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Previous issue date: 2018-02-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Urinary tract infections (UTI) are the most prevalent bacterial infections and, in this context, E. coli is the primary an etiological agent. Virulence mechanisms participating in the process of colonization, invasion and tissue damage observed in the UTI. Phylogenetic analyses contribute to the knowledge about the ancestry of a pathogen, as well as allow for the differentiation of various microbial isolates according to the genetic similarity between them. Thus, this study aims to phylogenetic characterization of central UPEC strains isolated from patients in the municipality of Jataí-GO, as well as the comparison between the profile of virulence and antimicrobial resistance. With the completion of the study was possible to verify that one of the samples analysed, 74.42% presented to the virulence
gene iucD as well as 69.77% to 44.19% for fimH, papC 20.93% and hlyA. With the phylogenetic typing showed that 3.22% of the samples analysed are proving to be belonging to the groups A and D, 4.84% of the samples analysed, belong to the filogrupo B1, filogrupo B2, 61.29% 6.45% to filogrupo F, and 20.48% not classified in any of the filogrupos searched. Between-group comparisons showed that the isolates belonging to the filogrupo, presented 100% of amplification to iucD and 50% and fimH to papC, referring to group B1 presented 66.67% virulence gene amplification iucD and 33.33% hlyA, that the filogrupo B2 presented 63.16% of fimH, 68.42% amplification to iucD 36.84% to papC, 34.21% hlyA, and that in D, 50% was observed for fimH, papC amplification and iucD and finally filogrupo F 25% presented to fimH, papC hly and 50% and to iucD. As regards culture, the samples analysed presented, resistance to gentamicin (38%), cephalothin (38%), streptomycin (51%), ciprofloxacin (51%), Chloramphenicol (29%), ceftriaxone (22%), amikacin (31%), and tetracycline (40%) and 100% the samples demonstrated susceptibility to Imipenem. In short, except for the antibiotics gentamicin and ciprofloxacin, no increase of resistance of isolates analyzed and not that there was a pattern of resistance in UPEC according to filogrupos research. / As infecções do trato urinário (ITUs) são as infecções bacterianas mais prevalentes e, nesse contexto, Escherichia coli é o principal agente etiológico. Diversos mecanismos de virulência participam no processo de colonização, invasão e lesão tecidual observados nas ITUs. As análises filogenéticas contribuem para o conhecimento a respeito da ancestralidade de um patógeno, assim como permitem a diferenciação de diversos isolados microbianos de acordo com a similaridade genética entre eles. Assim, este estudo tem por objetivo central a caracterização filogenética de cepas UPEC isoladas de pacientes no município de Jataí-GO, bem como a comparação entre o perfil de virulência e resistência aos antimicrobianos. Com a realização do estudo foi possível verificar que dentre as amostras analisadas, 74,42% apresentaram amplificação para o gene de virulência iucD, bem como 69,77% para fimH, 44,19% para papC e 20,93% para hlyA. Com a tipagem filogenética observou-se que 3,22% das amostras analisadas demonstram ser pertencentes aos grupos A e D, 4,84% das amostras analisadas, pertencem ao filogrupo B1, 61,29% ao filogrupo B2, 6,45% ao filogrupo F, e 20,48% não se classificaram em nenhum dos filogrupos pesquisados. As comparações entre grupos demonstraram que os isolados pertencentes ao filogrupo A, apresentaram 100% de amplificação para fimH e iucD e 50% para papC, os referentes ao grupo B1 apresentaram 66,67% amplificação o gene de virulência iucD e 33,33% hlyA, que o filogrupo B2 apresentou 63,16% de amplificação para fimH, 68,42% para iucD, 36,84% para papC e 34,21% para hlyA, que em D, observou-se 50% de amplificação para fimH, papC e iucD e por fim filogrupo F apresentou 25% de amplificação para fimH, papC e hly e 50% para iucD. No que se refere ao antibiograma, as amostras analisadas apresentaram, resistência à gentamicina (38%), a cefalotina (38%), estreptomicina (51%), a ciprofloxacina (51%), a cloranfenicol (29%), a ceftriaxona (22%), a amicacina (31%) e tetraciclina (40%) e 100 % das amostras demostraram susceptibilidade ao Imipenem. Em resumo, exceto para os antibióticos gentamicina e ciprofloxacina, não houve aumento da resistência dos isolados analisados e não que houve um padrão de resistência em UPEC de acordo com os filogrupos pesquisa.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/8243 |
| Date | 19 February 2018 |
| Creators | Santos, Thaynara Gonzaga |
| Contributors | Santa-Rita, Ricardo Matos, Santa-Rita, Ricardo Matos, Braoios, Alexandre, Sobrinho Junior, Iderval |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Ciências Aplicadas a Saúde (RJ), UFG, Brasil, Regional Jataí (RJ) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -891722852459007405, 600, 600, 600, 600, -7730867143693479402, -6173167103754495199, 2075167498588264571 |
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