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Previous issue date: 2015-03-27 / Sclerotinia sclerotiorum is a phytopathogenic fungus that infects more than 400 plant
species, including common bean. Genetic variability studies in connection with
phenotypic traits of agronomic interest are important to drive the control strategies
against this pathogen. The aims of this study were: to evaluate the genetic variability,
fungicide sensitivity, aggressiveness and to determine the proportion of MAT (Mating
Type) alleles of 79 isolates of S. sclerotiorum distributed in four populations from
common bean. Two populations represented a single sampling location in two
different times (2000 and 2013 growing seasons). To evaluate the fungicide
sensitivity a cell viability test based on the alamarBlue dye using mycelial growth was
standardized. Dose-response curves for fluazinam, procymidone and benomyl were
estimated using this test and were compared with dose-response curves estimated
by the mycelial growth inhibition on PDA plate and the FRAC (Fungicide Resistance
Action Committee) protocol. Despite the differences to assess the fungicide
sensitivity between the three methods, the dose-response curves showed similar
trends for the three fungicides. The fungicide sensitivity assessment at the four
populations showed low sensitivity to benomyl in the Planaltina population.
Furthermore, this population presented a principally clonal population structure, with
a haplotype represented by 18 out of 20 isolates. Significant population differentiation
in all pairwise comparisons of phi, except the comparison between EV_2013-NH,
was detected. Five genetically homogeneous groups were inferred by the DAPC
analysis. No group was conformed by isolates from the four populations. Only two
haplotypes between the two populations from the same sampling location were
shared. The hypothesis of random mating was rejected at the four populations;
however this hypothesis was not rejected at the two major populations inferred by the
DAPC analysis. The screening of mating type locus showed a dominance of Inv+
isolates and a high proportion of Inv+/Inv- isolates (presumable heterokaryons). / Sclerotinia sclerotiorum é um fungo fitopatogênico capaz de colonizar mais de 400
hospedeiras, sendo o agente causal do mofo branco no feijoeiro. Estudos de
variabilidade genética associados a características fenotípicas de interesse
agronômico, como a sensibilidade a fungicidas, oferecem informações importantes
para direcionar estratégias de controle sobre este patógeno. Os objetivos deste
trabalho foram avaliar a variabilidade genética, sensibilidade a fungicidas e
agressividade de 79 isolados de S. sclerotiorum distribuídos em quatro populações
procedentes de culturas de feijoeiro em pivô central. Duas destas populações
representaram um único local de coleta em duas épocas diferentes (2000 e 2013).
Para avaliar a sensibilidade a fungicidas foi padronizado um teste de viabilidade
celular baseado no corante alamarBlue® sobre o crescimento micelial em
microplaca de 96 poços. Curvas de dose-resposta para os fungicidas fluazinam,
procimidona e benomyl, usando um isolado de S. sclerotiorum, foram estimadas com
este método, e comparadas com curvas de dose-resposta obtidas com os métodos
de inibição do crescimento em placa e o proposto pelo Fungicide Resistance Action
Committee (FRAC). Apesar das diferentes abordagens as curvas dose-resposta
mostraram tendências semelhantes para os três fungicidas. A avaliação da
sensibilidade a fungicidas nas quatro populações indicou uma alta insensibilidade ao
benomyl na população de Planaltina. Por outro lado, a estrutura populacional foi
principalmente clonal com um haplótipo representado por 18 dos 20 isolados desta
população. Diferenciação populacional significativa foi detectada em todas as
comparações par a par do phi, com a exceção da comparação EV-2013-NH. A
analise DAPC identificou cinco grupos geneticamente homogêneos. Nenhum dos
grupos esteve constituído por isolados das quatro populações. Só dois haplótipos
foram compartilhados pelas populações EV_2000 e EV_2013. A hipótese de
acasalamento aleatório foi rejeitada nas quatro populações, no entanto não foi
rejeitada nas duas maiores populações sugeridas pelo DAPC. O screening do
Mating type locus (MAT) mostrou uma prevalência de isolados Inv+ e uma alta
proporção de isolados Inv+/Inv-
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/7818 |
| Date | 27 March 2015 |
| Creators | Arboleda, William Andrés López |
| Contributors | Silva, Silva Petrofeza da |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Biologia (ICB), UFG, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas - ICB (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 6883982777473437920, 600, 600, 600, -3872772117827373404, -2321034096481322512 |
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