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Previous issue date: 2016-09-30 / CAPES / Dengue is an infectious disease caused by an arbovirus which is transmitted by the mosquito Aedes aegypti. In Brazil, due to the rainy season in the summer, it is common the occurrence of epidemics. In recent years, the number of cases in the country is growing at an alarming rate, increasing not only the number of records, but also the number of deaths. Until this date, there is no antiviral treatment that is effective, only measures for the sweetening of symptoms. The viral enzyme RNA-dependent RNA polymerase (NS5) plays a role of great importance for viral replication. This project aims to rational planning of C-nucleosides 1,2,3 triazole derivatives of ribavirin (1 - [(2R, 3R, 4S, 5R) -3,4-dihydroxy-5- (hydroxymethyl) dioxolan-2- yl] -1H-1,2,4-triazole-3-carboxamide), a potent inhibitor of the replication of the flavivirus, proposed inhibitors. To achieve this, was used molecular docking methods and semi-empirical calculations for the study of interactions between the derivatives proposed by our group and the two enzymes. The realization of this study will serve as basis for the synthesis of most promising products, which in the future may lead to the creation of a prototype of an antiviral drug that contributes to the treatment of all forms of dengue, as well as in preventing it. / A dengue ? uma doen?a infecciosa causada por um arbov?rus, que ? transmitido pelo mosquito Aedes aegypti. No Brasil, devido aos per?odos chuvosos no ver?o, ? comum a ocorr?ncia de epidemias. Nos ?ltimos anos, o n?mero de casos da doen?a no pa?s vem crescendo de forma alarmante, aumentando n?o s? a quantidade de registros, mas tamb?m o n?mero de ?bitos. At? o momento, n?o h? tratamento antiviral que seja efetivo, apenas medidas para a ameniza??o dos sintomas. A enzima viral RNA polimerase dependente de RNA (NS5) exerce papel de grande import?ncia para a replica??o viral. Este projeto tem como objetivo o planejamento racional de C-nucleos?deos 1,2,3 triaz?licos derivados da ribavirina (1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihidroxi- 5-(hidroximetil)oxolan-2-il]-1H-1,2,4-triazol-3-carboxamida), um potente inibidor da replica??o dos flaviv?rus, inibidores propostos das enzimas NS5. Para se alcan?ar este objetivo, ser?o usados os m?todos de docking molecular e de c?lculos semi-emp?ricos para o estudo das intera??es entre os derivados propostos por nosso grupo e as duas enzimas. A realiza??o desse estudo servir? como base para a s?ntese dos derivados mais promissores, que futuramente poder?o levar ? cria??o de um prot?tipo de um f?rmaco antiviral, que contribua para o tratamento de todas as formas da dengue, assim como na preven??o da mesma.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:localhost:jspui/2160 |
| Date | 30 September 2016 |
| Creators | OLANDA, Carolina Gurski |
| Contributors | Sant'Anna, Carlos Mauricio Rabello de, K?mmerle, Arthur Eugen, Sant'Anna, Carlos Mauricio Rabello de, Souza, Aline Viana Coelho de, Concei??o Junior, Duilio Tadeu da, Barbosa, Maria Let?cia de Castro, Silva, Robson Mariano da |
| Publisher | Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Programa de P?s-Gradua??o em Modelagem Matem?tica e Computacional, UFRRJ, Brasil, Instituto de Ci?ncias Exatas |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRRJ, instname:Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, instacron:UFRRJ |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | BARBOSA, J. C., SANTOS, M. A. Modelagem Matem?tica, Perspectivas e Discuss?es. 2003. BASTOS, E. A. Otimiza??o de Se??es Retangulares de Concreto Armado Submetidas ? FlexoCompress?o Obl?qua Utilizando Algoritmos Gen?ticos. Tese de Mestrado, UFRJ, Rio de Janeiro, 2014. BENARROCH, D., EGLOFF, M.-P., MULARD, L., GUERREIRO, C., ROMETTE, J.-L., CANARD, B. J. Biol. Chem. 279, 35638-35643. 2004. CARTER, J. B; SAUNDERS, V. Virology ? Principles and Applications. ISBN: 978-0-470-02386-0. 2007. CARVALHO, I., PUPO, M. T., BORGES, A. D. L., BERNARDES, L. S. C. Quim. Nova, Vol. 26, No. 3, 428-438, 2003. DEL CISTIA, C. N. Modelagem molecular aplicada ao estudo de rea??es de inibi??o enzim?tica com aplica??o potencial no controle de Leishmania amazonensis. Tese de Doutorado. UFRRJ. 2010. EGLOFF, M. P., BENARROCH, D., SELISKO, B., ROMETTE, J. L., CANARD, B. EMBO J. 21, 2757?2768. 2002. GRANDI, TARCIANA. Estudos de Polimorfismos Gen?ticos e resposta ao Tratamento com Interferon-Alfa/Ribavirina em Pacientes com o V?rus da Hepatite C. p. 19-22, 2012. GUEX, N. AND PEITSCH, M.C. SWISS-MODEL and the Swiss-PdbViewer: An environment for comparative protein modeling. Electrophoresis 18, 2714-2723. 1997. HHMI. Dispon?vel em: <http://www.hhmi.org/biointeractive/dengue-virus-life-cycle>. 2016. KAISER, Gabriele, SRIRAMAN, Bharath. A global survey of international perspectives on modelling in mathematics education. ZDM Vol. 38(3). 2006. LOPES, SUSANA I. O. Caracteriza??o cl?nica e virol?gica do efeito do interferon peguilado e ribavirina no retratamento da hepatite C cr?nica em doentes r?cidivantes e n?o respondedores a tratamentos pr?vios de combina??o. Porto, Portugal. p. 36-38, 2004. MARQUES, M. L., BOTTI, S. O que ? e para que serve a Teoria dos Funcionais de Densidade? Dispon?vel em: <http://nautilus.fis.uc.pt/gazeta/revistas/29_4/vol29_4_Art02.pdf>. 2007. MICHAELIS. Dispon?vel em: < http://michaelis.uol.com.br/>. 2016. PORTAL DA SA?DE. Dispon?vel em <http://portalsaude.saude.gov.br/index.php/oministerio/principal/secretarias/svs/dengue>. 2016. MOPAC2016, James J. P. Stewart, Stewart Computational Chemistry, Colorado Springs, CO, USA. 2016. NELSON, D.L. & COX, M.M. Lehninger?s Principles of Biochemistry. 4?ed. New York: W. ISBN-10: 0716743396. ISBN-13: 978-0716743392. 2004. OLIVEIRA, Andr? S., SILVA, Milene L. da, OLIVEIRA, Ana Fl?via C. S. SILVA, Cynthia C. da, TEIXEIRA, R?bson R., DE PAULA, S?rgio O. NS3 and NS5 Proteins: Important Targets for Anti-Dengue Drug Design. J. Braz. Chem. Soc., Vol. 25, No. 10, 1759-1769, 2014. OLIVIERI, B. P. Otimiza??o do Projeto de Pontes Protendidas Pr?-Moldadas pelo M?todo dos Algoritmos Gen?ticos. Tese de Mestrado, UFRJ, Rio de Janeiro, 2004. PASCOAL, F. S., Sociedade Artificial Fight4life: Aut?mato Celular Modelando Vida Artificial. P. 11-37. 2005. PROSISE, G. L., WU, J., LUECKE, H. PDB ID: 1ME8. Journal: J.Biol.Chem. 277: 50654-50659. 2002. PDB ID: 1ME8. RITA, Mariane R., Otimiza??o da Fase Construtiva de Estruturas de Concreto Massa em Ambiente Paralelo. 2015. ROSA, T. O., LUZ, H. S. Conceitos B?sicos de Algoritmos Gen?ticos: Teoria e Pr?tica. In: XI Encontro de Estudantes de Inform?tica do Tocantins, 2009, Palmas. Anais do XI Encontro de Estudantes de Inform?tica do Tocantins. Palmas: Centro Universit?rio Luterano de Palmas, 2009. p. 27-37. SANT?ANNA, C. M. R., Gloss?rio De Termos Usados No Planejamento De F?rmacos (Recomenda??es Da Iupac Para 1997). Quim. Nova, Vol. 25, No. 3, 505-512, 2002. SANT?ANNA, C. M. R., M?todos de modelagem molecular para estudo e planejamento de compostos bioativos: Uma introdu??o. Rev. Virtual Quim., 2009, 1 (1), 49?57. Data de publica??o na Web: 2 de Fevereiro de 2009. SCILAB ENTERPRISES. Dispon?vel em: <http://www.scilab.org/>. 2015. SHATKIN, A. J. Capping of eucaryotic mRNAs. Cell, v. 9, n. 4, p. 645-653, 1976. STEWART, James J. P., Optimization of parameters for semiempirical methods V: Modification of NDDO approximations and application to 70 elements. Journal of Molecular Modeling. Volume 13, Issue 12, pp 1173-1213. 2007. STEWART, James J. P., Optimization of parameters for semiempirical methods VI: more modifications to the NDDO approximations and re-optimization of parameters. Journal of Molecular Modeling. Volume 19, Issue 1, pp 01-32. 2013. THE MATHWORKS, INC. Dispon?vel em: <https://www.mathworks.com/?requestedDomain=www.mathworks.com>. 1994-2016. TORTORA, G. J FUNKE, B. R; CASE, C. L. Microbiologia. 10? Ed. p. 367-395, 2010. University, USA, 1995. WAVEFUNCTION, INC. Dispon?vel em < https://www.wavefun.com/>. 2016. WORLD HEALTH ORGANIZATION ? WHO (2012). Dengue e Dengue hemorr?gico. Nota descritiva, n. 117. Dispon?vel em: <www.who.int/mediacentre/factsheets/fs117/es/>.2016. |
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