, 343 foram analisados. A partir destes
spots, 301 apresentaram-se diferencialmente expressos entre os quatro isolados analisados,
determinado por ANOVA. Depois de aplicar a correção FDR, um total de 267 spots foram
diferencialmente expressos. Do total, 193 / isoformas proteínas foram identificadas por PMF e
confirmadas por fragmentação iônica. Comparando-se os perfis de expressão dos isolados, as
proteínas / isoformas que foram relacionados para a glicólise / gliconeogênese e fermentação
alcoólica foram mais abundantes em Pb01 do que em outros representantes do gênero
Paracoccidioides, indicando uma maior utilização das vias anaeróbias para a produção de
energia. Enzimas relacionadas com a resposta ao estresse oxidativo foram mais abundantes em
Pb01, Pb2 e Pb339, indicando uma melhor resposta às ROS nestes membros do complexo
Paracoccidioides. As enzimas da via das pentoses foram abundantes em Pb2. Proteínas
antigênicas, tal como GP43 e uma proteína antigênica de 27 kDa, foram menos abundantes em
Pb01 e Pb2. O perfil proteômico indica diferenças metabólicas entre os membros analisados do
gênero Paracoccidioides.
Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/4568 |
Date | 31 July 2012 |
Creators | Pigosso, Laurine Lacerda |
Contributors | Soares, Célia Maria de Almeida, Parente, Ana Flávia Alves, Soares, Célia Maria de Almeida, Parente, Juliana Alves, Zancopé-Oliveira, Rosely Maria |
Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Biologia (ICB), UFG, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas - ICB (RG) |
Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
Language | Portuguese |
Detected Language | English |
Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Format | application/pdf |
Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
Relation | 6883982777473437920, 600, 600, 600, 600, -3872772117827373404, -1634559385931244697, -2555911436985713659 |
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