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Previous issue date: 2014-06-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Neotropical cichlids are a diverse group, which comprises about 60 genera and at least
1300 species are recognized. They are distributed in Central and South America, Texas, West
Indies, Africa, Madagascar, Syria, Israel, Iran, Sri Lanka, southern coast of India. The
diversity found in the Cichlid family covers the most different morphological and ecological
aspects that facilitate the adaptation of this fish family. In addition, evidence based on
molecular data showed that most of the diversification of the Neotropical fish fauna occurred
recently. These features make it difficult to understand the taxonomy and identification of this
fauna, becoming a major challenge for molecular tools. In this context, this study aimed to
test the effectiveness of DNA barcode methodology (COI gene) to identify and delineate the
diverse ictiofauna of freshwater cichlids in the Neotropics. For this purpose, 59 species of
Amazon basin fish were analyzed, being sampled by up to five specimens, morphologically
identified beforehand, and 147 DNA barcode sequences obtained. Morphological data were
combined with the molecular where only nine species showed agreement in both methods of
identification. Of the 45 species analyzed, 40 (88.8%) were correctly identified by the barcode
sequencing. The main values of intraspecific and interspecific genetic divergence by K2P in
molecular clusters were 0% and 55%. Seven cryptic species (15.5%) as well as seven
complexes of species (15.5%) were verified and approximately five species (11.2%) showed
absence of mutual monophyly. This study is the first to analyze a large number of freshwater
fish species in South America, including a large number of closely related species. The results
confirmed the effectiveness of barcode to signal cryptic species and species complexes, which
have recently undergone a process of irradiation, in addition to discriminate most species
analyzed. The results also revealed genetic differences suggesting reproductive isolation and
cryptic speciation in seven species. Finally, the results will contribute significantly for the
Life Barcode International Project, and for the FISH-BOL campaign providing sequences of
barcodes on the identification of these species by specialists and non-specialists, as well as
allowing them to be available for use in other applications. / Os ciclídeos neotropicais constituem um grupo variado, no qual compreendem cerca de 60
gêneros e pelo menos 1300 espécies são reconhecidas. São distribuídas na América Central e
do Sul, Texas, Índias Ocidentais, África, Madagascar, Síria, Israel, Irã, Sri Lanka, litoral do
sul da Índia. A diversidade encontrada na família Cichlidae abrange os mais diferentes
aspectos morfológicos e ecológicos, que facilitam na adaptação dos peixes desta família.
Além disso, evidências com base nos dados moleculares mostraram que a maior parte da
diversificação da ictiofauna Neotropical ocorreu recentemente. Estas características tornam
difícil a compreensão da taxonomia e identificação dessa fauna, tornando um grande desafio
para as ferramentas moleculares. Neste contexto, o presente estudo teve como objetivo testar a
eficácia da metodologia do código de barras de DNA (gene COI) para identificar e delimitar a
ictiofauna diversificada de ciclídeos em água doce da região Neotropical. Para esta finalidade,
foram analisadas 59 espécies de peixes na bacia Amazônica, sendo amostrado por até cinco
espécimes, identificadas a priori morfologicamente, e obtidas 147 sequências de código de
barras de DNA. Foram combinados os dados morfológicos com os moleculares, onde apenas
nove espécies apresentaram concordância em ambos os métodos de identificação. Das 45
espécies analisadas, 40 (88,8%) foram corretamente identificadas pelas sequências de códigos
de barras. Os principais valores de divergência genética intraespecífica e interespecífica pelo
K2P nos agrupamentos moleculares foram 0% e 55%. E verificou-se sete espécies crípticas
(15,5%), sete complexos de espécies (15,5%) e aproximadamente cinco espécies (1 1,2%)
mostraram ausência de monofilia recíproca. Este estudo é o primeiro analisar um grande
número de espécies de peixes de água doce da região Neotropical, incluindo um grande
número de espécies estreitamente relacionadas. Os resultados confirmaram a eficácia do
código de barras para sinalizar espécies crípticas e complexos de espécies, que passaram
recentemente por um processo de irradiação, além de discriminar a maioria das espécies
analisadas. Os resultados também revelaram divergências genéticas sugestivas de isolamento
reprodutivo e especiação críptica em sete espécies. Enfim, os resultados obtidos contribuirão
significamente para o projeto Internacional do Código de Barras da Vida, e para a campanha
FISH-BOL fornecendo as sequências de código de barras para uso na identificação dessas
espécies por especialistas e não-especialistas, e permitindo-lhes estar disponível para uso em
outras aplicações.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:localhost:tede/2297 |
| Date | 30 June 2014 |
| Creators | Carvalho, Ana Paula Costa de |
| Contributors | Hrbek, Tomas |
| Publisher | Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva (GCBEv), INPA, Brasil, Coordenação de Pós Graduação (COPG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do INPA, instname:Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, instacron:INPA |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -5829914500254207356, 600, 600, 600, 3806999977129213183, 2075167498588264571 |
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