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Previous issue date: 2016-08-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The yellow-spotted river turtle Podocnemis unifilis is the most widely distributed freshwater river
turtle and is found in a diversity of habitats. Associated with natural characteristics of turtles, human
action causes a sharp population declines, causing species like P. unifilis to be on the list of animals
to be protected by IBAMA. Many aspects of the biology of the species can be determined using
molecular genetic analyses. In some rivers of the Amazon basin, rapids and waterfalls limit gene
flow of various aquatic and semiaquatic groups, so it is necessary to study the patterns of species
especially in places that are targeted for hydroelectric projects. Thus, we analyzed the D-loop region
of mitochondrial DNA of 300 adult turtles of different rivers in the Brazilian Amazon basin,
determining organizational patterns of genetic variability and evaluating the interference of natural
barriers. We measured the number of haplotypes, the number of segregating sites, haplotype
diversity, nucleotide diversity, neutrality tests, AMOVA and we constructed a haplotype network. To
measure levels of structuring among populations, we inferred the Ф ST fixation index, the number of
biological groups in the sample, level of gene flow, Mantel's test, and finally, we estimated natural
barriers to gene flow using Barrier program. We found high genetic diversity and restricted gene
flow with high levels of structuring between locations. The differences within the Madeira, Tapajós,
Trombetas, Xingu and Tocantins-Araguaia rivers are possibly caused by waterfalls and rapids. We
define 8 different Management Units: Barreirinha, middle Trombetas River, Tapajós River, upstream
of the waterfall of Volta Grande do Xingu River, downstream of the waterfall of Volta Grande do
Xingu River, Guaporé River, Tocantins-Araguaia basin and a group of the Amazon floodplain area
with other populations. We indicate the use of our data in making decisions to release young in
participatory management of project sites of Amazon turtles, in decisions on implementation of
construction projects and inspection and seizure of illegal trade in turtles, and underline the
importance of studying the species through other molecular markers to assist in the conservation of
turtles. / O tracajá (Podocnemis unifilis) é a tartaruga de água doce com maior distribuição, podendo ser
encontrada nos mais diversos habitats. Associada a características naturais dos quelônios, a ação
humana provoca um declínio acentuado das populações, fazendo com que espécies como P.unifilis
esteja na lista de animais a serem protegidos pelo IBAMA. Muitos aspectos da biologia das espécies
podem ser determinados usando análises genéticas. Em alguns rios da bacia Amazônica,
corredeiras e cachoeiras limitam o fluxo gênico de vários grupos aquáticos e semiaquáticos,
portanto, é necessário estudar os padrões genéticos das espécies principalmente em locais que
são visados para empreendimentos hidrelétricos. Com isso, analisamos a região D-Loop do DNA
mitocondrial de 300 tracajás adultos de diferentes rios da drenagem da Amazônia brasileira,
determinando padrões de organização da variabilidade genética e avaliando a interferência de
barreiras naturais aos indivíduos. Foram medidos o número de haplótipos, número de sítios
segregantes, a diversidade haplotípica, diversidade nucleotídicas, testes de neutralidade, AMOVA
e foi construída uma rede de haplótipos. Para medir os níveis de estruturação entre as localidades
inferimos o índice de fixação ФST, a quantidade de grupos biológicos na amostra, nível de fluxo
genético, teste de Mantel, e por fim, foram estimadas as barreiras naturais ao fluxo gênico usando
o programa Barrier. Encontramos altos valores de diversidade genética e um fluxo genético restrito
com altos níveis de estruturação entre as localidades. As diferenças dentro dos rios Madeira,
Tapajós, Trombetas, Xingu e Tocantins-Araguaia possivelmente são causadas pelas cachoeiras e
corredeiras. Sugerimos 8 Unidades de Manejo distintas: Barreirinha, Médio rio Trombetas, rio
Tapajós, montante da cachoeira da Volta Grande do Xingu, jusante da cachoeira da Volta Grande
do Xingu, rio Guaporé, bacia Tocantins-Araguaia e um grupo da região da várzea amazônica com
as demais localidades. Indicamos a utilização de nossos dados na tomada de decisão de locais de
soltura de filhotes em projetos de manejo participativo de quelônios amazônicos, nas decisões sobre
implantação de empreendimentos e na fiscalização e apreensão do comércio ilegal de tracajás,
além de ressaltar a importância do estudo da espécie através de outros marcadores moleculares, a
fim de auxiliar na conservação dos tracajás
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:http://localhost:tede/5634 |
| Date | 26 August 2016 |
| Creators | Agostini, Maria Augusta Paes |
| Contributors | Farias, Izeni Pires, Oliveira Junior, Waldesse Piragé de |
| Publisher | Universidade Federal do Amazonas, Programa de Pós-graduação em Diversidade Biológica, UFAM, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM, instname:Universidade Federal do Amazonas, instacron:UFAM |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 3867939861266202433, 600, 500, 1984485651082134923 |
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