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Previous issue date: 2015-02-26 / Este estudo aborda aspectos moleculares e citogenéticos de Pitcairnia azouryi Martinelli &
Forzza, uma espécie endêmica de inselbergues da Floresta Atlântica através do estudo de
suas populações a respeito de sua diversidade genética, da quantidade de DNA nuclear e
do número de cromossomos. Amostras de folhas de 13-15 indivíduos foram coletadas em
cinco populações entre o sul do ES e norte do RJ, em um total de 66 indivíduos. Nove
marcadores microssatélites (SSRs) foram utilizados em PCRs. Os polimorfismos genéticos
foram identificados a partir de polimorfismos entre indivíduos amostrados, detectadas por
eletroforese em gel de acrilamida 8%. Os parâmetros de diversidade e estrutura genética de
populações foram calculados utilizando o software Fstat, PopGene e Structure. A análise
de citometria de fluxo foi efetuada utilizando amostras de folhas obtidas a partir de cinco
indivíduos adultos de cinco populações distintas. Análises citogenéticas foram realizadas
com raízes obtidas a partir de sementes germinadas coletadas em duas populações. Os nove
primers SSR produziram produtos de amplificação satisfatórios, e provou ser polimórfico.
O número de alelos por loco variou entre dois e oito. Os valores do índice de diversidade
genética (Gd) e do índice de fixação (Fis) em populações variou 0,459-0,578 e 0,047-0,208,
respectivamente. Os valores observados Fst mostrou que 81,20% da variação genética total
é encontrada dentro das populações e a ocorrência de fluxo gênico (Nm) 1,073 (número
médio de migrantes por geração). Análise Bayesiana indicaram que um modelo de k = 3
populações é capaz de apreender melhor a variação nos dados sobre a estrutura genética. A
análise de citometria de fluxo mostrou que o teor de DNA nuclear é 2C = 1,16 picogramas
em todas as populações analisadas, exceto na população PLC, no qual foi medida duas
vezes do teor de DNA (2C = 2,32 picogramas). A análise citogenética revelou indivíduos
com 2n = 50 cromossomos em ES e indivíduos 2n = 100 cromossomos no RJ A alta
variação do índice de fixação adicionado à grande variação genética dentro e entre as
populações sugerem a ocorrência do efeito fundador na dispersão de novos indivíduos em
novos locais, seguido de deriva genética, especialmente para a população de Campos dos
Goytacazes. As características encontradas em relação ao conteúdo de DNA nuclear e do
número cromossômico podem ser dever ao isolamento geográfico de PLC, ou às
características ambientais locais ou à diferentes processos evolutivos. / This study reports the discovery of new areas of occurrence of Pitcairnia azouryi
Martinelli & Forzza, and the study of their populations regarding its genetic diversity, the
amount of nuclear DNA and the chromosome number. Seven new areas of occurrence for
this species were located between the northern state of Rio de Janeiro (RJ) and the
southern state of Espírito Santo (ES), and georeferenced to the other studies. Leaf
samples of 13-15 individuals were collected in five of these populations (PLB - Pedra
Lisa Burarama, PA - Pedra das Andorinhas, PTI - Pedra Três Irmãs, PPC - Pedra Parada
Cristal and PLC - Pedra Lisa Campos), totaling 66 individuals. Nine SSR markers were
used in PCRs. Genetic polymorphisms were identified from polymorphism between
individuals sampled, detected by electrophoresis on acrylamide gel 8%. The parameters
of diversity and genetic structure of populations were calculated using the software Fstat,
PopGene and Structure. The flow cytometry analysis was performed using leaf samples
obtained from adult individuals of five populations. Cytogenetic analyzes were performed
with roots obtained from germinated seeds collected in two populations. The nine SSR
primers produced satisfactory amplification products, and proved to be polymorphic. The
number of alleles per loci ranged between two and eight. The values of gene diversity
index (Gd) and the fixation index (Fis) in populations ranged from 0.459 to 0.578 and
0.047 to 0.208, respectively. The Fst values observed showed that 81.20% of the total
genetic variation is found within populations and the occurrence of gene flow (Nm) 1,073
(average number of migrants per generation). Bayesian analysis indicated that a model of
k = 3 populations is able to better capture the variation in the data on the genetic
structure. The high variation of fixation index added to the large genetic variation within
and moderate genetic differentiation among populations suggest the occurrence of the
founder effect in the dispersion of new individuals in new locations, followed by genetic
drift, especially for the population of Campos dos Goytacazes. The flow cytometry
analysis showed that the nuclear DNA content is 2C = 1.16 picograms in all populations
analyzed, except on PLC population, in which was measured twice of DNA content (2C=
2.32 picograms). This result was explained by cytogenetic analysis which revealed
individuals with 2n = 50 chromosomes in ES and individuals 2n = 100 chromosomes in
RJ. This result may be due for PLC's geographical isolation, environmental
characteristics of different evolutionary processes.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:dspace2.ufes.br:10/5126 |
| Date | 26 February 2015 |
| Creators | Manhães, Vitor da Cunha |
| Contributors | Miranda, Fábio Demolinari de, Garbin, Mário Luís, Carrijo, Tatiana Tavares |
| Publisher | Universidade Federal do Espírito Santo, Mestrado em Genética e Melhoramento, Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento, UFES, BR |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | text |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFES, instname:Universidade Federal do Espírito Santo, instacron:UFES |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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