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Análise in silico e de expressão da família gênica Ethylene Response Factors (ERF) no gênero Malus. / In silico and expression analysis of the Ethylene Response Factors (ERF) gene family in the genus Malus.

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Previous issue date: 2010-02-26 / Regulatory molecules, such as transcription factors, have been thoroughly
investigated, especially in hormone-mediated responses that involve gene expression
modulation. Frequently, the main determinant of gene expression is its transcriptional rate.
Thus, molecular mechanisms underlying transcription regulation have become an
important topic in genetic studies of ethylene signaling. The present work aimed to
investigate the ERF (Ethylene Response Factor) family employing bioinformatic tools,
integrating publicly available datasets from the model species Arabidopsis thaliana and
phylogenetic analyses to help elucidating the biological roles of the family in apple. The
preliminary survey of the ERF sequences in Malus has provided basic information to be
incorporated in further studies of the functional role of ERFs in this perennial species.
Expression analyses of MdERF1 and MdERF in apple fruits suggest that other factors,
besides ethylene, are involved in their transcriptional regulation in Malus. The second
chapter reports the investigation of the transcriptional profiling of those ERF genes in
response to pathogen attack, using a biological assay of in vitro propagated plants
inoculated with the fungus Venturia inaequalis (apple scab disease). The study has
provided evidences of the involvement of MdERF1 in eliciting the plant response; whereas,
MdERF2 does not appear to be participate in the pathogenesis. / Moléculas que participam dos processos regulatórios, como os fatores de
transcrição, têm recebido atenção especial, pois uma das principais ações dos estímulos
hormonais é a modulação da expressão gênica. Como a taxa de transcrição de um gene
é o maior determinante da sua expressão, os mecanismos moleculares pelos quais a
transcrição gênica é regulada têm se tornado um dos tópicos principais de estudos em
genética molecular envolvendo o hormônio etileno. O objetivo deste trabalho foi realizar
análises de bioinformática para a família ERF (Ethylene Response Factors), integrar
bases de dados existentes na internet no modelo Arabidopsis, bem como análise
filogenética que permitam avaliar os papéis dos diferentes membros da família. Este
levantamento preliminar das seqüências ERF em Malus forneceu informação básica para
estudos posteriores mais aprofundados, com relação aos mecanismos moleculares da
família nesta importante cultura perene. A análise da expressão de MdERF1 e MdERF2
em frutos de maçã indica que outros fatores além do etileno estão envolvidos na
regulação da transcrição dos ERF em Malus. O segundo capítulo refere-se à resposta dos
ERF frente ao ataque de patógenos. Para isso, foram infectadas plantas de macieira
provenientes de cutivo in vitro com o fungo Venturia inaequalis (sarna da maçã). As
evidências desses estudos sugerem o envolvimento do gene MdERF1 no processo de
patogênese, enquanto que o gene MdERF2 parece não estar envolvido no processo.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpel.edu.br:123456789/1340
Date26 February 2010
CreatorsCero, Joceani Dal
ContributorsCPF:60546786049, http://lattes.cnpq.br/0720377129835798, Rombaldi, César Valmor, Girardi, César Luis
PublisherUniversidade Federal de Pelotas, Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia Agroindustrial, UFPel, BR, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFPEL, instname:Universidade Federal de Pelotas, instacron:UFPEL
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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