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Previous issue date: 2016-05-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Malaria is a parasitic disease caused by protozoa of the genus Plasmodium. In 2014
was registered 214 million new cases in worldwide with approximately 480,000
deaths. Brazil is responsible for about half of malaria cases that occur in America,
where the main etiological agent is P. vivax. The absence of effective vaccines against
malaria parasites is a serious obstacle to controlling the disease. In this context, this
study aimed to identify peptides that may be candidates for the development of a
vaccine against P. vivax through a immunoinformatics strategy called the Reverse
Vaccinology (RV). Primarily, we track the P. falciparum proteome in search of
proteins that presented predicted epitopes and were orthologs between species P. vivax
and the species of malaria rodents, P. yoelli. The similarity between proteins and
epitopes of the three species was quantified for excluding those that exhibited low
similarity. Among this proteins, we sought in the literature which had been extensively
studied and / or whether they had been vaccine candidates in previous research. For
proteins that had been little studied or not evaluated, the prediction of B and T
lymphocytes epitopes. Were thus identified 357 proteins of P. falciparum with
predicted epitopes, among which 270 have orthologs in P. vivax and P. yoelli. Of these,
fifty proteins were found to be highly similar between the three species under study,
and 12 had little or no previous study. These 12 proteins were examined to
Immunology Epitope Database program (IEDB) in order to implement the prediction
of epitopes. Through a combinatorial analysis of the different immunoinformatics
prediction methods, 7 proteins were selected as vaccine candidates, based on their
function and / or location, such as export protein (EXP1), proteins expressed on the
surface of the membrane (SERA) or transmembrane domain (MAEBL), or participate
in processes essential for the survival of the parasite (CLAG). These proteins may be
evaluated in the future biological assay constituents such as antigens in a vaccine
against P. vivax parasite. / A malária é uma doença parasitária causada por protozoários do gênero Plasmodium.
Em 2014 foram registrados 214 milhões de novos casos mundiais com
aproximadamente 480.000 óbitos. O Brasil é responsável por cerca de metade dos
casos de malária que ocorrem nas Américas, onde o principal agente etiológico é P.
vivax. A ausência de vacinas eficazes contra parasitos de malária representa um sério
obstáculo ao controle da doença. Nesse contexto, o presente trabalho identificou
peptídeos que possam ser candidatos ao desenvolvimento de uma vacina contra P.
vivax, através de uma estratégia de imunoinformática denominada de Vacinologia
Reversa (VR). Primariamente, rastreamos o proteoma de P. falciparum em busca de
proteínas que apresentassem epítopos preditos e fossem ortólogas entre as espécies P.
vivax e a espécie de malária de roedores P. yoelli. A similaridade entre as proteínas e
os epítopos das três espécies foi quantificada, visando excluir aquelas que exibissem
baixa similaridade. Entre as proteínas restantes, buscamos na literatura quais já haviam
sido extensivamente estudadas e/ou se já haviam sido candidatas vacinais em
pesquisas anteriores. Para as proteínas que haviam sido pouco estudadas ou não
avaliadas, foi realizada a predição de epítopos de linfócitos B e T. Foram assim
identificadas 357 proteínas de P. falciparum com epítopos previstos, entre as quais,
270 possuíam ortólogos em P. vivax e P. yoelli. Destas, cinquenta proteínas revelaram
ser altamente similares entre as três espécies em estudo, e 12 tinham poucos ou
nenhum estudo anterior. Essas 12 proteínas foram submetidas ao programa Imunology
Epitope Database (IEDB) no intuito de realizar a previsão de epítopos. Através de uma
análise combinatória entre os diferentes métodos imunoinformáticos de previsão, 7
proteínas foram selecionadas como candidatas vacinais, com base em suas funções
e/ou localização, como a proteína exportada (EXP1), proteínas expressas na superfície
da membrana (SERA) ou com domínio transmembrana (MAEBL), ou ainda
participam de processos essenciais para a sobrevivência do parasito (CLAG). Estas
proteínas poderão ser avaliadas no futuro em ensaios biológicos como antígenos
constituintes de uma vacina contra o parasito P. vivax.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/6577 |
| Date | 16 May 2016 |
| Creators | Tavares, Taizy Leda |
| Contributors | Cravo, Pedro Vitor Lemos, Cravo, Pedro Vitor Lemos, Silva, Lourival Almeida, Fernandes, Éverton Kort Kamp |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular, UFG, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas - ICB (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 7015780075895009588, 600, 600, 600, 600, -3872772117827373404, -3439178843068202161, 2075167498588264571 |
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