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Previous issue date: 2015-02-25 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Natural environment has suffered high accumulations of pollutants which not only
affect the soil, groundwater, rivers, lakes, water courses and air, but also human
health due to forming of unhealthy conditions. Among the many effects when crude
oil and derivates spill, the released xenobiotics to environment make worrisome
because of its enviromental persistence and harmful effects to life. One solution to
this problem is bioremediation, a tool that uses microorganisms for biochemical
degradation of these compounds, transforming them into less or non-toxic
substances. In this context, a previous study isolated the bacteria A. junii SB132 from
macrophytes of the Negro River bank located by the port of Manaus and confirmed
its identity by morphology and 16S gene sequencing. Biodegradation tests performed
in laboratory have confirmed the ability of this bacteria to degrade oil and diesel fuel.
Therefore, the aim of this research was to identify proteins of A. junii SB132 related
in degradation pathways of the crude oil and diesel fuel. Ribosomal proteins,
phenotypic, bacterial morphology, sensitivity profile to antibiotics and plasmid profile
analysis were obtained. Proteins extracted from bacterial grown in crude oil, diesel
fuel and yeast extract, 1.3% respectively, were used for 2-DE gels and similar and
differential proteins were identified by using mass spectrometry and database at
NCBI. The identity bacterial was confirmed and the plasmid profile was taken. These
data revealed that the bacteria studied in this research is the really A. junii specie
and that this had plasmids with size ranging 94.000pb to 5.000pb. Identified putative
proteins were related to cellular processes, such as degradation of xenobiotic
compounds, biosynthesis of molecules, DNA repair and protection, membrane
transport proteins, cell signaling and transcription factors. / O ambiente natural vem sofrendo elevados acúmulos de poluentes os quais não
somente prejudicam o solo, as águas subterrâneas, rios, lagos, vias pluviais e o ar,
mas também a saúde humana em virtude da formação de condições insalubres.
Dentre os muitos efeitos, os derramamentos de petróleo e derivados acumulam no
ambiente compostos xenobióticos que se tornam preocupantes pela sua persistência
e seus efeitos nocivos à vida. Uma das soluções para esse problema é a
biorremediação, uma ferramenta que utiliza microrganismos para degradação
bioquímica desses compostos, transformando-os em substâncias menos, ou não
tóxicas. Neste contexto, um estudo prévio isolou a bactéria A. junii SB132 de
macrófitas do Rio Negro no porto de Manaus e confirmou sua identificação por
morfologia e sequenciamento do gene 16S. Testes de biodegradação realizados em
laboratório confirmaram a capacidade de esta bactéria degradar petróleo e diesel. O
objetivo desta pesquisa foi identificar proteínas de A. junii SB132 envolvidas com
vias de degradação de petróleo e diesel. Foram feitas análises de identificação
usando proteínas ribossomais e análises fenotípicas como morfologia da bacteriana,
perfil de sensibilidade a antibióticos e perfil plasmidial. A partir das proteínas
extraídas de bactérias cultivadas em petróleo bruto 1,3%, diesel 1,3% e extrato de
levedura 1,3%, foram feitos géis 2-DE e proteínas de spots similares e diferenciais
foram identificadas por análise em espectrometria de massa e banco de dados no
NCBI. A confirmação da identidade bacteriana foi obtida, bem como o perfil
plasmidial. Estes dados revelaram que de fato a bactéria estudada nesta pesquisa é
a A. junii e que esta possui plasmídeos com tamanhos de variam de 94.000pb a
5.000pb. As proteínas putativas identificadas estavam relacionadas a processos
celulares como degradação de compostos xenobióticos, biossíntese de moléculas,
reparo e proteção do DNA, proteínas transportadoras de membrana, sinalização
celular e fatores de transcrição.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:http://localhost:tede/5065 |
| Date | 25 February 2015 |
| Creators | Souza Neto, Júlio Nino de |
| Contributors | Andrade, Edmar Vaz de |
| Publisher | Universidade Federal do Amazonas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, UFAM, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM, instname:Universidade Federal do Amazonas, instacron:UFAM |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 32215883775770440, 600, 500, 1984485651082134923 |
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